Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SYX6

Protein Details
Accession A0A397SYX6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29SEKALNSKRAKRQTATKPNYFHydrophilic
224-249AMDGNPRYHPQRKLRARQKEDTEVKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, plas 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MPPSAHKASEKALNSKRAKRQTATKPNYFEGNSSEIDSPEDYDPMMTDTAFDGGDSEFGVEPMRIDEDEPIRRFNDEREEGEASEDHRETIVDQKKEKKRQEILDRIERFQKEFISRKDEIFKESIRQIDQDIKAMREGTHPEYEERLQQLIDKREQTLEKARLYRDYRLDCVEKMFDAETRQVEEDYLAEKQGLKEQMLADMDERRKKLKEDFESFDITSDAAMDGNPRYHPQRKLRARQKEDTEVKVKKTKVTDILFFAYLCLILNHVILCTDCRTIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.68
3 0.74
4 0.75
5 0.78
6 0.74
7 0.77
8 0.78
9 0.81
10 0.81
11 0.79
12 0.74
13 0.7
14 0.7
15 0.61
16 0.51
17 0.44
18 0.39
19 0.32
20 0.29
21 0.27
22 0.21
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.16
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.12
54 0.17
55 0.25
56 0.26
57 0.27
58 0.27
59 0.28
60 0.28
61 0.28
62 0.32
63 0.28
64 0.29
65 0.32
66 0.33
67 0.32
68 0.32
69 0.3
70 0.21
71 0.21
72 0.19
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.2
78 0.26
79 0.26
80 0.3
81 0.39
82 0.49
83 0.58
84 0.63
85 0.63
86 0.64
87 0.69
88 0.76
89 0.76
90 0.74
91 0.74
92 0.71
93 0.63
94 0.62
95 0.53
96 0.45
97 0.36
98 0.33
99 0.29
100 0.33
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.37
105 0.41
106 0.38
107 0.35
108 0.31
109 0.28
110 0.24
111 0.25
112 0.26
113 0.2
114 0.2
115 0.18
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.22
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.15
125 0.18
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.15
135 0.12
136 0.15
137 0.19
138 0.21
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.25
143 0.26
144 0.26
145 0.29
146 0.3
147 0.3
148 0.32
149 0.33
150 0.37
151 0.4
152 0.42
153 0.4
154 0.39
155 0.37
156 0.38
157 0.39
158 0.31
159 0.3
160 0.26
161 0.19
162 0.17
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.15
167 0.13
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.14
181 0.16
182 0.14
183 0.16
184 0.16
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.2
190 0.25
191 0.28
192 0.29
193 0.29
194 0.31
195 0.34
196 0.4
197 0.44
198 0.48
199 0.5
200 0.54
201 0.54
202 0.57
203 0.53
204 0.46
205 0.36
206 0.26
207 0.19
208 0.13
209 0.1
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.14
217 0.21
218 0.28
219 0.37
220 0.45
221 0.55
222 0.63
223 0.73
224 0.81
225 0.85
226 0.86
227 0.87
228 0.85
229 0.85
230 0.81
231 0.77
232 0.76
233 0.7
234 0.68
235 0.66
236 0.6
237 0.56
238 0.54
239 0.54
240 0.53
241 0.53
242 0.51
243 0.49
244 0.51
245 0.45
246 0.4
247 0.33
248 0.25
249 0.19
250 0.15
251 0.11
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.12
260 0.13