Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T417

Protein Details
Accession A0A397T417    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-165NNNNNRASNKWSNKKSSKDSKRLKKFSNLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MISMYSQPSSFVHQKTSDTINKLNSLNQNNNNNGNLNEQTQVQQSCSTGSACNKAPHSNTTTSNFNNKISNSKSHHNSLFRNTSQSTSTTTASTTDQQRNHHLQFPSNTCGNNCRQNFNGNSSYVKTENMGRTTNNNNNRASNKWSNKKSSKDSKRLKKFSNLLSIEILLSDFLQRKKLNYDDSDDSDSEFKKDSWDASIWRLYTKAKDILPEGIRLENYSWRMMAIASKRKSEGTEQSGRQLPKNNSRANNKNVVPNSTINKIPENKQNKVGSINERSNDPDDVFEQFDVEMEDTLSNNNRNLPAGIDNSDNEKYENIYLVDSPSDTCASNTTDDTIYTSSPSPVLPSSTTSAIPIPTTTTTTTAYTVSSTPPDFGFNFNNEFGFTNQSHNSLSRRNFVPGKPSNIQSRPIAIPVSRANNTPHMNFKKNQRQKSTSYVPVSQISSITIPSDTADDSDTELSDSQFTYSTYGAFDNQSIDYSGNTSALMSSSAPHSFNYFGDLASPGGMNNTNPLTYPSTASTPITPVDSGFYFPDYSGPGDISAGDSTSGSLFDMVNIFYVTHPNNSSLSHVNPSQLLSTSPTSISYDLMSESMCADESDSKDKISNSMEYDHQASWNRDCGDGNSDDDDDDDDNTVPGGNNNVNSTSKIKRHSMVSSSNVDTGVANKNISLPTSEGSGTGSLSSGLISPGKRPRSSSRASLTNTSVNNSGPTKNINNSSSPPSPTISKDVGGNNNNNPSSKNTIPTTCTNCHTQTTPLWRRNPEGQPLCNACGLFLKLHGVVRPLSLKTDVIKKRNRGGAAAAGKNPNKNGVKGTVQIGHSGASMSVMGKRMSMTTSMNSRQGAMNTPASNSVLSTSAPTAAHYTNGSFTRQSIPGAVPKRQRRFSSDEQQLLNAQQIRHQPSQMNDIHNLMKHSSSSLSGSNGCEQPSLARAQTRMANSTASSNNPPQSLRQFQQPSTSSASTNSIPKTTTNKSHPRLQRAHTTASILNTSSSNNSSSPPTSTSNNRSTTNNNRTSSNNNNNSWSSSRQYIPPSVYMYAWPDQQMVSPDDDSMIMYPTRPGMLIQHQPQSSISDDESVGSETTNKETAMDINY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.48
4 0.47
5 0.45
6 0.48
7 0.47
8 0.49
9 0.48
10 0.5
11 0.51
12 0.52
13 0.55
14 0.59
15 0.62
16 0.62
17 0.65
18 0.61
19 0.54
20 0.47
21 0.43
22 0.37
23 0.31
24 0.27
25 0.24
26 0.24
27 0.28
28 0.28
29 0.24
30 0.24
31 0.22
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.21
36 0.24
37 0.28
38 0.31
39 0.37
40 0.38
41 0.43
42 0.45
43 0.47
44 0.49
45 0.49
46 0.49
47 0.47
48 0.51
49 0.49
50 0.54
51 0.51
52 0.47
53 0.47
54 0.43
55 0.47
56 0.45
57 0.5
58 0.47
59 0.53
60 0.56
61 0.59
62 0.65
63 0.64
64 0.65
65 0.65
66 0.68
67 0.61
68 0.61
69 0.54
70 0.49
71 0.44
72 0.4
73 0.36
74 0.31
75 0.3
76 0.25
77 0.24
78 0.23
79 0.24
80 0.28
81 0.31
82 0.35
83 0.39
84 0.42
85 0.5
86 0.57
87 0.58
88 0.59
89 0.53
90 0.52
91 0.55
92 0.57
93 0.54
94 0.48
95 0.46
96 0.41
97 0.45
98 0.44
99 0.46
100 0.43
101 0.42
102 0.41
103 0.48
104 0.49
105 0.5
106 0.49
107 0.41
108 0.42
109 0.39
110 0.41
111 0.34
112 0.31
113 0.26
114 0.28
115 0.32
116 0.33
117 0.33
118 0.3
119 0.35
120 0.43
121 0.51
122 0.52
123 0.52
124 0.51
125 0.55
126 0.57
127 0.55
128 0.55
129 0.56
130 0.58
131 0.62
132 0.67
133 0.71
134 0.76
135 0.8
136 0.82
137 0.83
138 0.83
139 0.84
140 0.87
141 0.87
142 0.9
143 0.91
144 0.87
145 0.86
146 0.83
147 0.8
148 0.8
149 0.7
150 0.62
151 0.55
152 0.49
153 0.38
154 0.31
155 0.23
156 0.12
157 0.1
158 0.11
159 0.14
160 0.15
161 0.22
162 0.23
163 0.25
164 0.31
165 0.36
166 0.4
167 0.39
168 0.45
169 0.43
170 0.47
171 0.5
172 0.43
173 0.4
174 0.36
175 0.33
176 0.28
177 0.24
178 0.19
179 0.18
180 0.2
181 0.19
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.26
186 0.31
187 0.28
188 0.27
189 0.28
190 0.26
191 0.27
192 0.3
193 0.3
194 0.27
195 0.3
196 0.31
197 0.37
198 0.36
199 0.35
200 0.31
201 0.28
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.23
206 0.23
207 0.21
208 0.2
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.2
