FuNGI

A0A397TNL4

Protein Details

Accession

A0A397TNL4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-34	EQRIIRELEKKKKEAEKKAKEATVE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-29	EKKKKEAEKKAK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MREAELEREEQRIIRELEKKKKEAEKKAKEATVEQATTQKKRRWDMETPVELKQTSEWSKADDESSVGKSRWDETPRASEDIGMDTPRKRSRWDVTPQVSAKKSRWDETPTHPVAQIGATPVGNLGLLTPTPGHLMPMTPEAQRWEKDLDARNRPLSDEELDAMFPSTGYKILDPPAGYVPIRTPARKLMATPTPMADGFVMLEEDRTQNYDLPAEIPGVGNLPFFKQEDMQHFGKLLEDKDESELSVEELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDKARDFGAGPLFNQILPLLMSQNLEDQERHLLVKVIDRILYKLDALVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYFARCEGREIISNLSKAAGLPTMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASAHGIPALLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAVLPHLKNLVEAIAHGLEDEQQKVRTITALAIAALAEAAAPYGIESFDSVLKPLWTGIRKHRGKGLAAFLKAIGYIIPLMDAEYANYYTKEVMIILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCAATDGVQPHYIKEEILPEFFKNFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKVGVTEIVGRIVEDLKDESEPYRKMVMETVEKVVSQLGAADIDTRLEEVLIDGILYAFQEQTVEDIVMLNGFGTVVNALGLRVKPYLQQITSTILWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAVVMKTCGEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGGLKSIVNVIGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQESCIDLVGRIADRGAEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTACTTVKHMSLGVFGLGCEDALLHLLNYVWPNIFETSPHVINAVMEAIEGLRVALGPTTVLQYVLQGLFHPARKVREIYWKIYNNLYIGAQDALIPYYPRIEDDERNNYERYELSMWL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.41
3	0.48
4	0.58
5	0.65
6	0.66
7	0.68
8	0.76
9	0.78
10	0.8
11	0.82
12	0.82
13	0.83
14	0.87
15	0.82
16	0.75
17	0.68
18	0.65
19	0.62
20	0.53
21	0.44
22	0.43
23	0.46
24	0.52
25	0.57
26	0.54
27	0.53
28	0.6
29	0.66
30	0.66
31	0.68
32	0.7
33	0.72
34	0.76
35	0.71
36	0.67
37	0.63
38	0.55
39	0.47
40	0.39
41	0.37
42	0.32
43	0.34
44	0.31
45	0.31
46	0.34
47	0.35
48	0.33
49	0.26
50	0.23
51	0.22
52	0.26
53	0.27
54	0.24
55	0.25
56	0.25
57	0.27
58	0.34
59	0.34
60	0.34
61	0.36
62	0.45
63	0.47
64	0.48
65	0.46
66	0.39
67	0.35
68	0.36
69	0.32
70	0.25
71	0.25
72	0.24
73	0.33
74	0.38
75	0.38
76	0.38
77	0.44
78	0.5
79	0.55
80	0.62
81	0.65
82	0.64
83	0.71
84	0.71
85	0.7
86	0.67
87	0.63
88	0.56
89	0.56
90	0.55
91	0.5
92	0.52
93	0.5
94	0.51
95	0.55
96	0.62
97	0.56
98	0.53
99	0.49
100	0.43
101	0.38
102	0.33
103	0.26
104	0.18
105	0.16
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.12
110	0.11
111	0.09
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.11
119	0.11
120	0.12
121	0.11
122	0.12
123	0.13
124	0.17
125	0.19
126	0.17
127	0.19
128	0.22
129	0.27
130	0.27
131	0.28
132	0.28
133	0.28
134	0.35
135	0.43
136	0.46
137	0.5
138	0.55
139	0.57
140	0.54
141	0.53
142	0.49
143	0.43
144	0.36
145	0.3
146	0.25
147	0.21
148	0.2
149	0.19
150	0.17
151	0.13
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.12
159	0.15
160	0.18
161	0.18
162	0.19
163	0.21
164	0.23
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.25
169	0.29
170	0.27
171	0.27
172	0.31
173	0.36
174	0.36
175	0.36
176	0.35
177	0.39
178	0.41
179	0.4
180	0.35
181	0.31
182	0.3
183	0.29
184	0.21
185	0.14
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.14
198	0.15
199	0.14
200	0.14
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.1
205	0.09
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.11
212	0.11
213	0.13
214	0.15
215	0.19
