Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SUP1

Protein Details
Accession A0A397SUP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
867-889DTASEREKKKEFKRNQEGFRESEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSSVSDSDSDFKQLEIQRESSNEISETIAGLLEQLSNNLYQYDIHVRYIQTLRQAALYDELKEAREMMHSIFPLSEEMWHEWIEDESRIASTKEEKQRVIQLYSKAVQDYLSINLWKEYTSYMVQEYKNGLNKMELDINESECIVTLDQVRKIFDEANRETCYYITGSHQIWDAYRDFEVEILESSPRDEQKNRVRNMYESRLKIPHATVDKTFSDYSSFITKYYNFIYENVMIETNKYVSETKNKYYERDRYESALTESGNALDNFMNYIEFEKKQKKPVVNAIRTLYERAIANYYLDNTLWENYMLFLIDKYLVDKKVSISTLIKTAERSVRNCYWSGDLWSHYIRILEKNFSSPEEVANIYERALSTGMLKNNIDDLIKVIISNVDYERRKILAYKGPISQENGTILVNFLEGGIKMVKESFQAGDFYYRLEKYLIEIETSIKNLPKARQVWDELSRNHRNESEFWIRYADWEKTVGNLENARKIYKQASQQNTDWPERIFDAWEQFEHQCGTVDNLELSIIFIKKQMVIVAQRRERAALKEVQYSQSERLSQISPAMQVDGGNESLETINYISSEQYSETKKRKPEEDEQQMEGLPATKRNRAQQFEKPKRDREFATVVVANLPLDVKEGELKNIFHECGKIKEIRFLVDTVNAQKTAYVEFNEKESVPAALTKDKKRIGDQEISVYKISERILYVTNFPSSVDIKELFKKYGEIISVRSPNPKYRKKGVFCYVEFKERNSAQAALEMDGRELEPGKKINVMISNPLLKKDRSPPIQTEVYIRNLPSRVDRDELKSLFQTYGPVTHVRIPMTADNKCRGFAFVEFENKEHAKASLALNSTEFKGCILNVILSEINRNHNQKEDTASEREKKKEFKRNQEGFRESEKRSKTVTFTNLPKDITEENIRSMLAQIFKDETISKITMSHDRNVYVEFEHIEDAGKAVLHFNKYKLNNTIISAVVRSDLPSTLTELAVQREGKPAKMTMIPRRLVVPSSKLGIKRKHEVGSKSDQRPLLGIGKSSSSKEEQLVDDNQDVEMKNKEISKKSNNDFRDIFYNASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.37
4 0.37
5 0.39
6 0.44
7 0.38
8 0.36
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.2
13 0.19
14 0.14
15 0.12
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.13
29 0.22
30 0.23
31 0.25
32 0.28
33 0.28
34 0.34
35 0.38
36 0.36
37 0.34
38 0.35
39 0.33
40 0.32
41 0.32
42 0.27
43 0.3
44 0.29
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.23
49 0.23
50 0.22
51 0.16
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.2
56 0.19
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.19
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.18
69 0.2
70 0.19
71 0.16
72 0.14
73 0.12
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.19
79 0.28
80 0.37
81 0.43
82 0.44
83 0.47
84 0.56
85 0.58
86 0.58
87 0.54
88 0.48
89 0.49
90 0.5
91 0.47
92 0.39
93 0.34
94 0.29
95 0.25
96 0.22
97 0.18
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.19
110 0.25
111 0.25
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.38
116 0.37
117 0.34
118 0.31
119 0.32
120 0.32
121 0.34
122 0.27
123 0.25
124 0.26
125 0.27
126 0.24
127 0.23
128 0.19
129 0.14
130 0.15
131 0.1
132 0.1
133 0.14
134 0.18
135 0.22
136 0.24
137 0.25
138 0.25
139 0.27
140 0.3
141 0.28
142 0.32
143 0.33
144 0.37
145 0.39
146 0.39
147 0.37
148 0.32
149 0.31
150 0.23
151 0.2
152 0.17
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.21
160 0.19
161 0.16
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.11
173 0.14
174 0.17
175 0.21
176 0.23
177 0.31
178 0.41
179 0.51
180 0.52
181 0.56
182 0.55
183 0.57
184 0.63
185 0.64
186 0.61
187 0.55
188 0.57
189 0.53
190 0.52
191 0.48
192 0.41
193 0.39
194 0.36
195 0.36
196 0.32
197 0.34
198 0.34
199 0.35
200 0.33
201 0.26
202 0.24
203 0.21
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.18
208 0.21
209 0.21
210 0.21
211 0.23
212 0.25
213 0.2
214 0.21
215 0.25
216 0.23
217 0.24
218 0.22
219 0.21
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.24
229 0.29
230 0.32
231 0.41
232 0.42
233 0.45
234 0.52
235 0.58
236 0.56
237 0.56
