Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T7W5

Protein Details
Accession A0A397T7W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-243GTNGSLKKKRRKRDELLSDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-236KKKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 16, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045164  RBM41/RNPC3  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12239  RRM2_RBM40_like  
Amino Acid Sequences MNPPPALSINKDVQFLEQETTTLLVKNLPDLSESDRLDFLKHFGPQEVRLGTSKSMKNSAFLDFPDRLSATNAFSKIQELGDIGGKKIRVEYALPSTEALQKKGNPKIGGNSGDNTNENRQDDLGSLQPPPPPPPFPPPPSFTAEPIAPSLGINYPAPPTLHYRYPPPTVEILYNIMNAIAAVPKLYTQVLHLMNKMNLPPPFGPILPESIPTMLQQHQMDNQGTNGSLKKKRRKRDELLSDDESEIDSESEEEQIKTGPIKKPRTTEILPGAVPLIPATSYMNPTLIGPPVEPMTSESIISSAAPQLPSSPAQFPSTLKIDPHTNSISNEVKSEETESIEQAESPTKWITLEELNSNKMSIEELNKISAMKNYEPGQPKSSLYIKNLAPKKVKKEDLEYLFGRYFQTKSQMDIRLHPRGQAFVIFPNVEMATQALNDVHGYILHNKPMVIQFSNKVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.3
4 0.22
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.18
9 0.15
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.18
14 0.19
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.25
19 0.29
20 0.3
21 0.28
22 0.28
23 0.28
24 0.29
25 0.28
26 0.25
27 0.23
28 0.25
29 0.24
30 0.27
31 0.3
32 0.31
33 0.37
34 0.35
35 0.32
36 0.31
37 0.32
38 0.31
39 0.35
40 0.37
41 0.34
42 0.4
43 0.38
44 0.39
45 0.38
46 0.38
47 0.32
48 0.3
49 0.31
50 0.26
51 0.26
52 0.27
53 0.25
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.21
58 0.25
59 0.25
60 0.22
61 0.22
62 0.23
63 0.21
64 0.2
65 0.17
66 0.12
67 0.12
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.14
77 0.15
78 0.19
79 0.24
80 0.25
81 0.26
82 0.25
83 0.25
84 0.31
85 0.31
86 0.29
87 0.26
88 0.29
89 0.36
90 0.43
91 0.47
92 0.43
93 0.43
94 0.47
95 0.49
96 0.49
97 0.43
98 0.38
99 0.34
100 0.34
101 0.33
102 0.31
103 0.29
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.2
111 0.18
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.24
118 0.25
119 0.25
120 0.28
121 0.35
122 0.41
123 0.44
124 0.47
125 0.46
126 0.47
127 0.5
128 0.47
129 0.41
130 0.37
131 0.31
132 0.27
133 0.25
134 0.21
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.17
147 0.19
148 0.24
149 0.24
150 0.29
151 0.32
152 0.36
153 0.36
154 0.33
155 0.31
156 0.28
157 0.27
158 0.23
159 0.21
160 0.17
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.12
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.2
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.2
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.17
191 0.18
192 0.14
193 0.17
194 0.14
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.13
201 0.11
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.17
206 0.2
207 0.2
208 0.18
209 0.17
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.21
216 0.3
217 0.39
218 0.47
219 0.56
220 0.66
221 0.73
222 0.75
223 0.8
224 0.82
225 0.79
226 0.77
227 0.71
228 0.61
229 0.52
230 0.44
231 0.33
232 0.22
233 0.15
234 0.08
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.15
246 0.19
247 0.26
248 0.34
249 0.38
250 0.41
251 0.44
252 0.49
253 0.46
254 0.46
255 0.43
256 0.38
257 0.34
258 0.31
259 0.28
260 0.21
261 0.19
262 0.13
263 0.08
264 0.05
265 0.05
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.13
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.21
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.21
308 0.24
309 0.24
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.25
314 0.3
315 0.32
316 0.27
317 0.27
318 0.23
319 0.21
320 0.2
321 0.22
322 0.17
323 0.15
324 0.16
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.16
331 0.13
332 0.15
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.17
340 0.22
341 0.24
342 0.26
343 0.26
344 0.26
345 0.23
346 0.19
347 0.18
348 0.14
349 0.16
350 0.18
351 0.19
352 0.21
353 0.21
354 0.22
355 0.21
356 0.22
357 0.23
358 0.19
359 0.24
360 0.25
361 0.33
362 0.39
363 0.42
364 0.42
365 0.4
366 0.39
367 0.39
368 0.44
369 0.41
370 0.38
371 0.41
372 0.4
373 0.47
374 0.52
375 0.54
376 0.56
377 0.58
378 0.64
379 0.67
380 0.71
381 0.67
382 0.69
383 0.71
384 0.68
385 0.67
386 0.58
387 0.54
388 0.47
389 0.43
390 0.37
391 0.3
392 0.25
393 0.22
394 0.29
395 0.25
396 0.29
397 0.36
398 0.41
399 0.41
400 0.49
401 0.53
402 0.55
403 0.54
404 0.54
405 0.48
406 0.43
407 0.42
408 0.37
409 0.31
410 0.25
411 0.3
412 0.26
413 0.25
414 0.25
415 0.24
416 0.2
417 0.18
418 0.15
419 0.11
420 0.1
421 0.11
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.11
429 0.17
430 0.21
431 0.24
432 0.25
433 0.24
434 0.28
435 0.32
436 0.35
437 0.31
438 0.32