Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SWL5

Protein Details
Accession A0A397SWL5    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKKRKNKKQSQTSQTSNNESHHydrophilic
181-209NVSIQQGRKSKKKKKKKPKVQGGIEKRVIBasic
351-375TDFYRFQKREAKRNKIIDLRKKFEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-206RKSKKKKKKKPKVQGGIEK
358-391KREAKRNKIIDLRKKFEEDKEKIAKLKAARRFKP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12951  RRP7_Rrp7A  
Amino Acid Sequences MAKKRKNKKQSQTSQTSNNESHNESNNTEQIFSTNQQTHNKDTETVSNSNISKEIQLPPLEELSNTGFKILPIEISSQNLIFDSNSSDSFTFTSIHYCYFKSHESRNNDSFLPPDNTLFISNLPVDSTEAHIKNLFQECGPIDKIIFNEVIKDDEFLISIVNESGDNVDENNNSNGGLNENVSIQQGRKSKKKKKKKPKVQGGIEKRVIGNYKEGGLRKLLIPDSSAHIVFQTSEGLKKALEMTQKKRTWAIKDTEIPSLGLSRWLQDYRLHRPDQSKLQEEVDEYMCKFEEAELERHKALEAKLNQPDEDGFIMVTRVGRRSTNTDGTITVTAAKPEEIKSLKPKNKEFTDFYRFQKREAKRNKIIDLRKKFEEDKEKIAKLKAARRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.84
3 0.8
4 0.72
5 0.67
6 0.6
7 0.54
8 0.52
9 0.49
10 0.47
11 0.42
12 0.44
13 0.42
14 0.39
15 0.36
16 0.31
17 0.25
18 0.25
19 0.25
20 0.27
21 0.29
22 0.34
23 0.41
24 0.45
25 0.49
26 0.5
27 0.5
28 0.45
29 0.43
30 0.44
31 0.42
32 0.4
33 0.36
34 0.36
35 0.35
36 0.33
37 0.32
38 0.25
39 0.21
40 0.23
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.27
46 0.29
47 0.27
48 0.23
49 0.21
50 0.2
51 0.22
52 0.2
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.19
57 0.16
58 0.14
59 0.11
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.13
79 0.11
80 0.15
81 0.13
82 0.16
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.21
87 0.26
88 0.28
89 0.34
90 0.39
91 0.46
92 0.53
93 0.54
94 0.53
95 0.48
96 0.44
97 0.38
98 0.34
99 0.31
100 0.24
101 0.21
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.12
115 0.16
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.22
121 0.25
122 0.22
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.2
127 0.21
128 0.16
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.09
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.13
173 0.18
174 0.22
175 0.31
176 0.41
177 0.51
178 0.61
179 0.72
180 0.78
181 0.84
182 0.91
183 0.93
184 0.94
185 0.95
186 0.95
187 0.93
188 0.92
189 0.89
190 0.86
191 0.77
192 0.66
193 0.55
194 0.47
195 0.39
196 0.29
197 0.23
198 0.15
199 0.15
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.07
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.2
229 0.25
230 0.31
231 0.41
232 0.43
233 0.44
234 0.48
235 0.5
236 0.48
237 0.49
238 0.48
239 0.45
240 0.5
241 0.51
242 0.47
243 0.43
244 0.37
245 0.3
246 0.26
247 0.19
248 0.16
249 0.13
250 0.12
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.21
255 0.27
256 0.32
257 0.39
258 0.4
259 0.4
260 0.44
261 0.48
262 0.53
263 0.53
264 0.49
265 0.44
266 0.45
267 0.42
268 0.39
269 0.36
270 0.29
271 0.24
272 0.19
273 0.18
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.22
281 0.25
282 0.29
283 0.29
284 0.29
285 0.29
286 0.26
287 0.24
288 0.27
289 0.27
290 0.31
291 0.38
292 0.39
293 0.39
294 0.36
295 0.35
296 0.29
297 0.25
298 0.18
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.11
305 0.13
306 0.14
307 0.16
308 0.19
309 0.26
310 0.32
311 0.36
312 0.36
313 0.36
314 0.34
315 0.36
316 0.33
317 0.28
318 0.23
319 0.17
320 0.16
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.22
326 0.22
327 0.26
328 0.35
329 0.45
330 0.51
331 0.58
332 0.64
333 0.66
334 0.72
335 0.74
336 0.7
337 0.68
338 0.71
339 0.68
340 0.66
341 0.68
342 0.6
343 0.58
344 0.62
345 0.6
346 0.62
347 0.67
348 0.71
349 0.7
350 0.78
351 0.82
352 0.82
353 0.85
354 0.85
355 0.85
356 0.81
357 0.77
358 0.74
359 0.7
360 0.7
361 0.7
362 0.65
363 0.65
364 0.67
365 0.66
366 0.65
367 0.64
368 0.6
369 0.57
370 0.61
371 0.61
372 0.63