Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TMT0

Protein Details
Accession A0A397TMT0    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27EITKMPASKSRKAPERPTTRASHydrophilic
121-143EESTNIKRDYRKQKRRADEIVIQHydrophilic
371-399NVSINSSRRKKEPRAKRLRRSNRESISETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-393RRKKEPRAKRLRRSNR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MNHGSEITKMPASKSRKAPERPTTRASTKTAHTNGDFAVKQRLRSYPNAVTPSSTASPATTRASSVESAREANHRKASSRTSTRSCHNNKSDGVVTRRSILQKEHIEDTEIIFDSHSSDDEESTNIKRDYRKQKRRADEIVIQFKSLKERMFISRLNDLDEENNAIQEGLHPTLSKQMDEIEEKHRALTLRAEKRRDHHKNAIETVFAAQEKQIRDEFLNDRHRLRTMMIEELEMKKSQLKREYYKKPEDNLLDLVMKKIEGTPFDPNYKVVNKGSDIRISSPVYTRLQNGHPRTPKTNIDIQYSQLFNLSFHPTGINEEEMAEDLMAMQLRKPIRPQLPPPQPLQISSSSHIHSITTVQSHPNIISSTSNVSINSSRRKKEPRAKRLRRSNRESISETRRETPIILAPKEFPKASLREMPKVPKAIHRDISSELLREPPKEVPRILSPKEIVLHRESPREQVMREVIRPREPPRELSREISKDLSIDTPRNSIVDRWLAEGPEDNDSDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.63
4 0.72
5 0.78
6 0.81
7 0.84
8 0.82
9 0.79
10 0.78
11 0.75
12 0.72
13 0.66
14 0.61
15 0.56
16 0.59
17 0.56
18 0.54
19 0.49
20 0.45
21 0.41
22 0.43
23 0.39
24 0.31
25 0.37
26 0.33
27 0.35
28 0.37
29 0.43
30 0.4
31 0.45
32 0.52
33 0.49
34 0.55
35 0.57
36 0.53
37 0.48
38 0.44
39 0.45
40 0.38
41 0.31
42 0.23
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.25
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.22
51 0.22
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.23
56 0.24
57 0.31
58 0.34
59 0.38
60 0.44
61 0.42
62 0.43
63 0.47
64 0.52
65 0.53
66 0.57
67 0.58
68 0.57
69 0.6
70 0.64
71 0.69
72 0.69
73 0.69
74 0.66
75 0.65
76 0.59
77 0.6
78 0.59
79 0.56
80 0.53
81 0.48
82 0.43
83 0.39
84 0.43
85 0.4
86 0.37
87 0.33
88 0.37
89 0.38
90 0.41
91 0.43
92 0.39
93 0.39
94 0.36
95 0.34
96 0.29
97 0.23
98 0.19
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.15
111 0.2
112 0.19
113 0.22
114 0.27
115 0.36
116 0.46
117 0.55
118 0.64
119 0.69
120 0.78
121 0.84
122 0.87
123 0.84
124 0.8
125 0.77
126 0.76
127 0.75
128 0.66
129 0.57
130 0.49
131 0.43
132 0.41
133 0.35
134 0.27
135 0.18
136 0.21
137 0.25
138 0.29
139 0.31
140 0.29
141 0.33
142 0.32
143 0.34
144 0.31
145 0.27
146 0.23
147 0.21
148 0.21
149 0.14
150 0.14
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.12
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.2
167 0.23
168 0.2
169 0.24
170 0.25
171 0.24
172 0.24
173 0.22
174 0.2
175 0.26
176 0.3
177 0.36
178 0.42
179 0.47
180 0.47
181 0.52
182 0.63
183 0.63
184 0.61
185 0.61
186 0.61
187 0.62
188 0.65
189 0.6
190 0.49
191 0.41
192 0.34
193 0.26
194 0.19
195 0.14
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.19
204 0.21
205 0.26
206 0.34
207 0.33
208 0.35
209 0.35
210 0.35
211 0.32
212 0.29
213 0.26
214 0.19
215 0.21
216 0.2
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.21
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.18
225 0.22
226 0.27
227 0.31
228 0.37
229 0.47
230 0.57
231 0.6
232 0.67
233 0.66
234 0.61
235 0.62
236 0.56
237 0.49
238 0.4
239 0.34
240 0.26
241 0.21
242 0.19
243 0.13
244 0.11
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.16
251 0.18
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.23
256 0.23
257 0.23
258 0.19
259 0.18
260 0.18
261 0.22
262 0.23
263 0.22
264 0.22
265 0.21
266 0.24
267 0.23
268 0.22
269 0.2
270 0.22
271 0.21
272 0.21
273 0.21
274 0.2
275 0.25
276 0.32
277 0.35
278 0.4
279 0.44
280 0.46
281 0.48
282 0.5
283 0.48
284 0.44
285 0.47
286 0.41
287 0.41
288 0.39
289 0.37
290 0.36
291 0.33
292 0.28
293 0.22
294 0.19
295 0.14
296 0.16
297 0.18
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.13
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.15
321 0.22
322 0.28
323 0.35
324 0.41
325 0.48
326 0.57
327 0.59
328 0.59
329 0.58
330 0.52
331 0.47
332 0.43
333 0.37
334 0.31
335 0.3
336 0.31
337 0.25
338 0.25
339 0.24
340 0.2
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.14
359 0.16
360 0.2
361 0.24
362 0.33
363 0.37
364 0.39
365 0.46
366 0.55
367 0.63
368 0.69
369 0.75
370 0.76
371 0.8
372 0.88
373 0.9
374 0.93
375 0.94
376 0.94
377 0.91
378 0.9
379 0.86
380 0.82
381 0.77
382 0.73
383 0.71
384 0.67
385 0.62
386 0.55
387 0.49
388 0.43
389 0.39
390 0.34
391 0.32
392 0.32
393 0.31
394 0.29
395 0.3
396 0.33
397 0.36
398 0.33
399 0.28
400 0.26
401 0.29
402 0.32
403 0.38
404 0.39
405 0.42
406 0.48
407 0.53
408 0.53
409 0.55
410 0.52
411 0.51
412 0.54
413 0.56
414 0.57
415 0.52
416 0.49
417 0.47
418 0.51
419 0.44
420 0.38
421 0.3
422 0.31
423 0.31
424 0.29
425 0.29
426 0.3
427 0.35
428 0.38
429 0.38
430 0.36
431 0.44
432 0.51
433 0.51
434 0.5
435 0.45
436 0.45
437 0.48
438 0.46
439 0.41
440 0.38
441 0.43
442 0.4
443 0.47
444 0.44
445 0.45
446 0.5
447 0.49
448 0.43
449 0.42
450 0.47
451 0.44
452 0.49
453 0.51
454 0.48
455 0.52
456 0.58
457 0.57
458 0.59
459 0.57
460 0.58
461 0.6
462 0.63
463 0.6
464 0.6
465 0.64
466 0.59
467 0.59
468 0.55
469 0.46
470 0.39
471 0.37
472 0.36
473 0.32
474 0.32
475 0.31
476 0.31
477 0.31
478 0.32
479 0.32
480 0.27
481 0.29
482 0.31
483 0.3
484 0.3
485 0.32
486 0.31
487 0.3
488 0.34
489 0.29
490 0.27