238 0.54
239 0.48
240 0.49
241 0.46
242 0.41
243 0.34
244 0.27
245 0.22
246 0.2
247 0.17
248 0.18
249 0.15
250 0.14
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.07
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.2
261 0.28
262 0.32
263 0.41
264 0.47
265 0.5
266 0.53
267 0.63
268 0.67
269 0.63
270 0.64
271 0.59
272 0.56
273 0.52
274 0.47
275 0.37
276 0.28
277 0.24
278 0.2
279 0.2
280 0.16
281 0.16
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.2
310 0.2
311 0.24
312 0.25
313 0.24
314 0.19
315 0.23
316 0.27
317 0.3
318 0.3
319 0.33
320 0.36
321 0.38
322 0.38
323 0.35
324 0.31
325 0.28
326 0.3
327 0.25
328 0.21
329 0.22
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.18
334 0.16
335 0.19
336 0.2
337 0.21
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.24
342 0.25
343 0.2
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.14
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.17
363 0.18
364 0.15
365 0.1
366 0.11
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.1
374 0.09
375 0.15
376 0.16
377 0.17
378 0.19
379 0.19
380 0.19
381 0.2
382 0.25
383 0.25
384 0.29
385 0.31
386 0.33
387 0.35
388 0.35
389 0.37
390 0.32
391 0.26
392 0.22
393 0.19
394 0.15
395 0.13
396 0.12
397 0.09
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.16
425 0.15
426 0.12
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.11
433 0.13
434 0.16
435 0.18
436 0.23
437 0.25
438 0.28
439 0.31
440 0.33
441 0.36
442 0.39
443 0.43
444 0.38
445 0.44
446 0.47
447 0.43
448 0.42
449 0.39
450 0.35
451 0.31
452 0.36
453 0.36
454 0.3
455 0.3
456 0.3
457 0.27
458 0.27
459 0.29
460 0.22
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.16
466 0.15
467 0.13
468 0.16
469 0.17
470 0.2
471 0.21
472 0.21
473 0.19
474 0.21
475 0.22
476 0.23
477 0.3
478 0.33
479 0.38
480 0.42
481 0.42
482 0.47
483 0.49
484 0.45
485 0.38
486 0.3
487 0.25
488 0.21
489 0.2
490 0.15
491 0.11
492 0.13
493 0.12
494 0.12
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.13
499 0.12
500 0.09
501 0.09
502 0.11
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.09
519 0.14
520 0.2
521 0.26
522 0.29
523 0.3
524 0.3
525 0.31
526 0.31
527 0.28
528 0.26
529 0.24
530 0.23
531 0.26
532 0.27
533 0.28
534 0.28
535 0.27
536 0.25
537 0.22
538 0.21
539 0.16
540 0.17
541 0.15
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.09
568 0.13
569 0.2
570 0.25
571 0.3
572 0.35
573 0.38
574 0.44
575 0.47
576 0.52
577 0.56
578 0.61
579 0.59
580 0.56
581 0.52
582 0.46
583 0.4
584 0.31
585 0.23
586 0.13
587 0.15
588 0.16
589 0.2
590 0.22
591 0.3
592 0.37
593 0.4
594 0.45
595 0.49
596 0.58
597 0.64
598 0.73
599 0.7
600 0.71
601 0.71
602 0.69
603 0.62
604 0.56
605 0.5
606 0.41
607 0.39
608 0.32
609 0.27
610 0.24
611 0.22
612 0.16
613 0.11
614 0.1
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.09
620 0.09
621 0.11
622 0.13
623 0.14
624 0.15
625 0.17
626 0.17
627 0.13
628 0.16
629 0.15
630 0.17
631 0.2
632 0.22
633 0.21
634 0.26
635 0.26
636 0.25
637 0.25
638 0.23
639 0.21
640 0.19
641 0.2
642 0.18
643 0.19
644 0.17
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.12
651 0.13
652 0.13
653 0.15
654 0.16
655 0.16
656 0.14
657 0.13
658 0.12
659 0.1
660 0.11
661 0.11
662 0.16
663 0.22
664 0.26
665 0.32
666 0.36
667 0.37
668 0.39
669 0.45
670 0.44
671 0.45
672 0.43
673 0.44
674 0.42
675 0.42
676 0.38
677 0.31
