Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T6P4

Protein Details
Accession A0A397T6P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-64LPSVYKKPSIKNPSPSPRPVDHydrophilic
549-571HIMEIKRSRKIRAEKRQTMFRNIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 16
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037987  FHL2/3/5  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MDVQQEPRISQLLPSVKCSDCGEMVEFRRLGEHLCQAAPAVPSLPSVYKKPSIKNPSPSPRPVDNTPSIRPNLNPLSVSDNSYGFGRSPYDTTPSPTDSGYSGYSGSKYTSPPSSTSSPKGPTNFLQKYEQITGKQISSSQFPRSSPTSSPIRLDKQQDNFNGNDYPNVYDNRQRDPYGQSYPLDRGLDPRKLPSNDRYNQQPPFDENNNRYNMDDPYRMGKPRVPNDPYAQRNQNPNDRYNDYIRGEEIRNRNRPPAAYPPPSSNQQYFDPSRKPTYDRQNVPSPYNYDSSRIPPRNLLQEKNGSQPPLKPYVPPSSQGRYDQGNRSDTSDSYGGRKVDDLMNDLMREMDSMQMPSNSNEYDKPGNKNDRDICAYCKTEITSSSTTMLALGKTWHSNHLLCAHCRKPIDPSVGHVERDNNVYCPKDFTDLFLPKCRRCNLPVEKEAVSASDGKLEGKWHVKCFGCHMCYKPFPDKSFYVFDNAPYCRRHYHQLNNSLCKTCDEPIEGPCVQTVEGWRYHPSCFVCINCQTPLTNVYYSFENKQYCETHIMEIKRSRKIRAEKRQTMFRNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.37
4 0.4
5 0.41
6 0.36
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.3
11 0.33
12 0.38
13 0.35
14 0.31
15 0.31
16 0.29
17 0.29
18 0.26
19 0.3
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.24
24 0.27
25 0.25
26 0.21
27 0.15
28 0.12
29 0.13
30 0.16
31 0.19
32 0.19
33 0.22
34 0.27
35 0.35
36 0.4
37 0.46
38 0.54
39 0.6
40 0.66
41 0.72
42 0.77
43 0.79
44 0.82
45 0.81
46 0.78
47 0.75
48 0.73
49 0.68
50 0.66
51 0.64
52 0.62
53 0.6
54 0.6
55 0.55
56 0.51
57 0.46
58 0.46
59 0.43
60 0.4
61 0.35
62 0.3
63 0.35
64 0.34
65 0.37
66 0.3
67 0.25
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.21
78 0.21
79 0.26
80 0.29
81 0.29
82 0.29
83 0.27
84 0.26
85 0.22
86 0.23
87 0.2
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.23
98 0.24
99 0.26
100 0.3
101 0.33
102 0.36
103 0.39
104 0.42
105 0.41
106 0.44
107 0.44
108 0.43
109 0.43
110 0.48
111 0.48
112 0.45
113 0.45
114 0.43
115 0.45
116 0.46
117 0.45
118 0.35
119 0.36
120 0.35
121 0.31
122 0.29
123 0.26
124 0.23
125 0.25
126 0.27
127 0.29
128 0.3
129 0.3
130 0.34
131 0.34
132 0.36
133 0.33
134 0.34
135 0.35
136 0.34
137 0.37
138 0.39
139 0.41
140 0.43
141 0.47
142 0.49
143 0.48
144 0.53
145 0.53
146 0.51
147 0.45
148 0.43
149 0.4
150 0.32
151 0.28
152 0.22
153 0.2
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.23
158 0.26
159 0.3
160 0.33
161 0.32
162 0.32
163 0.35
164 0.39
165 0.38
166 0.38
167 0.32
168 0.31
169 0.32
170 0.33
171 0.29
172 0.24
173 0.25
174 0.28
175 0.33
176 0.31
177 0.34
178 0.37
179 0.39
180 0.43
181 0.44
182 0.48
183 0.47
184 0.49
185 0.53
186 0.52
187 0.53
188 0.51
189 0.45
190 0.41
191 0.43
192 0.46
193 0.44
194 0.42
195 0.44
196 0.45
197 0.44
198 0.39
199 0.34
200 0.31
201 0.29
202 0.26
203 0.21
204 0.22
205 0.25
206 0.26
207 0.25
208 0.26
209 0.3
210 0.34
211 0.42
212 0.41
213 0.41
214 0.46
215 0.53
216 0.53
217 0.51
218 0.52
219 0.47
220 0.51
221 0.53
222 0.55
223 0.49
224 0.49
