FuNGI

A0A397SL48

Protein Details

Accession

A0A397SL48

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-71	DGVAPRAKMNQQRARRFRTAKE	Hydrophilic
190-209	VTFGSNKKKKQGRVESQNFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MNGIIHNCSHPNDVDTHFRVSEDEIFQEIFNYIDHLFTKIKPKXLFFMAVDGVAPRAKMNQQRARRFRTAKEAAEAAKKAELRGELPKEPPFDSNCITPGTEFMAKLSLQLQYFIHKKVTEDSNWKDIKIVLSGHEVPGEGEHKIMEYIRNAKAQVDYNPNVRHCLYGLDADLVMLGLLXHDPHFALLREEVTFGSNKKKKQGRVESQNFXLMHLSLLREXLDLEFSILKETLPFKYNLERIIDDFILLALFIGNDFLPHLPNLHIAEXALGXMFXVYKKVLPDTDRKDQLTEEEKQRDTFGDSLLFTHESNICHCQCRKEIYELPTLKGLRLIKGLCDGVQLGVKAMAGFPSLQTLRHTAKLLQHGVNVFNSESKNETMVITIDNKFKDMKVEDVAREKIGKRIFVGWPFLQEGIVQALSDELFRYELSNGQTQVVKNPHRPEVLDQWQRKADRIEHTYNKRHGTITGSVELLAHVLMLKGMKRVQDGALIKEYGEEQDHAIQTTVDNVECEDSRYEEKPPVPLAEEFPICDNIFYLGHPYYGCPGHVYDREFIDKEPEFGSEIAKTFSTRIKYTPWFKVAPKLGISGLTLSKLTASLHVICKPAEHKSGDQKSNDQRINLGLNLKFESKKQKVLGYTRKTRIKDKDGWEYSEKAINLLEEYKKKFPEFIQALESKHSKDEIYTAEDFYPKEEAVSKINAIKDWLRTVEVRDFEKVSLEAEQLDKEAIKDIEKAADKLLNRQLEKKEIEKLARHQLLKPSHATTLLQNQKFSLGDRVVFVKDSGNVPIASKGTIVGIEKSNIDVVFDTSFMGGSTLGDRCSKYRGMTVPANSLLNLTKPQLDQLDQLDRRSNTGNSRSRHGANSNYQSRSHQETVHNGQQMYNSYPYYSNAYQYRGNRGGGHMHSANHTTNGSHQRQSNRPRGASGSNGYIQSSHLYHNQIQIRPRPIQQSQASSAATKYGTQNQTHHAYRNSRGSNGNGYLNRGGYGSRGHYGGNGISRGRGRADGKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.35
3	0.37
4	0.34
5	0.33
6	0.32
7	0.31
8	0.34
9	0.27
10	0.26
11	0.23
12	0.23
13	0.23
14	0.23
15	0.19
16	0.13
17	0.11
18	0.12
19	0.1
20	0.12
21	0.13
22	0.15
23	0.17
24	0.2
25	0.31
26	0.34
27	0.4
28	0.4
29	0.43
30	0.45
31	0.46
32	0.44
33	0.38
34	0.38
35	0.32
36	0.32
37	0.28
38	0.24
39	0.22
40	0.21
41	0.17
42	0.15
43	0.21
44	0.28
45	0.38
46	0.46
47	0.56
48	0.67
49	0.76
50	0.8
51	0.84
52	0.82
53	0.77
54	0.78
55	0.77
56	0.7
57	0.65
58	0.61
59	0.55
60	0.56
61	0.51
62	0.42
63	0.39
64	0.35
65	0.31
66	0.3
67	0.28
68	0.24
69	0.32
70	0.37
71	0.36
72	0.4
73	0.44
74	0.43
75	0.43
76	0.44
77	0.39
78	0.38
79	0.36
80	0.34
81	0.31
82	0.3
83	0.29
84	0.24
85	0.22
86	0.22
87	0.22
88	0.19
89	0.18
90	0.19
91	0.18
92	0.19
93	0.2
94	0.19
95	0.16
96	0.18
97	0.18
98	0.22
99	0.26
100	0.27
101	0.3
102	0.26
103	0.28
104	0.32
105	0.38
106	0.38
107	0.43
108	0.46
109	0.51
110	0.52
111	0.5
112	0.45
113	0.4
114	0.35
115	0.3
116	0.26
117	0.19
118	0.24
119	0.26
120	0.25
121	0.24
122	0.21
123	0.18
124	0.2
125	0.19
126	0.12
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.12
131	0.13
132	0.13
133	0.16
134	0.22
135	0.26
136	0.29
137	0.29
138	0.29
139	0.32
140	0.33
141	0.34
142	0.37
143	0.36
