Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TC30

Protein Details
Accession A0A397TC30    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-103APQQPTHSNNNKRSQRRAQKQQQQLNSVHydrophilic
151-172HHTTNRRKKSSNKINRKKVDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-167RRKKSSNKINRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto_mito 7.166, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007330  MIT_dom  
IPR036181  MIT_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04212  MIT  
Amino Acid Sequences MFDTSTAAFYHGRSQNVKNVKGLFGTITPLLPSISNISLNYFQQQPSQQEVKLSSVETNLTDPITTAPTVPTAPTAPQQPTHSNNNKRSQRRAQKQQQQLNSVSATIAATAPQRVVAANIMGNVNSATAQPSKSSSTFTTASSSSHHHHHHHTTNRRKKSSNKINRKKVDDAITLSAFAVEEDNQGNHEVAIEYYLSAIESMLEALPIHTNQSRKDALKNKLRDFMDREGLTDDFMESTNASSAAKAAEREKGFRSSFINTSGISENIIQAAITSAVALKQSPIPDAISATVNYTMKKIQKIDQAYGLQDKAWEISRTGINMALEIDQQYNVHEKVGNALFTGIAAAMKAGIAYKDSPSYRELQRMRSEFQYATFKESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.45
3 0.52
4 0.54
5 0.5
6 0.49
7 0.46
8 0.42
9 0.39
10 0.32
11 0.24
12 0.25
13 0.2
14 0.18
15 0.16
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.17
23 0.17
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.23
30 0.26
31 0.31
32 0.31
33 0.36
34 0.39
35 0.36
36 0.37
37 0.39
38 0.36
39 0.33
40 0.3
41 0.23
42 0.21
43 0.21
44 0.18
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.16
62 0.2
63 0.21
64 0.25
65 0.3
66 0.34
67 0.37
68 0.46
69 0.53
70 0.58
71 0.64
72 0.7
73 0.75
74 0.75
75 0.79
76 0.8
77 0.81
78 0.82
79 0.85
80 0.85
81 0.86
82 0.89
83 0.88
84 0.84
85 0.79
86 0.71
87 0.63
88 0.52
89 0.42
90 0.32
91 0.24
92 0.17
93 0.11
94 0.09
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.17
123 0.2
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.21
131 0.18
132 0.23
133 0.26
134 0.26
135 0.31
136 0.37
137 0.43
138 0.49
139 0.57
140 0.62
141 0.68
142 0.75
143 0.75
144 0.72
145 0.73
146 0.75
147 0.76
148 0.76
149 0.78
150 0.79
151 0.84
152 0.87
153 0.84
154 0.77
155 0.71
156 0.66
157 0.58
158 0.5
159 0.43
160 0.36
161 0.3
162 0.25
163 0.2
164 0.13
165 0.1
166 0.08
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.17
200 0.21
201 0.21
202 0.29
203 0.36
204 0.42
205 0.49
206 0.56
207 0.54
208 0.58
209 0.58
210 0.54
211 0.51
212 0.46
213 0.45
214 0.38
215 0.35
216 0.3
217 0.29
218 0.25
219 0.19
220 0.15
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.17
236 0.18
237 0.21
238 0.23
239 0.28
240 0.28
241 0.28
242 0.3
243 0.27
244 0.28
245 0.28
246 0.27
247 0.21
248 0.23
249 0.22
250 0.19
251 0.17
252 0.15
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.2
283 0.23
284 0.28
285 0.29
286 0.31
287 0.39
288 0.43
289 0.45
290 0.47
291 0.45
292 0.42
293 0.43
294 0.37
295 0.29
296 0.25
297 0.22
298 0.17
299 0.19
300 0.17
301 0.14
302 0.18
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.21
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.15
319 0.16
320 0.16
321 0.15
322 0.22
323 0.25
324 0.24
325 0.19
326 0.19
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.09
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.08
340 0.1
341 0.12
342 0.19
343 0.2
344 0.22
345 0.24
346 0.3
347 0.33
348 0.41
349 0.43
350 0.45
351 0.54
352 0.57
353 0.58
354 0.56
355 0.56
356 0.47
357 0.48
358 0.5
359 0.41