216	0.24
217	0.29
218	0.29
219	0.28
220	0.28
221	0.27
222	0.27
223	0.25
224	0.2
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.21
229	0.21
230	0.18
231	0.16
232	0.15
233	0.12
234	0.15
235	0.14
236	0.14
237	0.16
238	0.17
239	0.2
240	0.21
241	0.22
242	0.23
243	0.28
244	0.3
245	0.38
246	0.45
247	0.48
248	0.54
249	0.54
250	0.52
251	0.53
252	0.53
253	0.5
254	0.5
255	0.48
256	0.48
257	0.5
258	0.49
259	0.47
260	0.52
261	0.54
262	0.5
263	0.48
264	0.48
265	0.52
266	0.58
267	0.56
268	0.46
269	0.38
270	0.35
271	0.33
272	0.31
273	0.28
274	0.21
275	0.19
276	0.2
277	0.2
278	0.19
279	0.19
280	0.15
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.12
289	0.12
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.13
297	0.15
298	0.14
299	0.2
300	0.21
301	0.19
302	0.21
303	0.21
304	0.21
305	0.2
306	0.2
307	0.15
308	0.14
309	0.16
310	0.15
311	0.17
312	0.19
313	0.18
314	0.19
315	0.22
316	0.22
317	0.18
318	0.16
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.14
323	0.12
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.07
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.11
340	0.14
341	0.15
342	0.2
343	0.23
344	0.23
345	0.22
346	0.2
347	0.18
348	0.14
349	0.14
350	0.09
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.07
358	0.08
359	0.09
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.13
367	0.14
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.13
372	0.13
373	0.14
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.08
395	0.1
396	0.16
397	0.21
398	0.25
399	0.28
400	0.37
401	0.46
402	0.54
403	0.61
404	0.62
405	0.65
406	0.68
407	0.73
408	0.67
409	0.62
410	0.55
411	0.51
412	0.47
413	0.39
414	0.33
415	0.24
416	0.22
417	0.17
418	0.14
419	0.09
420	0.06
421	0.04
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.08
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.08
454	0.07
455	0.07
456	0.06
457	0.05
458	0.04
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.11
478	0.13
479	0.16
480	0.24
481	0.34
482	0.36
483	0.38
484	0.42
485	0.41
486	0.4
487	0.4
488	0.4
489	0.34
490	0.33
491	0.32
492	0.27
493	0.23
494	0.21
495	0.17
496	0.09
497	0.04
498	0.04
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.1
525	0.11
526	0.12
527	0.12
528	0.12
529	0.12
530	0.13
531	0.14
532	0.13
533	0.15
534	0.15
535	0.16
536	0.21
537	0.27
538	0.29
539	0.27
540	0.27
541	0.26
542	0.26
543	0.24
544	0.21
545	0.18
546	0.16
547	0.18
548	0.18
549	0.17
550	0.16
551	0.16
552	0.12
553	0.11
554	0.14
555	0.12
556	0.14
557	0.15
558	0.13
559	0.14
560	0.14
561	0.16
562	0.16
563	0.16
564	0.17
565	0.2
566	0.2
567	0.22
568	0.3
569	0.34
570	0.37
571	0.45
572	0.48
573	0.49
574	0.56
575	0.53
576	0.46
577	0.44
578	0.38
579	0.33
580	0.29
581	0.24
582	0.19
583	0.2
584	0.19
585	0.14
586	0.13
587	0.09
588	0.08
589	0.08
590	0.06
591	0.04
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.09
607	0.13
608	0.14
609	0.15
610	0.17
611	0.17
612	0.17
613	0.19
614	0.21
615	0.21
616	0.22
617	0.22
618	0.2
619	0.2
620	0.19
621	0.17
622	0.13
623	0.08
624	0.07
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.04
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.04
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.04
667	0.06
668	0.06
669	0.08
670	0.08
671	0.09
672	0.11
673	0.16
674	0.2
675	0.18
676	0.2
677	0.2
678	0.24
679	0.25
680	0.24
681	0.21
682	0.19
683	0.2
684	0.22
685	0.25
686	0.28
687	0.32
688	0.33
689	0.4