144	0.41
145	0.46
146	0.46
147	0.46
148	0.42
149	0.37
150	0.28
151	0.28
152	0.22
153	0.19
154	0.19
155	0.16
156	0.16
157	0.14
158	0.13
159	0.1
160	0.08
161	0.05
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.06
169	0.08
170	0.09
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.13
178	0.15
179	0.15
180	0.24
181	0.28
182	0.3
183	0.39
184	0.46
185	0.52
186	0.61
187	0.7
188	0.71
189	0.77
190	0.82
191	0.78
192	0.75
193	0.7
194	0.59
195	0.49
196	0.38
197	0.28
198	0.21
199	0.17
200	0.14
201	0.12
202	0.12
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.07
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.11
215	0.14
216	0.16
217	0.17
218	0.18
219	0.26
220	0.28
221	0.29
222	0.3
223	0.29
224	0.28
225	0.31
226	0.28
227	0.21
228	0.19
229	0.15
230	0.11
231	0.1
232	0.08
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.12
246	0.14
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.1
253	0.07
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.07
258	0.06
259	0.07
260	0.09
261	0.12
262	0.15
263	0.24
264	0.31
265	0.39
266	0.44
267	0.44
268	0.44
269	0.41
270	0.44
271	0.4
272	0.39
273	0.38
274	0.39
275	0.39
276	0.39
277	0.39
278	0.34
279	0.32
280	0.26
281	0.2
282	0.16
283	0.15
284	0.15
285	0.16
286	0.16
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.14
291	0.17
292	0.22
293	0.21
294	0.26
295	0.28
296	0.3
297	0.31
298	0.36
299	0.37
300	0.38
301	0.44
302	0.43
303	0.51
304	0.47
305	0.45
306	0.45
307	0.42
308	0.34
309	0.33
310	0.29
311	0.21
312	0.24
313	0.23
314	0.18
315	0.21
316	0.22
317	0.16
318	0.16
319	0.15
320	0.11
321	0.12
322	0.11
323	0.08
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.12
336	0.16
337	0.18
338	0.21
339	0.23
340	0.21
341	0.26
342	0.32
343	0.35
344	0.32
345	0.31
346	0.3
347	0.3
348	0.27
349	0.23
350	0.17
351	0.15
352	0.14
353	0.13
354	0.14
355	0.13
356	0.13
357	0.12
358	0.12
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.14
364	0.17
365	0.16
366	0.17
367	0.17
368	0.17
369	0.2
370	0.18
371	0.18
372	0.19
373	0.22
374	0.23
375	0.28
376	0.29
377	0.25
378	0.27
379	0.25
380	0.26
381	0.25
382	0.23
383	0.2
384	0.23
385	0.25
386	0.25
387	0.29
388	0.24
389	0.24
390	0.24
391	0.23
392	0.18
393	0.15
394	0.13
395	0.1
396	0.09
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.09
409	0.12
410	0.14
411	0.15
412	0.15
413	0.18
414	0.17
415	0.22
416	0.26
417	0.27
418	0.3
419	0.33
420	0.36
421	0.35
422	0.36
423	0.34
424	0.36
425	0.42
426	0.45
427	0.42
428	0.42
429	0.46
430	0.45
431	0.43
432	0.38