213 0.23
214 0.3
215 0.32
216 0.34
217 0.36
218 0.37
219 0.39
220 0.4
221 0.4
222 0.38
223 0.44
224 0.43
225 0.48
226 0.53
227 0.52
228 0.49
229 0.49
230 0.48
231 0.5
232 0.57
233 0.59
234 0.61
235 0.68
236 0.73
237 0.71
238 0.72
239 0.65
240 0.64
241 0.59
242 0.55
243 0.49
244 0.46
245 0.43
246 0.37
247 0.38
248 0.31
249 0.35
250 0.35
251 0.36
252 0.41
253 0.45
254 0.45
255 0.51
256 0.51
257 0.47
258 0.48
259 0.48
260 0.47
261 0.47
262 0.49
263 0.41
264 0.4
265 0.41
266 0.39
267 0.35
268 0.28
269 0.22
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.16
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.21
298 0.22
299 0.2
300 0.18
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.15
324 0.14
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.12
334 0.11
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.2
367 0.19
368 0.19
369 0.17
370 0.18
371 0.16
372 0.17
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.18
377 0.19
378 0.2
379 0.22
380 0.24
381 0.26
382 0.28
383 0.29
384 0.32
385 0.36
386 0.35
387 0.41
388 0.39
389 0.44
390 0.41
391 0.43
392 0.46
393 0.44
394 0.46
395 0.38
396 0.37
397 0.3
398 0.29
399 0.27
400 0.19
401 0.2
402 0.21
403 0.25
404 0.22
405 0.23
406 0.24
407 0.29
408 0.31
409 0.29
410 0.35
411 0.36
412 0.39
413 0.41
414 0.49
415 0.53
416 0.6
417 0.66
418 0.65
419 0.64
420 0.64
421 0.69
422 0.66
423 0.62
424 0.57
425 0.52
426 0.46
427 0.43
428 0.39
429 0.31
430 0.24
431 0.18
432 0.14
433 0.12
434 0.1
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.13
486 0.12
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.15
509 0.13
510 0.12
511 0.12
512 0.11
513 0.1
514 0.08
515 0.09
516 0.08
517 0.09
518 0.08
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.15
556 0.14
557 0.15
558 0.15
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.09
575 0.08
576 0.08
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.04
584 0.05
585 0.07
586 0.09
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.15
591 0.15
592 0.17
593 0.17
594 0.18
595 0.16
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.2
600 0.17
601 0.18
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.23
606 0.22
607 0.21
608 0.21
609 0.19
610 0.19
611 0.18
612 0.18
613 0.15
614 0.14
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.09
619 0.08
620 0.08
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.07
628 0.07
629 0.08
630 0.09
631 0.11
632 0.11
633 0.13
634 0.17
635 0.2
636 0.23
637 0.27
638 0.29
639 0.29
640 0.32
641 0.34
642 0.35
643 0.35
644 0.36
645 0.36
646 0.34
647 0.32
648 0.28
649 0.25
650 0.2
651 0.17
652 0.17
653 0.14
654 0.13
655 0.12
656 0.14
657 0.14
658 0.14
659 0.13
660 0.09
661 0.09
662 0.11
663 0.11
664 0.09
665 0.1
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.07
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.07
676 0.08
677 0.13
678 0.2
679 0.25
680 0.26
681 0.3
682 0.36
683 0.42
684 0.45
685 0.48
686 0.46
687 0.48
688 0.5
689 0.49
690 0.45
691 0.43
692 0.39
693 0.34
694 0.29
695 0.22
696 0.23
697 0.21
698 0.19
699 0.15
700 0.18
701 0.19
702 0.22
703 0.27
704 0.26
705 0.27
706 0.29
707 0.34
708 0.33
709 0.32
710 0.3
711 0.27
712 0.27
713 0.27
714 0.29
715 0.24
716 0.22
717 0.23
718 0.26
719 0.31
720 0.33
721 0.34
722 0.33
