Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SQJ4

Protein Details
Accession A0A397SQJ4    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-188SQYGKKSKIGSEKKPTKNNAKIEHydrophilic
196-223QDLLNKTKDKKKGDDKRVKPINNKNEAKHydrophilic
847-868GGDGRMRKRKKVDMEDWKESHQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-212KKKGDDKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12565  RRM1_MRD1  
cd12317  RRM4_RBM19_RRM3_MRD1  
cd12320  RRM6_RBM19_RRM5_MRD1  
Amino Acid Sequences MSRLIIKNLPKNLTDNKFREHFSSKGQVTDAKIMKTSDGKSRCFGFIGYRTEQEANDALKYFNNTFIFTSRITIEFAKPVNDSLLPRPWSAHSVGSSEYEKRHQQNPNNKSLDGISKVDKDKYRKSNSKFSIVDEKNEKLQEFLEVMQPRSKSKTWANDDLTTLDSQYGKKSKIGSEKKPTKNNAKIEGSDDEFYQDLLNKTKDKKKGDDKRVKPINNKNEAKILSEENENEFDTTKDLVSDIDWLKSRMRRKFDLEDDDEEDNEMSVQKRSVKEGTSSDSESNDGYNSDKSSDSKSSKSDEKKGDDKGAYMNHDEEQMQGIISNKETNNNSSDRITEVPPEESIGETGRLFVRNLPYICTEDDLRKEFVKFGPLAEVHMPLDRETKKQKGFAYILYHIPEHAVKAYIELDNKFFMGRLLHIIPSREKPLSHDIDPSKWNLKKQREMKLKAQATSDFNWNTLYMNSDSIAESIANRLNIKKSDILDPESDNMSARLALAETHIIQETKAYLAENGVCLDSFGKKEKSNNIILVKNIPYNATKEDLQQLFGWYGDIGRIIIPPARTLAVIEFIHPTEAKNAFTNLAYKKFKGVPLYLEKAPVSVFKDDDSKEDNSSKQEGKKVLSSTDLVEPTPNVDDDNVDVNSEVTATLFVKNISFDTTEEGLRNVFKNTPGMKSAKIKMKNDSKNPGKKLSMGFGFIEYDNIKNAKNALKAMQNHELDGHTLQLKFSNRGVDIVQRKRKEDDNQESTKIIVKNLAFETTKKELKELFSSYGQIKALRLPKKFDGTSRGFAFIEFLTKRDARNVMENLRDTHLLGRHLILEYAEIDKDVEELREKVGREYIADIEGGDGRMRKRKKVDMEDWKESHQNNDDNDMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.58
3 0.57
4 0.57
5 0.57
6 0.58
7 0.54
8 0.49
9 0.46
10 0.52
11 0.47
12 0.46
13 0.46
14 0.43
15 0.42
16 0.48
17 0.45
18 0.37
19 0.38
20 0.35
21 0.37
22 0.38
23 0.37
24 0.38
25 0.4
26 0.41
27 0.43
28 0.46
29 0.44
30 0.39
31 0.37
32 0.35
33 0.37
34 0.4
35 0.4
36 0.38
37 0.4
38 0.41
39 0.4
40 0.35
41 0.32
42 0.27
43 0.26
44 0.25
45 0.21
46 0.22
47 0.27
48 0.24
49 0.27
50 0.26
51 0.26
52 0.26
53 0.28
54 0.28
55 0.24
56 0.26
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.22
61 0.22
62 0.25
63 0.25
64 0.26
65 0.24
66 0.24
67 0.24
68 0.25
69 0.26
70 0.26
71 0.33
72 0.33
73 0.32
74 0.34
75 0.33
76 0.34
77 0.33
78 0.32
79 0.25
80 0.25
81 0.26
82 0.27
83 0.28
84 0.28
85 0.29
86 0.3
87 0.36
88 0.39
89 0.46
90 0.51
91 0.58
92 0.65
93 0.7
94 0.74
95 0.71
96 0.65
97 0.59
98 0.53
99 0.49
100 0.43
101 0.38
102 0.32
103 0.35
104 0.38
105 0.43
106 0.47
107 0.47
108 0.53
109 0.6
110 0.66
111 0.7
112 0.73
113 0.77
114 0.76
115 0.78
116 0.7
117 0.65
118 0.65
119 0.58
120 0.58
121 0.53
122 0.5
123 0.46
124 0.47
125 0.42
126 0.32
127 0.3
128 0.26
129 0.22
130 0.21
131 0.23
132 0.22
133 0.24
134 0.28
135 0.28
136 0.28
137 0.33
138 0.33
139 0.31
140 0.37
141 0.45
142 0.49
143 0.57
144 0.6
145 0.57
146 0.57
147 0.52
148 0.46
149 0.36
150 0.29
151 0.21
152 0.18
153 0.15
154 0.21
155 0.24
156 0.24
157 0.27
158 0.3
159 0.35
160 0.44
161 0.52
162 0.55
163 0.61
164 0.7
165 0.76
166 0.81
167 0.83
168 0.82
169 0.82
170 0.8
171 0.78
172 0.73
173 0.65
174 0.61
175 0.57
176 0.5
177 0.41
178 0.34
179 0.26
180 0.21
181 0.19
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.17
186 0.2
187 0.23
188 0.3
189 0.38
190 0.45
191 0.48
192 0.56
193 0.62
194 0.7
195 0.77
196 0.81
197 0.79
198 0.82
199 0.85
200 0.83
201 0.82
202 0.81
203 0.8
204 0.8
205 0.78
206 0.69