433	0.33
434	0.32
435	0.36
436	0.4
437	0.44
438	0.5
439	0.56
440	0.57
441	0.55
442	0.49
443	0.44
444	0.37
445	0.34
446	0.31
447	0.26
448	0.23
449	0.2
450	0.19
451	0.18
452	0.17
453	0.12
454	0.08
455	0.05
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.04
461	0.06
462	0.08
463	0.09
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.17
468	0.18
469	0.18
470	0.19
471	0.18
472	0.17
473	0.16
474	0.16
475	0.1
476	0.1
477	0.08
478	0.07
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.11
496	0.12
497	0.13
498	0.16
499	0.16
500	0.18
501	0.18
502	0.17
503	0.17
504	0.17
505	0.17
506	0.17
507	0.16
508	0.14
509	0.14
510	0.15
511	0.13
512	0.12
513	0.1
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.1
518	0.08
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.09
526	0.09
527	0.13
528	0.16
529	0.17
530	0.17
531	0.18
532	0.2
533	0.2
534	0.19
535	0.21
536	0.18
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.14
541	0.13
542	0.14
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.1
549	0.13
550	0.15
551	0.15
552	0.16
553	0.21
554	0.27
555	0.32
556	0.37
557	0.37
558	0.38
559	0.37
560	0.44
561	0.42
562	0.38
563	0.33
564	0.29
565	0.25
566	0.22
567	0.22
568	0.16
569	0.13
570	0.11
571	0.09
572	0.08
573	0.08
574	0.08
575	0.07
576	0.07
577	0.09
578	0.11
579	0.13
580	0.16
581	0.17
582	0.17
583	0.18
584	0.19
585	0.2
586	0.22
587	0.22
588	0.23
589	0.32
590	0.4
591	0.43
592	0.43
593	0.47
594	0.5
595	0.57
596	0.55
597	0.45
598	0.37
599	0.35
600	0.35
601	0.3
602	0.27
603	0.19
604	0.19
605	0.2
606	0.21
607	0.2
608	0.2
609	0.29
610	0.27
611	0.32
612	0.33
613	0.36
614	0.39
615	0.49
616	0.56
617	0.55
618	0.61
619	0.63
620	0.68
621	0.67
622	0.69
623	0.68
624	0.65
625	0.65
626	0.62
627	0.64
628	0.6
629	0.62
630	0.56
631	0.5
632	0.44
633	0.4
634	0.34
635	0.23
636	0.21
637	0.16
638	0.14
639	0.16
640	0.19
641	0.19
642	0.24
643	0.27
644	0.29
645	0.3
646	0.31
647	0.28
648	0.34
649	0.32
650	0.3
651	0.32
652	0.33
653	0.33
654	0.35
655	0.35
656	0.25
657	0.24
658	0.22
659	0.16
660	0.14
661	0.16
662	0.15
663	0.19
664	0.19
665	0.19
666	0.2
667	0.21
668	0.21
669	0.19
670	0.18
671	0.12
672	0.12
673	0.13
674	0.14
675	0.15
676	0.17
677	0.17
678	0.19
679	0.2
680	0.2
681	0.2
682	0.21
683	0.2
684	0.21
685	0.2
686	0.19
687	0.19
688	0.22
689	0.25
690	0.26
691	0.26
692	0.26
693	0.26
694	0.24
695	0.25
696	0.21
697	0.16
698	0.14
699	0.13
700	0.12
701	0.11
702	0.11
703	0.1
704	0.1
705	0.09
706	0.08
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.12