690	0.44
691	0.51
692	0.54
693	0.54
694	0.48
695	0.47
696	0.48
697	0.42
698	0.39
699	0.31
700	0.25
701	0.2
702	0.18
703	0.14
704	0.12
705	0.1
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.08
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.15
716	0.16
717	0.15
718	0.14
719	0.15
720	0.14
721	0.13
722	0.13
723	0.07
724	0.04
725	0.04
726	0.05
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.04
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.04
748	0.04
749	0.04
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.06
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.1
758	0.1
759	0.12
760	0.13
761	0.16
762	0.19
763	0.21
764	0.23
765	0.25
766	0.29
767	0.31
768	0.36
769	0.44
770	0.45
771	0.5
772	0.52
773	0.58
774	0.56
775	0.57
776	0.55
777	0.54
778	0.5
779	0.47
780	0.44
781	0.37
782	0.33
783	0.29
784	0.24
785	0.17
786	0.14
787	0.09
788	0.09
789	0.08
790	0.08
791	0.09
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.09
797	0.11
798	0.11
799	0.13
800	0.13
801	0.13
802	0.16
803	0.17
804	0.17
805	0.15
806	0.15
807	0.17
808	0.17
809	0.18
810	0.15
811	0.17
812	0.21
813	0.21
814	0.23
815	0.21
816	0.26
817	0.32
818	0.41
819	0.47
820	0.47
821	0.53
822	0.58
823	0.65
824	0.61
825	0.53
826	0.45
827	0.36
828	0.33
829	0.27
830	0.19
831	0.12
832	0.12
833	0.12
834	0.11
835	0.11
836	0.1
837	0.1
838	0.1
839	0.09
840	0.07
841	0.07
842	0.08
843	0.11
844	0.11
845	0.12
846	0.12
847	0.14
848	0.18
849	0.24
850	0.31
851	0.37
852	0.43
853	0.5
854	0.51
855	0.52
856	0.49
857	0.43
858	0.37
859	0.32
860	0.26
861	0.19
862	0.16
863	0.13
864	0.12
865	0.12
866	0.08
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.05
871	0.05
872	0.06
873	0.09
874	0.09
875	0.1
876	0.11
877	0.15
878	0.16
879	0.17
880	0.17
881	0.16
882	0.17
883	0.17
884	0.19
885	0.2
886	0.22
887	0.25
888	0.25
889	0.24
890	0.27
891	0.26
892	0.25
893	0.19
894	0.16
895	0.14
896	0.14
897	0.14
898	0.1
899	0.11
900	0.1
901	0.11
902	0.12
903	0.12
904	0.12
905	0.11
906	0.11
907	0.11
908	0.1
909	0.09
910	0.08
911	0.08
912	0.07
913	0.08
914	0.07
915	0.08
916	0.08
917	0.08
918	0.08
919	0.07
920	0.06
921	0.07
922	0.1
923	0.09
924	0.09
925	0.09
926	0.11
927	0.15
928	0.16
929	0.19
930	0.17
931	0.18
932	0.21
933	0.27
934	0.27
935	0.25
936	0.28
937	0.29
938	0.29
939	0.29
940	0.28
941	0.22
942	0.21
943	0.2
944	0.16
945	0.13
946	0.11
947	0.11
948	0.1
949	0.09
950	0.07
951	0.06
952	0.05
953	0.06
954	0.07
955	0.05
956	0.06
957	0.06
958	0.09
959	0.1
960	0.11
961	0.11
962	0.11
963	0.14
964	0.15
965	0.16
966	0.14
967	0.19
968	0.23
969	0.24
970	0.24
971	0.21
972	0.19
973	0.19
974	0.2
975	0.15
976	0.09
977	0.07
978	0.07
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.05
983	0.04
984	0.04
985	0.05
986	0.05
987	0.05
988	0.06
989	0.06
990	0.09
991	0.09
992	0.1
993	0.1
994	0.1
995	0.14
996	0.14
997	0.13
998	0.11
999	0.17
1000	0.21
1001	0.24
1002	0.29
1003	0.3
1004	0.34
1005	0.39
1006	0.42
1007	0.42
1008	0.48
1009	0.51
1010	0.52
1011	0.57
1012	0.59
1013	0.56
1014	0.58
1015	0.55
1016	0.45
1017	0.42
1018	0.36
1019	0.26
1020	0.22
1021	0.19
1022	0.14
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.11
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.14
1030	0.15
1031	0.15
1032	0.21
1033	0.25
1034	0.31
1035	0.38
1036	0.48
1037	0.5
1038	0.53
1039	0.53
1040	0.47
1041	0.44
1042	0.38
1043	0.35

A0A397TNL4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer