Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TB31

Protein Details
Accession A0A397TB31    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49IKNIMKYQREHAPRKKRKISAYNVFQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-40PRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MRLNHEAEINTLSKQLNLNPEFIKNIMKYQREHAPRKKRKISAYNVFQTDWWEIKKPDGYNLSTANIQKMCSDDWKNLDKEDCQTYQEKANEISNNQELNSTKYIENAKSRLVVLNKGIHDVRKIFGTLQIMCGIEFITLAVSNRNELQCNYFGTNTGEEFYRKSSKFQDFITPFRSLSIVKHNEYIGIFDKVEKSFVQNKDSLLKISDKKNVESSFIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.28
4 0.29
5 0.32
6 0.31
7 0.33
8 0.33
9 0.32
10 0.34
11 0.25
12 0.32
13 0.35
14 0.38
15 0.38
16 0.41
17 0.49
18 0.52
19 0.61
20 0.64
21 0.67
22 0.74
23 0.82
24 0.87
25 0.85
26 0.86
27 0.86
28 0.86
29 0.85
30 0.83
31 0.8
32 0.73
33 0.66
34 0.55
35 0.49
36 0.42
37 0.34
38 0.27
39 0.24
40 0.22
41 0.25
42 0.31
43 0.28
44 0.31
45 0.33
46 0.33
47 0.32
48 0.34
49 0.31
50 0.29
51 0.29
52 0.27
53 0.23
54 0.21
55 0.18
56 0.18
57 0.17
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.26
62 0.31
63 0.31
64 0.31
65 0.32
66 0.27
67 0.27
68 0.29
69 0.25
70 0.21
71 0.23
72 0.23
73 0.27
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.25
78 0.24
79 0.23
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.19
84 0.2
85 0.16
86 0.18
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.2
93 0.23
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.2
103 0.19
104 0.21
105 0.21
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.16
110 0.12
111 0.13
112 0.1
113 0.13
114 0.15
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.1
122 0.07
123 0.07
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.21
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.17
149 0.23
150 0.22
151 0.25
152 0.33
153 0.38
154 0.4
155 0.41
156 0.47
157 0.42
158 0.46
159 0.47
160 0.41
161 0.35
162 0.33
163 0.32
164 0.22
165 0.22
166 0.28
167 0.29
168 0.29
169 0.31
170 0.31
171 0.32
172 0.31
173 0.31
174 0.25
175 0.22
176 0.2
177 0.2
178 0.23
179 0.21
180 0.23
181 0.2
182 0.22
183 0.28
184 0.32
185 0.35
186 0.34
187 0.36
188 0.4
189 0.41
190 0.37
191 0.31
192 0.35
193 0.36
194 0.4
195 0.46
196 0.44
197 0.46
198 0.52
199 0.51