Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TS38

Protein Details
Accession A0A397TS38    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-128TSLRNTKKQLSKEERKRREKLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-124EERKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 1, pero 1, golg 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037666  CCDC43  
Amino Acid Sequences MNLVQLIKKQLSTIGLHDETFDEYIAGIISDDSLEESEKREAISEFISGATDTPSGSIIDDIFNAWTEFNEEEQKIKEIEKKHEKETGESEALQQKSGVSISTESTTSLRNTKKQLSKEERKRREKLLARYSYDLDEVVENEDGEAEIQYKDRSETKEINNSTYYFIFKIIKISNQLKILFHFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.27
4 0.27
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.18
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.07
14 0.05
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.04
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.07
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.16
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.2
66 0.29
67 0.38
68 0.4
69 0.42
70 0.46
71 0.45
72 0.43
73 0.43
74 0.38
75 0.29
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.25
80 0.22
81 0.18
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.1
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.17
96 0.19
97 0.22
98 0.26
99 0.34
100 0.4
101 0.44
102 0.53
103 0.57
104 0.65
105 0.72
106 0.79
107 0.81
108 0.84
109 0.83
110 0.79
111 0.79
112 0.77
113 0.76
114 0.75
115 0.72
116 0.67
117 0.66
118 0.61
119 0.52
120 0.44
121 0.33
122 0.24
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.11
139 0.16
140 0.2
141 0.25
142 0.32
143 0.37
144 0.47
145 0.48
146 0.49
147 0.47
148 0.44
149 0.42
150 0.36
151 0.31
152 0.22
153 0.24
154 0.22
155 0.2
156 0.26
157 0.26
158 0.29
159 0.34
160 0.38
161 0.41
162 0.44
163 0.46
164 0.41