Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SRH3

Protein Details
Accession A0A397SRH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-210TDLEEKKTKAKEKKEKKKNKVAKQESGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-205KKTKAKEKKEKKKNKVAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.499, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006735  Rtf2  
IPR027799  Rtf2_RING-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1902979  P:mitotic DNA replication termination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04641  Rtf2  
CDD cd16653  RING-like_Rtf2  
Amino Acid Sequences MGNDGGSIPKRIELVKEKQKEVRPDQNAMKIATWFFCALSKRPLQDPVVACALGKLYNKDAIIEYLLNKNAYGDGDIICSHISNMKDVQSLKLAANPAFKETNGASIAHFDQGMVSRFICPITMKEMNGKLKFVYLNTCGCVFSEQGLKEVPSSTCIQCGKSFNQENVITINPSPVEQEKLKTDLEEKKTKAKEKKEKKKNKVAKQESGEVIAESSSSNAPNNKRKRENNSDEDPKQSPSKKPSIKSEVGVTANNTNSSTSVNCGIGGNSVTAVVNQKVQEHLVNTSSKTKQSKAIRSIYSKKKDDSVTESYLVRGTFNRYAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.54
4 0.58
5 0.64
6 0.7
7 0.73
8 0.73
9 0.73
10 0.69
11 0.7
12 0.71
13 0.71
14 0.67
15 0.59
16 0.52
17 0.44
18 0.4
19 0.33
20 0.28
21 0.21
22 0.18
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.28
27 0.32
28 0.33
29 0.36
30 0.41
31 0.39
32 0.44
33 0.43
34 0.39
35 0.38
36 0.34
37 0.3
38 0.25
39 0.23
40 0.2
41 0.2
42 0.18
43 0.17
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.11
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.15
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.19
77 0.21
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.19
82 0.24
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.22
87 0.21
88 0.19
89 0.21
90 0.17
91 0.17
92 0.14
93 0.16
94 0.17
95 0.14
96 0.14
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.21
113 0.27
114 0.34
115 0.34
116 0.33
117 0.27
118 0.27
119 0.27
120 0.23
121 0.21
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.11
130 0.1
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.13
139 0.1
140 0.13
141 0.12
142 0.16
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.22
147 0.22
148 0.27
149 0.29
150 0.25
151 0.3
152 0.29
153 0.27
154 0.25
155 0.23
156 0.16
157 0.14
158 0.14
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.11
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.21
171 0.25
172 0.31
173 0.36
174 0.36
175 0.41
176 0.47
177 0.54
178 0.57
179 0.6
180 0.65
181 0.69
182 0.79
183 0.81
184 0.87
185 0.89
186 0.92
187 0.91
188 0.91
189 0.91
190 0.88
191 0.86
192 0.79
193 0.75
194 0.65
195 0.57
196 0.47
197 0.36
198 0.27
199 0.18
200 0.14
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.14
207 0.21
208 0.3
209 0.39
210 0.47
211 0.56
212 0.63
213 0.71
214 0.77
215 0.79
216 0.78
217 0.78
218 0.78
219 0.7
220 0.68
221 0.6
222 0.52
223 0.5
224 0.47
225 0.45
226 0.43
227 0.51
228 0.53
229 0.56
230 0.63
231 0.65
232 0.63
233 0.59
234 0.56
235 0.52
236 0.47
237 0.43
238 0.36
239 0.31
240 0.29
241 0.28
242 0.24
243 0.18
244 0.16
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.11
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.12
261 0.11
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.21
268 0.19
269 0.21
270 0.22
271 0.24
272 0.25
273 0.31
274 0.32
275 0.37
276 0.39
277 0.39
278 0.44
279 0.52
280 0.59
281 0.6
282 0.66
283 0.66
284 0.71
285 0.78
286 0.8
287 0.8
288 0.75
289 0.7
290 0.68
291 0.66
292 0.63
293 0.6
294 0.57
295 0.52
296 0.49
297 0.47
298 0.41
299 0.38
300 0.32
301 0.27
302 0.21
303 0.23