Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHD3

Protein Details
Accession A0A397SHD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPKHESKMRKKKPVWNHFKITGKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-11RKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003656  Znf_BED  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02892  zf-BED  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50808  ZF_BED  
Amino Acid Sequences MPKHESKMRKKKPVWNHFKITGKDDDRHPNVKCKYCFKSYQRAVPERMKDHLNECKEAPSYAKSQSNEALLVKVLISTHTPTSFVDNPYVIELFRQLRPSFKLPNREKLKTQILELMGGLKQHTYNNTSMMSSAIAPGDPLVPLFGTPSAGSEFGTSSAGAEFGTSSAGAEFATPSAGAEFDTPYAGAISKLTFIRQEDYVGCNPD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.88
3 0.85
4 0.83
5 0.83
6 0.76
7 0.7
8 0.68
9 0.63
10 0.58
11 0.57
12 0.58
13 0.56
14 0.59
15 0.57
16 0.57
17 0.6
18 0.65
19 0.64
20 0.62
21 0.62
22 0.62
23 0.69
24 0.65
25 0.69
26 0.66
27 0.69
28 0.7
29 0.69
30 0.69
31 0.67
32 0.68
33 0.6
34 0.57
35 0.5
36 0.43
37 0.43
38 0.46
39 0.41
40 0.36
41 0.33
42 0.34
43 0.32
44 0.31
45 0.28
46 0.22
47 0.22
48 0.25
49 0.3
50 0.27
51 0.28
52 0.3
53 0.29
54 0.27
55 0.24
56 0.2
57 0.14
58 0.13
59 0.1
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.16
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.11
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.15
83 0.14
84 0.17
85 0.21
86 0.24
87 0.3
88 0.32
89 0.41
90 0.4
91 0.5
92 0.55
93 0.54
94 0.52
95 0.5
96 0.54
97 0.45
98 0.42
99 0.36
100 0.3
101 0.28
102 0.25
103 0.21
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.12
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.16
181 0.18
182 0.21
183 0.21
184 0.24
185 0.23
186 0.28