711	0.13
712	0.18
713	0.2
714	0.2
715	0.18
716	0.22
717	0.21
718	0.26
719	0.32
720	0.33
721	0.33
722	0.38
723	0.4
724	0.43
725	0.46
726	0.42
727	0.43
728	0.42
729	0.46
730	0.44
731	0.47
732	0.5
733	0.53
734	0.52
735	0.48
736	0.51
737	0.51
738	0.5
739	0.48
740	0.4
741	0.35
742	0.35
743	0.32
744	0.27
745	0.32
746	0.38
747	0.36
748	0.34
749	0.33
750	0.33
751	0.33
752	0.31
753	0.27
754	0.2
755	0.18
756	0.19
757	0.22
758	0.2
759	0.2
760	0.19
761	0.15
762	0.15
763	0.16
764	0.16
765	0.16
766	0.15
767	0.15
768	0.18
769	0.16
770	0.15
771	0.13
772	0.12
773	0.1
774	0.12
775	0.12
776	0.12
777	0.13
778	0.14
779	0.14
780	0.14
781	0.16
782	0.14
783	0.14
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.07
793	0.06
794	0.06
795	0.08
796	0.09
797	0.1
798	0.12
799	0.13
800	0.14
801	0.19
802	0.21
803	0.2
804	0.26
805	0.28
806	0.33
807	0.38
808	0.39
809	0.4
810	0.4
811	0.39
812	0.33
813	0.3
814	0.25
815	0.21
816	0.2
817	0.16
818	0.17
819	0.17
820	0.2
821	0.21
822	0.22
823	0.23
824	0.26
825	0.35
826	0.33
827	0.35
828	0.39
829	0.37
830	0.38
831	0.39
832	0.38
833	0.35
834	0.43
835	0.49
836	0.44
837	0.5
838	0.53
839	0.52
840	0.54
841	0.5
842	0.48
843	0.5
844	0.57
845	0.59
846	0.56
847	0.55
848	0.52
849	0.53
850	0.53
851	0.46
852	0.42
853	0.4
854	0.45
855	0.51
856	0.55
857	0.55
858	0.47
859	0.45
860	0.43
861	0.41
862	0.36
863	0.32
864	0.25
865	0.23
866	0.24
867	0.24
868	0.28
869	0.26
870	0.28
871	0.28
872	0.32
873	0.36
874	0.39
875	0.46
876	0.43
877	0.44
878	0.39
879	0.39
880	0.43
881	0.38
882	0.41
883	0.34
884	0.32
885	0.32
886	0.34
887	0.33
888	0.28
889	0.27
890	0.21
891	0.26
892	0.35
893	0.36
894	0.37
895	0.42
896	0.48
897	0.57
898	0.65
899	0.67
900	0.66
901	0.64
902	0.62
903	0.62
904	0.58
905	0.55
906	0.49
907	0.45
908	0.39
909	0.39
910	0.35
911	0.31
912	0.27
913	0.24
914	0.22
915	0.19
916	0.21
917	0.25
918	0.27
919	0.35
920	0.41
921	0.42
922	0.48
923	0.52
924	0.54
925	0.54
926	0.57
927	0.57
928	0.53
929	0.58
930	0.57
931	0.57
932	0.55
933	0.55
934	0.51
935	0.44
936	0.41
937	0.35
938	0.29
939	0.25
940	0.25
941	0.29
942	0.33
943	0.36
944	0.4
945	0.43
946	0.5
947	0.51
948	0.53
949	0.51
950	0.51
951	0.54
952	0.61
953	0.58
954	0.55
955	0.55
956	0.53
957	0.54
958	0.51
959	0.52
960	0.44
961	0.46
962	0.44
963	0.41
964	0.37
965	0.29
966	0.25
967	0.19
968	0.22
969	0.21
970	0.2
971	0.2
972	0.2
973	0.21
974	0.23
975	0.25
976	0.25
977	0.25
978	0.23
979	0.27
980	0.29
981	0.3
982	0.3
983	0.33

A0A397SL48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer