Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T9P9

Protein Details
Accession A0A397T9P9    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-78EIKMNLGRKQQKDKNKDILKSHydrophilic
364-385EFGPQHSPRIQRKPKQLDKALWHydrophilic
485-507ASSTRSRRSSLPPRQRIRQSSIAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSREEVTVADSQQTTSTNRESREIPISTTAPKKSASHPSLQAQQSQNEQNLTAESSQEIKMNLGRKQQKDKNKDILKSNNAYQSVSGKDIINNNKSANNGNTSTTASNVINSGGVDENSNVSFNNDSNISGGDTGHDPFQENGVSIPRRQSMNDNSQRLLKSHSMHQRHNSTPISSSISLITTNTSISSSPPSSPSSSSNNDNNNNIDNTNPDNTNNTNTSTTTSTNATYSNGINMPSQIYEETPQMSYPNMNPSTPFMPVPSQYFTPFFPNNGQYFYDPQYNRFGRPPHQIPPSAQQTFVRSNVYPYHQIPVIPPMHPPPYHSPSPLISHQSLPARYLNPSSAGGDSGFSSRRSSLDQVRTPEFGPQHSPRIQRKPKQLDKALWVGNLPDSTTYDELKEFFADVNMESVFHIKKSNCAFVNYKTYDAVMEAVHKYNDMEFKGIKLVCRPRKQTPADLKLKTESLSDLISENTPPPTPSEAGSTASSTRSRRSSLPPRQRIRQSSIASMSPASSVSSLKPSSQNRYFILKSLTQDDLDISVKSGYWATQPHNEAALNKAFKVDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.3
4 0.31
5 0.33
6 0.36
7 0.36
8 0.39
9 0.44
10 0.41
11 0.36
12 0.36
13 0.37
14 0.4
15 0.45
16 0.42
17 0.36
18 0.38
19 0.39
20 0.4
21 0.49
22 0.47
23 0.47
24 0.51
25 0.55
26 0.6
27 0.6
28 0.6
29 0.53
30 0.52
31 0.52
32 0.51
33 0.48
34 0.4
35 0.38
36 0.32
37 0.29
38 0.28
39 0.21
40 0.17
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.2
48 0.25
49 0.29
50 0.36
51 0.43
52 0.49
53 0.59
54 0.66
55 0.72
56 0.75
57 0.8
58 0.81
59 0.8
60 0.79
61 0.78
62 0.79
63 0.77
64 0.73
65 0.69
66 0.66
67 0.58
68 0.53
69 0.45
70 0.4
71 0.34
72 0.31
73 0.27
74 0.21
75 0.23
76 0.3
77 0.36
78 0.36
79 0.36
80 0.36
81 0.36
82 0.37
83 0.38
84 0.34
85 0.31
86 0.28
87 0.28
88 0.28
89 0.28
90 0.27
91 0.24
92 0.24
93 0.18
94 0.17
95 0.16
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.22
134 0.24
135 0.24
136 0.26
137 0.32
138 0.33
139 0.43
140 0.5
141 0.5
142 0.47
143 0.51
144 0.51
145 0.44
146 0.41
147 0.35
148 0.29
149 0.34
150 0.42
151 0.44
152 0.49
153 0.55
154 0.58
155 0.55
156 0.6
157 0.54
158 0.45
159 0.41
160 0.37
161 0.36
162 0.28
163 0.27
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.22
182 0.24
183 0.26
184 0.28
185 0.32
186 0.35
187 0.4
188 0.4
189 0.4
190 0.39
191 0.35
192 0.33
193 0.28
194 0.22
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.17
201 0.18
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.18
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.17
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.16
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.17
253 0.16
254 0.2
255 0.19
256 0.18
257 0.19
258 0.22
259 0.21
260 0.22
261 0.22
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.26
266 0.22
267 0.23
268 0.29
269 0.29
270 0.3
271 0.31
272 0.31
273 0.28
274 0.36
275 0.38
276 0.36
277 0.39
278 0.39
279 0.38
280 0.42
281 0.45
282 0.38
283 0.35
284 0.3
285 0.3
286 0.3
287 0.3
288 0.26
289 0.18
290 0.2
291 0.22
292 0.23
293 0.23
294 0.21
295 0.22
296 0.2
297 0.2
298 0.18
299 0.22
300 0.21
301 0.17
302 0.18
303 0.19
304 0.22
305 0.22
306 0.25
307 0.26
308 0.3
309 0.32
310 0.32
311 0.31
312 0.29
313 0.33
314 0.32
315 0.29
316 0.24
317 0.23
318 0.26
319 0.28
320 0.27
321 0.24
322 0.24
323 0.21
324 0.21
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.17
329 0.16
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.19
343 0.25
344 0.32
345 0.36
346 0.39
347 0.41
348 0.41
349 0.38
350 0.39
351 0.32
352 0.25
353 0.27
354 0.26
355 0.31
356 0.35
357 0.42
358 0.46
359 0.56
360 0.64
361 0.65
362 0.73
363 0.77
364 0.8
365 0.82
366 0.81
367 0.75
368 0.7
369 0.69
370 0.6
371 0.5
372 0.41
373 0.32
374 0.27
375 0.22
376 0.17
377 0.11
378 0.1
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.15
400 0.14
401 0.2
402 0.24
403 0.31
404 0.3
405 0.34
406 0.37
407 0.37
408 0.47
409 0.42
410 0.39
411 0.32
412 0.31
413 0.26
414 0.24
415 0.2
416 0.11
417 0.13
418 0.13
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.2
425 0.17
426 0.18
427 0.17
428 0.18
429 0.24
430 0.24
431 0.23
432 0.27
433 0.36
434 0.43
435 0.52
436 0.57
437 0.6
438 0.69
439 0.73
440 0.75
441 0.75
442 0.76
443 0.76
444 0.72
445 0.67
446 0.6
447 0.57
448 0.47
449 0.37
450 0.28
451 0.21
452 0.19
453 0.16
454 0.14
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.16
463 0.19
464 0.19
465 0.19
466 0.23
467 0.23
468 0.25
469 0.26
470 0.25
471 0.22
472 0.24
473 0.28
474 0.25
475 0.29
476 0.3
477 0.32
478 0.35
479 0.44
480 0.52
481 0.58
482 0.67
483 0.72
484 0.76
485 0.82
486 0.87
487 0.84
488 0.8
489 0.79
490 0.71
491 0.68
492 0.65
493 0.57
494 0.49
495 0.42
496 0.35
497 0.26
498 0.22
499 0.16
500 0.13
501 0.12
502 0.13
503 0.19
504 0.2
505 0.22
506 0.31
507 0.36
508 0.44
509 0.5
510 0.53
511 0.5
512 0.57
513 0.54
514 0.51
515 0.5
516 0.45
517 0.42
518 0.41
519 0.4
520 0.32
521 0.32
522 0.28
523 0.25
524 0.22
525 0.2
526 0.16
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.11
532 0.14
533 0.19
534 0.22
535 0.3
536 0.33
537 0.34
538 0.37
539 0.38
540 0.35
541 0.35
542 0.39
543 0.33
544 0.3