225 0.48
226 0.45
227 0.44
228 0.4
229 0.41
230 0.34
231 0.31
232 0.28
233 0.26
234 0.24
235 0.28
236 0.33
237 0.35
238 0.4
239 0.41
240 0.44
241 0.43
242 0.42
243 0.4
244 0.42
245 0.42
246 0.4
247 0.4
248 0.4
249 0.41
250 0.44
251 0.43
252 0.34
253 0.3
254 0.26
255 0.3
256 0.29
257 0.31
258 0.31
259 0.31
260 0.34
261 0.32
262 0.34
263 0.36
264 0.44
265 0.48
266 0.49
267 0.5
268 0.55
269 0.56
270 0.54
271 0.49
272 0.41
273 0.34
274 0.32
275 0.28
276 0.21
277 0.2
278 0.23
279 0.3
280 0.31
281 0.29
282 0.29
283 0.31
284 0.39
285 0.42
286 0.39
287 0.34
288 0.38
289 0.39
290 0.4
291 0.4
292 0.31
293 0.29
294 0.3
295 0.29
296 0.29
297 0.27
298 0.24
299 0.26
300 0.33
301 0.33
302 0.33
303 0.34
304 0.32
305 0.34
306 0.35
307 0.33
308 0.3
309 0.33
310 0.36
311 0.35
312 0.34
313 0.32
314 0.33
315 0.32
316 0.27
317 0.26
318 0.22
319 0.18
320 0.18
321 0.21
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.13
334 0.1
335 0.1
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.12
344 0.14
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.16
349 0.22
350 0.25
351 0.29
352 0.35
353 0.43
354 0.43
355 0.5
356 0.5
357 0.48
358 0.49
359 0.46
360 0.43
361 0.4
362 0.4
363 0.33
364 0.31
365 0.27
366 0.23
367 0.23
368 0.24
369 0.2
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.18
374 0.17
375 0.17
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.12
381 0.13
382 0.16
383 0.18
384 0.19
385 0.2
386 0.27
387 0.29
388 0.29
389 0.36
390 0.35
391 0.36
392 0.37
393 0.35
394 0.34
395 0.37
396 0.41
397 0.34
398 0.36
399 0.41
400 0.42
401 0.42
402 0.37
403 0.33
404 0.28
405 0.31
406 0.28
407 0.21
408 0.22
409 0.23
410 0.22
411 0.23
412 0.23
413 0.23
414 0.22
415 0.24
416 0.3
417 0.34
418 0.37
419 0.42
420 0.46
421 0.46
422 0.53
423 0.53
424 0.48
425 0.45
426 0.53
427 0.54
428 0.58
429 0.59
430 0.57
431 0.55
432 0.51
433 0.47
434 0.37
435 0.28
436 0.2
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.13
441 0.14
442 0.15
443 0.18
444 0.25
445 0.29
446 0.28
447 0.34
448 0.36
449 0.36
450 0.42
451 0.47
452 0.42
453 0.43
454 0.44
455 0.46
456 0.49
457 0.54
458 0.56
459 0.54
460 0.53
461 0.55
462 0.53
463 0.5
464 0.5
465 0.45
466 0.41
467 0.34
468 0.34
469 0.35
470 0.35
471 0.35
472 0.32
473 0.34
474 0.34
475 0.37
476 0.43
477 0.46
478 0.54
479 0.58
480 0.67
481 0.72
482 0.75
483 0.76
484 0.7
485 0.62
486 0.54
487 0.48
488 0.4
489 0.35
490 0.33
491 0.3
492 0.29
493 0.35
494 0.32
495 0.29
496 0.27
497 0.24
498 0.19
499 0.18
500 0.2
501 0.18
502 0.21
503 0.23
504 0.28
505 0.29
506 0.3
507 0.34
508 0.32
509 0.32
510 0.33
511 0.33
512 0.35
513 0.38
514 0.41
515 0.37
516 0.37
517 0.33
518 0.31
519 0.32
520 0.3
521 0.27
522 0.24
523 0.24
524 0.26
525 0.29
526 0.31
527 0.33
528 0.32
529 0.31
530 0.36
531 0.36
532 0.36
533 0.38
534 0.36
535 0.36
536 0.4
537 0.42
538 0.44
539 0.5
540 0.53
541 0.57
542 0.58
543 0.58
544 0.61
545 0.69
546 0.72
547 0.75
548 0.8
549 0.8
550 0.85
551 0.89