Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SWW6

Protein Details
Accession A0A397SWW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-53IKPPSPTPVKVERRGRPRKSDHNEEVTNHydrophilic
141-163LQTPRNTRPRKWIRRKVVIKTTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-43RRGRPR
Subcellular Location(s) nucl 9, plas 8, cyto_nucl 6.5, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027951  Nepro_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF14780  DUF4477  
Amino Acid Sequences MVIKRKLRNSAANTSTPVPEVKPEEIKPPSPTPVKVERRGRPRKSDHNEEVTNDRPVKASRSTETFKIIPFNPKGTSSKGKEKETVYSPTDLPSEPVYNEPVQNFEPNFVTHPEAPVFYPLSQQQIPSLQGVPPTFSGNILQTPRNTRPRKWIRRKVVIKTTGAEIAVPVWYSNEPKQLNNYYQLSAQVFTFHKNELWDEANILERLYYKNKNQHQRAGYFRKIIEVRKVLKRIKEMEINELMSEFMGTFYSTKIGKIRSTWDQVPSQEMVIFIMNRLIGIVLLMNKALNIYSDAFNTFNILLRQTEFMSFALACLAILARLNILTRVILEEIKRCYGLLRNWVECFPRSSQTGTTNEINKLPESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.51
3 0.43
4 0.37
5 0.28
6 0.28
7 0.29
8 0.3
9 0.34
10 0.35
11 0.42
12 0.45
13 0.48
14 0.49
15 0.49
16 0.51
17 0.49
18 0.5
19 0.48
20 0.54
21 0.59
22 0.62
23 0.67
24 0.68
25 0.74
26 0.83
27 0.84
28 0.83
29 0.84
30 0.85
31 0.84
32 0.86
33 0.84
34 0.82
35 0.77
36 0.7
37 0.67
38 0.59
39 0.57
40 0.48
41 0.4
42 0.33
43 0.32
44 0.33
45 0.33
46 0.35
47 0.32
48 0.38
49 0.41
50 0.41
51 0.45
52 0.41
53 0.36
54 0.37
55 0.36
56 0.38
57 0.37
58 0.38
59 0.35
60 0.38
61 0.39
62 0.4
63 0.46
64 0.43
65 0.5
66 0.54
67 0.56
68 0.57
69 0.57
70 0.56
71 0.52
72 0.52
73 0.44
74 0.4
75 0.36
76 0.33
77 0.32
78 0.26
79 0.23
80 0.2
81 0.19
82 0.16
83 0.18
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.23
91 0.21
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.2
98 0.17
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.19
115 0.19
116 0.14
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.11
126 0.15
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.24
131 0.31
132 0.4
133 0.43
134 0.41
135 0.5
136 0.6
137 0.69
138 0.74
139 0.77
140 0.76
141 0.83
142 0.88
143 0.86
144 0.84
145 0.78
146 0.69
147 0.59
148 0.51
149 0.42
150 0.34
151 0.25
152 0.15
153 0.1
154 0.09
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.08
160 0.1
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.23
165 0.25
166 0.27
167 0.29
168 0.3
169 0.24
170 0.23
171 0.24
172 0.2
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.15
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.15
195 0.19
196 0.21
197 0.3
198 0.38
199 0.48
200 0.51
201 0.57
202 0.57
203 0.58
204 0.63
205 0.62
206 0.59
207 0.53
208 0.48
209 0.46
210 0.45
211 0.42
212 0.4
213 0.38
214 0.4
215 0.44
216 0.51
217 0.49
218 0.5
219 0.53
220 0.51
221 0.49
222 0.51
223 0.45
224 0.43
225 0.43
226 0.39
227 0.33
228 0.28
229 0.23
230 0.15
231 0.14
232 0.08
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.13
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.24
246 0.29
247 0.34
248 0.36
249 0.37
250 0.38
251 0.37
252 0.38
253 0.34
254 0.28
255 0.22
256 0.19
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.16
285 0.14
286 0.15
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.17
292 0.16
293 0.17
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.21
319 0.24
320 0.26
321 0.26
322 0.23
323 0.25
324 0.29
325 0.32
326 0.37
327 0.4
328 0.42
329 0.44
330 0.48
331 0.49
332 0.43
333 0.42
334 0.37
335 0.34
336 0.32
337 0.33
338 0.35
339 0.38
340 0.41
341 0.42
342 0.44
343 0.44
344 0.45
345 0.45
346 0.42