678 0.25
679 0.21
680 0.2
681 0.13
682 0.12
683 0.11
684 0.14
685 0.15
686 0.18
687 0.17
688 0.17
689 0.15
690 0.15
691 0.16
692 0.14
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.15
697 0.21
698 0.23
699 0.22
700 0.21
701 0.22
702 0.2
703 0.22
704 0.21
705 0.16
706 0.17
707 0.23
708 0.27
709 0.27
710 0.32
711 0.32
712 0.38
713 0.47
714 0.53
715 0.54
716 0.58
717 0.67
718 0.66
719 0.73
720 0.73
721 0.72
722 0.65
723 0.66
724 0.59
725 0.58
726 0.53
727 0.45
728 0.44
729 0.36
730 0.36
731 0.31
732 0.3
733 0.21
734 0.24
735 0.24
736 0.17
737 0.19
738 0.16
739 0.14
740 0.13
741 0.12
742 0.09
743 0.1
744 0.1
745 0.11
746 0.12
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.18
751 0.22
752 0.22
753 0.23
754 0.25
755 0.32
756 0.3
757 0.33
758 0.33
759 0.28
760 0.32
761 0.36
762 0.42
763 0.41
764 0.46
765 0.46
766 0.5
767 0.53
768 0.49
769 0.45
770 0.4
771 0.38
772 0.35
773 0.31
774 0.29
775 0.27
776 0.27
777 0.28
778 0.29
779 0.27
780 0.29
781 0.31
782 0.32
783 0.39
784 0.39
785 0.35
786 0.33
787 0.31
788 0.29
789 0.26
790 0.23
791 0.16
792 0.18
793 0.17
794 0.17
795 0.18
796 0.23
797 0.25
798 0.23
799 0.23
800 0.23
801 0.27
802 0.31
803 0.33
804 0.32
805 0.35
806 0.35
807 0.35
808 0.32
809 0.28
810 0.25
811 0.22
812 0.23
813 0.21
814 0.29
815 0.29
816 0.29
817 0.33
818 0.31
819 0.3
820 0.26
821 0.22
822 0.16
823 0.18
824 0.2
825 0.2
826 0.21
827 0.21
828 0.21
829 0.22
830 0.22
831 0.2
832 0.18
833 0.13
834 0.12
835 0.11
836 0.13
837 0.13
838 0.11
839 0.1
840 0.13
841 0.14
842 0.13
843 0.17
844 0.17
845 0.21
846 0.27
847 0.3
848 0.29
849 0.34
850 0.36
851 0.34
852 0.38
853 0.37
854 0.36
855 0.4
856 0.45
857 0.46
858 0.51
859 0.54
860 0.55
861 0.6
862 0.64
863 0.68
864 0.72
865 0.75
866 0.8
867 0.84
868 0.86
869 0.87
870 0.81
871 0.75
872 0.75
873 0.7
874 0.63
875 0.62
876 0.56
877 0.49
878 0.49
879 0.48
880 0.42
881 0.43
882 0.47
883 0.47
884 0.5
885 0.54
886 0.54
887 0.51
888 0.47
889 0.43
890 0.37
891 0.35
892 0.35
893 0.29
894 0.27
895 0.28
896 0.27
897 0.24
898 0.25
899 0.23
900 0.2
901 0.18
902 0.18
903 0.19
904 0.19
905 0.21
906 0.2
907 0.17
908 0.19
909 0.19
910 0.17
911 0.17
912 0.21
913 0.27
914 0.3
915 0.35
916 0.33
917 0.33
918 0.34
919 0.33
920 0.32
921 0.24
922 0.23
923 0.18
924 0.16
925 0.15
926 0.14
927 0.13
928 0.12
929 0.11
930 0.1
931 0.09
932 0.08
933 0.11
934 0.15
935 0.19
936 0.22
937 0.24
938 0.32
939 0.35
940 0.41
941 0.42
942 0.43
943 0.41
944 0.41
945 0.41
946 0.34
947 0.32
948 0.27
949 0.22
950 0.18
951 0.16
952 0.14
953 0.13
954 0.12
955 0.12
956 0.13
957 0.16
958 0.16
959 0.16
960 0.18
961 0.19
962 0.21
963 0.24
964 0.24
965 0.22
966 0.29
967 0.31
968 0.3
969 0.32
970 0.3
971 0.29
972 0.35
973 0.41
974 0.43
975 0.5
976 0.49
977 0.48
978 0.5
979 0.48
980 0.45
981 0.42
982 0.37
983 0.32
984 0.35
985 0.39
986 0.42
987 0.48
988 0.54
989 0.56
990 0.59
991 0.62
992 0.65
993 0.68
994 0.67
995 0.65
996 0.67
997 0.7
998 0.66
999 0.66
1000 0.6
1001 0.53
1002 0.5
1003 0.47
1004 0.43
1005 0.35
1006 0.32
1007 0.27
1008 0.31
1009 0.32
1010 0.32
1011 0.32
1012 0.28
1013 0.29
1014 0.3
1015 0.32
1016 0.3
1017 0.33
1018 0.35
1019 0.35
1020 0.33
1021 0.31
1022 0.28
1023 0.27
1024 0.25
1025 0.22
1026 0.22
1027 0.2
1028 0.22
1029 0.26
1030 0.33
1031 0.38
1032 0.46
1033 0.54
1034 0.6
1035 0.67
1036 0.72
1037 0.7
1038 0.7
1039 0.65
1040 0.61
1041 0.57
1042 0.5