Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TC09

Protein Details
Accession A0A397TC09    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-82VEIPSTKSKSKSKYRMRICDAPPHydrophilic
134-156VDEKRHRFRKNPYPKKAPSKSSPBasic
217-248RSSSSKKQITKTKTKTKRTKPIISERKRKGNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-151KRHRFRKNPYPKKAP
222-246KKQITKTKTKTKRTKPIISERKRKG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MSSDLFMQVPATTNDVKSFMTPLSPPLSPDSNIFKNTENTESSSSTTSPSSIINEQKINVEIPSTKSKSKSKYRMRICDAPPELLEMIKRSEKKNEKSLSDKSILPTVVKNVSTSSTSNGQITHIPNLHKITSVDEKRHRFRKNPYPKKAPSKSSPGITLQVDVYTPLKEDPRALLRRSDQSKSHHSISSINSFSSSFNDSSSGTESSSPYSPISHRSSSSKKQITKTKTKTKRTKPIISERKRKGNSLARVMADRGLLESTLTPIVVAGEIKPIRIPPPPPMQFDELMKNIEQLNLDLTMLNRITPKINWKGQPLSILHLPHYNSLHSKEAQVASTLRLTPVQYLTAKHTLISSARRYVQKSLPFRKSDAQKLLRIDVNKASKLWEFFMQVKWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.21
4 0.19
5 0.21
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.2
10 0.22
11 0.22
12 0.23
13 0.26
14 0.29
15 0.27
16 0.3
17 0.34
18 0.35
19 0.37
20 0.37
21 0.35
22 0.37
23 0.39
24 0.39
25 0.34
26 0.33
27 0.34
28 0.34
29 0.33
30 0.3
31 0.27
32 0.24
33 0.23
34 0.19
35 0.16
36 0.16
37 0.18
38 0.22
39 0.27
40 0.3
41 0.31
42 0.32
43 0.33
44 0.33
45 0.3
46 0.24
47 0.21
48 0.18
49 0.21
50 0.29
51 0.31
52 0.33
53 0.39
54 0.46
55 0.53
56 0.61
57 0.67
58 0.69
59 0.75
60 0.82
61 0.86
62 0.86
63 0.87
64 0.79
65 0.79
66 0.7
67 0.62
68 0.52
69 0.45
70 0.37
71 0.29
72 0.27
73 0.18
74 0.19
75 0.23
76 0.26
77 0.25
78 0.35
79 0.44
80 0.49
81 0.57
82 0.6
83 0.59
84 0.63
85 0.66
86 0.62
87 0.56
88 0.52
89 0.44
90 0.42
91 0.37
92 0.31
93 0.27
94 0.24
95 0.25
96 0.23
97 0.22
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.18
108 0.21
109 0.22
110 0.24
111 0.23
112 0.23
113 0.26
114 0.29
115 0.28
116 0.25
117 0.23
118 0.23
119 0.29
120 0.32
121 0.36
122 0.41
123 0.48
124 0.54
125 0.63
126 0.63
127 0.61
128 0.66
129 0.7
130 0.73
131 0.77
132 0.78
133 0.8
134 0.83
135 0.87
136 0.85
137 0.8
138 0.74
139 0.73
140 0.67
141 0.59
142 0.54
143 0.46
144 0.42
145 0.35
146 0.3
147 0.21
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.12
159 0.2
160 0.24
161 0.24
162 0.27
163 0.29
164 0.37
165 0.4
166 0.41
167 0.37
168 0.38
169 0.45
170 0.45
171 0.45
172 0.39
173 0.35
174 0.36
175 0.34
176 0.35
177 0.29
178 0.24
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.17
183 0.17
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.17
201 0.21
202 0.21
203 0.22
204 0.27
205 0.33
206 0.38
207 0.47
208 0.49
209 0.49
210 0.55
211 0.62
212 0.64
213 0.68
214 0.71
215 0.72
216 0.75
217 0.8
218 0.84
219 0.86
220 0.88
221 0.86
222 0.86
223 0.83
224 0.84
225 0.85
226 0.84
227 0.84
228 0.81
229 0.82
230 0.75
231 0.69
232 0.67
233 0.65
234 0.62
235 0.6
236 0.57
237 0.48
238 0.47
239 0.45
240 0.38
241 0.28
242 0.21
243 0.14
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.2
264 0.22
265 0.21
266 0.32
267 0.36
268 0.39
269 0.42
270 0.44
271 0.41
272 0.42
273 0.4
274 0.32
275 0.29
276 0.26
277 0.23
278 0.2
279 0.2
280 0.18
281 0.13
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.15
293 0.17
294 0.25
295 0.29
296 0.37
297 0.4
298 0.44
299 0.48
300 0.48
301 0.52
302 0.45
303 0.41
304 0.39
305 0.36
306 0.32
307 0.31
308 0.31
309 0.29
310 0.29
311 0.27
312 0.25
313 0.28
314 0.31
315 0.28
316 0.28
317 0.29
318 0.3
319 0.27
320 0.27
321 0.24
322 0.22
323 0.24
324 0.24
325 0.19
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.2
330 0.23
331 0.21
332 0.23
333 0.28
334 0.32
335 0.31
336 0.28
337 0.27
338 0.25
339 0.28
340 0.33
341 0.32
342 0.33
343 0.39
344 0.44
345 0.47
346 0.51
347 0.54
348 0.57
349 0.62
350 0.66
351 0.68
352 0.67
353 0.68
354 0.7
355 0.71
356 0.71
357 0.71
358 0.67
359 0.64
360 0.65
361 0.66
362 0.62
363 0.56
364 0.51
365 0.49
366 0.5
367 0.46
368 0.42
369 0.4
370 0.4
371 0.4
372 0.39
373 0.35
374 0.32
375 0.33