723 0.38
724 0.38
725 0.35
726 0.32
727 0.29
728 0.31
729 0.29
730 0.3
731 0.27
732 0.29
733 0.32
734 0.37
735 0.39
736 0.36
737 0.37
738 0.37
739 0.36
740 0.35
741 0.33
742 0.3
743 0.29
744 0.37
745 0.44
746 0.47
747 0.51
748 0.51
749 0.54
750 0.6
751 0.6
752 0.59
753 0.56
754 0.5
755 0.51
756 0.52
757 0.49
758 0.42
759 0.36
760 0.26
761 0.23
762 0.22
763 0.15
764 0.13
765 0.13
766 0.13
767 0.14
768 0.15
769 0.14
770 0.13
771 0.15
772 0.18
773 0.16
774 0.17
775 0.17
776 0.17
777 0.18
778 0.27
779 0.32
780 0.38
781 0.45
782 0.48
783 0.54
784 0.59
785 0.58
786 0.49
787 0.45
788 0.46
789 0.45
790 0.43
791 0.4
792 0.4
793 0.41
794 0.42
795 0.39
796 0.39
797 0.34
798 0.32
799 0.31
800 0.29
801 0.31
802 0.31
803 0.34
804 0.3
805 0.29
806 0.29
807 0.26
808 0.22
809 0.18
810 0.16
811 0.12
812 0.08
813 0.07
814 0.07
815 0.09
816 0.1
817 0.1
818 0.1
819 0.11
820 0.11
821 0.12
822 0.14
823 0.14
824 0.15
825 0.22
826 0.25
827 0.28
828 0.27
829 0.28
830 0.27
831 0.27
832 0.28
833 0.25
834 0.27
835 0.24
836 0.25
837 0.25
838 0.24
839 0.22
840 0.18
841 0.15
842 0.11
843 0.1
844 0.11
845 0.1
846 0.12
847 0.12
848 0.13
849 0.15
850 0.14
851 0.16
852 0.15
853 0.15
854 0.17
855 0.19
856 0.2
857 0.17
858 0.18
859 0.22
860 0.22
861 0.22
862 0.2
863 0.21
864 0.27
865 0.31
866 0.36
867 0.4
868 0.49
869 0.58
870 0.62
871 0.64
872 0.63
873 0.67
874 0.69
875 0.7
876 0.7
877 0.66
878 0.6
879 0.58
880 0.53
881 0.45
882 0.41
883 0.34
884 0.25
885 0.24
886 0.3
887 0.35
888 0.36
889 0.39
890 0.37
891 0.36
892 0.45
893 0.45
894 0.41
895 0.36
896 0.37
897 0.37
898 0.35
899 0.35
900 0.27
901 0.24
902 0.2
903 0.2
904 0.18
905 0.16
906 0.17
907 0.17
908 0.18
909 0.19
910 0.21
911 0.25
912 0.25
913 0.24
914 0.22
915 0.2
916 0.19
917 0.2
918 0.21
919 0.18
920 0.19
921 0.19
922 0.22
923 0.28
924 0.29
925 0.29
926 0.26
927 0.26
928 0.24
929 0.28
930 0.27
931 0.26
932 0.28
933 0.31
934 0.33
935 0.34
936 0.34
937 0.34
938 0.4
939 0.43
940 0.4
941 0.45
942 0.47
943 0.47
944 0.55
945 0.52
946 0.48
947 0.47
948 0.46
949 0.37
950 0.34
951 0.36
952 0.29
953 0.33
954 0.31
955 0.25
956 0.25
957 0.28
958 0.33
959 0.37
960 0.43
961 0.47
962 0.55
963 0.58
964 0.67
965 0.72
966 0.74
967 0.75
968 0.72
969 0.73
970 0.68
971 0.69
972 0.61
973 0.57
974 0.49
975 0.44
976 0.41
977 0.31
978 0.27
979 0.22
980 0.21
981 0.2
982 0.19
983 0.18
984 0.17
985 0.19
986 0.22
987 0.23
988 0.24
989 0.25
990 0.27
991 0.3
992 0.38
993 0.44
994 0.47
995 0.5
996 0.5
997 0.5
998 0.55
999 0.6
1000 0.62
1001 0.63
1002 0.57
1003 0.55
1004 0.57
1005 0.61
1006 0.63
1007 0.63
1008 0.61
1009 0.55
1010 0.59
1011 0.58
1012 0.59
1013 0.55
1014 0.49
1015 0.43
1016 0.39
1017 0.39
1018 0.39
1019 0.43
1020 0.44
1021 0.43
1022 0.43
1023 0.42
1024 0.39
1025 0.37
1026 0.34
1027 0.33
1028 0.3
1029 0.29
1030 0.26
1031 0.23
1032 0.21
1033 0.23
1034 0.25
1035 0.22
1036 0.23
1037 0.21
1038 0.2
1039 0.2
1040 0.19
1041 0.17
1042 0.14
1043 0.15
1044 0.11
1045 0.11
1046 0.12
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.13
1051 0.16
1052 0.24
1053 0.33
1054 0.37
1055 0.44
1056 0.43
1057 0.44
1058 0.45
1059 0.42
1060 0.37
1061 0.31
1062 0.26
1063 0.21
1064 0.21
1065 0.2
1066 0.21
1067 0.19
1068 0.17
1069 0.13
1070 0.15
1071 0.14
1072 0.18
1073 0.19
1074 0.17
1075 0.16
1076 0.17