Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E2L625

Protein Details
Accession E2L625    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-50TLEISRKYAKWERNKREKEKKRQDDQEAERSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-40KYAKWERNKREKEKKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG mpr:MPER_01251  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
Amino Acid Sequences KDTIEDLKNRADDGARWRTLEISRKYAKWERNKREKEKKRQDDQEAERSEARILFDSFNMLTILLVAFAEIDWHDYAIVQTIEFTVADATSELPPPMSVQDVENMTLAQKRMAAMIMENTAEDVEAHRAKQAAAEAEAAAAVGNAGIAAANDDTAMEESDDEGQEMEERARREEEERLKEIERAKALQANSVNAGGPMKIRTDYVPKLGKQAKSAMTTCTICGQQIPVDELQEHMRIELLDPKWKEQRDANERRNAQASELQRGANVVSSLKNLART
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.35
3 0.36
4 0.36
5 0.38
6 0.42
7 0.47
8 0.44
9 0.43
10 0.46
11 0.47
12 0.55
13 0.59
14 0.62
15 0.63
16 0.69
17 0.71
18 0.77
19 0.86
20 0.89
21 0.92
22 0.94
23 0.94
24 0.94
25 0.94
26 0.93
27 0.92
28 0.91
29 0.9
30 0.87
31 0.85
32 0.77
33 0.7
34 0.61
35 0.52
36 0.44
37 0.35
38 0.29
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.14
47 0.11
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.15
160 0.23
161 0.3
162 0.33
163 0.36
164 0.37
165 0.37
166 0.4
167 0.4
168 0.37
169 0.31
170 0.26
171 0.25
172 0.26
173 0.25
174 0.27
175 0.25
176 0.22
177 0.21
178 0.2
179 0.18
180 0.14
181 0.14
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.19
190 0.21
191 0.27
192 0.32
193 0.32
194 0.4
195 0.45
196 0.45
197 0.41
198 0.45
199 0.42
200 0.42
201 0.42
202 0.36
203 0.35
204 0.33
205 0.31
206 0.28
207 0.24
208 0.19
209 0.18
210 0.18
211 0.15
212 0.16
213 0.18
214 0.15
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.19
220 0.17
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.2
226 0.2
227 0.25
228 0.27
229 0.33
230 0.39
231 0.41
232 0.44
233 0.42
234 0.51
235 0.54
236 0.63
237 0.66
238 0.69
239 0.69
240 0.7
241 0.69
242 0.59
243 0.52
244 0.48
245 0.43
246 0.41
247 0.41
248 0.37
249 0.31
250 0.31
251 0.28
252 0.23
253 0.21
254 0.15
255 0.14
256 0.16
257 0.2