Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SIX3

Protein Details
Accession A0A397SIX3    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-61MPVPKEFVKTSKKKTPRPPNANLIYTHydrophilic
122-144KKSHPGYKFKPNRKDKKGTIKFYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-139KEHKKSHPGYKFKPNRKDKKG
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSQISEVSAKRFYSENRAKLADLLNTLGSSIDNDTMPVPKEFVKTSKKKTPRPPNANLIYTNTLNKFGLLDILREFCERNHINKQKLIPISKKLSKILWEDLPNKHQRFFSDLASKVTKEHKKSHPGYKFKPNRKDKKGTIKFYNPETQKMEPTCKPVHFQQTDTPFLYNHYQQAFEYNALDYHNHQQTIRYHEDNTPIYYQPADEINILEDSSISDHYMSSEDEPPSFNEKPLPQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.45
4 0.48
5 0.46
6 0.46
7 0.47
8 0.39
9 0.31
10 0.28
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.16
15 0.13
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.11
22 0.13
23 0.15
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.27
30 0.35
31 0.42
32 0.5
33 0.58
34 0.65
35 0.72
36 0.81
37 0.85
38 0.85
39 0.86
40 0.85
41 0.85
42 0.82
43 0.76
44 0.67
45 0.61
46 0.54
47 0.46
48 0.42
49 0.33
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.18
54 0.13
55 0.17
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.11
64 0.19
65 0.2
66 0.24
67 0.34
68 0.4
69 0.43
70 0.46
71 0.49
72 0.47
73 0.5
74 0.5
75 0.44
76 0.44
77 0.48
78 0.5
79 0.5
80 0.46
81 0.42
82 0.4
83 0.39
84 0.37
85 0.34
86 0.34
87 0.35
88 0.36
89 0.41
90 0.45
91 0.42
92 0.4
93 0.36
94 0.32
95 0.33
96 0.32
97 0.3
98 0.28
99 0.29
100 0.3
101 0.3
102 0.3
103 0.26
104 0.32
105 0.33
106 0.31
107 0.37
108 0.41
109 0.49
110 0.54
111 0.62
112 0.63
113 0.65
114 0.66
115 0.69
116 0.72
117 0.72
118 0.77
119 0.78
120 0.79
121 0.8
122 0.83
123 0.8
124 0.82
125 0.82
126 0.79
127 0.76
128 0.74
129 0.69
130 0.65
131 0.65
132 0.55
133 0.5
134 0.48
135 0.42
136 0.39
137 0.38
138 0.4
139 0.34
140 0.38
141 0.38
142 0.34
143 0.36
144 0.36
145 0.43
146 0.39
147 0.4
148 0.41
149 0.42
150 0.44
151 0.42
152 0.38
153 0.28
154 0.29
155 0.3
156 0.24
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.22
162 0.21
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.2
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.28
175 0.32
176 0.39
177 0.42
178 0.37
179 0.35
180 0.37
181 0.44
182 0.41
183 0.4
184 0.35
185 0.3
186 0.28
187 0.26
188 0.23
189 0.18
190 0.18
191 0.16
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.19
210 0.2
211 0.2
212 0.22
213 0.25
214 0.3
215 0.3
216 0.27
217 0.29