Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T7I7

Protein Details
Accession A0A397T7I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38AASRRRARVNFNKKKAEDRKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-25RAR
29-32NKKK
Subcellular Location(s) mito 7.5, cyto_mito 5.833, nucl 5.5, pero 5, cyto_nucl 4.833, cyto 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013760  Topo_IIA-like_dom_sf  
IPR013758  Topo_IIA_A/C_ab  
IPR013759  Topo_IIA_B_C  
IPR002205  Topo_IIA_dom_A  
IPR001154  TopoII_euk  
IPR031660  TOPRIM_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF00521  DNA_topoisoIV  
PF16898  TOPRIM_C  
Amino Acid Sequences MMHIHDFTSYFYITRDLAASRRRARVNFNKKKAEDRKEWLKNYEPGTFMNHDVNEITITDFMIKELIELKIYKNFKNKIKVSLLAGAVLEQAAYHHGDAGLQQTIIAMAHDFVDSNNINVLHGEGQFGTRAQGGKDAASARYTCVTIPALTRNIFHRIAYLIVMMTVSWSLFIPNYNPRDIVNNLKRLINDEEPIPMHPWYRGFQGDIEQINMEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.2
5 0.26
6 0.34
7 0.39
8 0.46
9 0.5
10 0.52
11 0.6
12 0.65
13 0.7
14 0.72
15 0.75
16 0.77
17 0.74
18 0.82
19 0.82
20 0.8
21 0.77
22 0.74
23 0.76
24 0.76
25 0.77
26 0.72
27 0.68
28 0.65
29 0.61
30 0.56
31 0.47
32 0.38
33 0.39
34 0.36
35 0.31
36 0.29
37 0.25
38 0.21
39 0.2
40 0.19
41 0.15
42 0.13
43 0.11
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.18
58 0.21
59 0.24
60 0.3
61 0.36
62 0.41
63 0.5
64 0.51
65 0.51
66 0.53
67 0.51
68 0.46
69 0.44
70 0.37
71 0.28
72 0.26
73 0.18
74 0.14
75 0.12
76 0.09
77 0.04
78 0.03
79 0.04
80 0.05
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.03
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.13
135 0.16
136 0.18
137 0.18
138 0.2
139 0.2
140 0.24
141 0.24
142 0.23
143 0.2
144 0.18
145 0.18
146 0.17
147 0.14
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.1
161 0.18
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.28
167 0.3
168 0.38
169 0.38
170 0.42
171 0.42
172 0.44
173 0.43
174 0.43
175 0.46
176 0.39
177 0.33
178 0.27
179 0.29
180 0.28
181 0.3
182 0.28
183 0.23
184 0.2
185 0.21
186 0.23
187 0.21
188 0.25
189 0.25
190 0.24
191 0.25
192 0.29
193 0.33
194 0.31
195 0.3