207 0.66
208 0.6
209 0.53
210 0.46
211 0.38
212 0.29
213 0.29
214 0.28
215 0.23
216 0.24
217 0.21
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.14
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.22
234 0.27
235 0.35
236 0.37
237 0.42
238 0.44
239 0.5
240 0.57
241 0.6
242 0.63
243 0.6
244 0.56
245 0.54
246 0.49
247 0.43
248 0.35
249 0.27
250 0.18
251 0.14
252 0.11
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.15
257 0.16
258 0.2
259 0.23
260 0.23
261 0.26
262 0.28
263 0.31
264 0.29
265 0.31
266 0.28
267 0.26
268 0.24
269 0.21
270 0.18
271 0.14
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.17
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.29
284 0.32
285 0.39
286 0.44
287 0.48
288 0.48
289 0.51
290 0.53
291 0.54
292 0.56
293 0.48
294 0.43
295 0.39
296 0.36
297 0.32
298 0.28
299 0.25
300 0.19
301 0.2
302 0.19
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.13
312 0.12
313 0.17
314 0.18
315 0.2
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.2
320 0.21
321 0.18
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.15
341 0.19
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.18
349 0.16
350 0.2
351 0.2
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.21
358 0.17
359 0.15
360 0.18
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.11
369 0.18
370 0.17
371 0.2
372 0.24
373 0.31
374 0.32
375 0.36
376 0.37
377 0.38
378 0.38
379 0.38
380 0.39
381 0.34
382 0.33
383 0.3
384 0.28
385 0.21
386 0.21
387 0.16
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.13
409 0.14
410 0.16
411 0.18
412 0.2
413 0.18
414 0.17
415 0.19
416 0.25
417 0.28
418 0.26
419 0.31
420 0.29
421 0.31
422 0.32
423 0.31
424 0.31
425 0.29
426 0.33
427 0.35
428 0.4
429 0.46
430 0.52
431 0.6
432 0.63
433 0.66
434 0.68
435 0.7
436 0.66
437 0.6
438 0.54
439 0.47
440 0.4
441 0.37
442 0.35
443 0.25
444 0.22
445 0.2
446 0.19
447 0.16
448 0.13
449 0.14
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.12
465 0.14
466 0.16
467 0.17
468 0.17
469 0.22
470 0.24
471 0.26
472 0.25
473 0.24
474 0.24
475 0.21
476 0.2
477 0.14
478 0.12
479 0.1
480 0.08
481 0.07
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.09
508 0.13
509 0.15
510 0.17
511 0.21
512 0.28
513 0.32
514 0.35
515 0.39
516 0.39
517 0.37
518 0.36
519 0.36
520 0.31
521 0.28
522 0.24
523 0.2
524 0.17
525 0.17
526 0.18
527 0.17
528 0.16
529 0.16
530 0.23
531 0.22
532 0.22
533 0.21
534 0.2
535 0.18
536 0.17
537 0.15
538 0.08
539 0.08
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.09
550 0.1
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.14
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.16
567 0.16
568 0.16
569 0.21
570 0.19
571 0.26
572 0.27
573 0.27
574 0.3
575 0.32
576 0.35
577 0.33
578 0.32
579 0.3
580 0.35
581 0.4
582 0.36
583 0.35
584 0.32
585 0.28
586 0.27
587 0.23
588 0.19
589 0.16
590 0.16
591 0.14
592 0.2
593 0.2
594 0.22
595 0.23
596 0.22
597 0.24
598 0.26
599 0.27
600 0.25
601 0.3
602 0.31
603 0.31
604 0.35
605 0.35
606 0.35
607 0.38
608 0.36
609 0.33
610 0.31
611 0.28
612 0.25
613 0.27
614 0.25
615 0.2
616 0.19
617 0.17
618 0.16
619 0.16
620 0.14
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.1
625 0.13
626 0.12
627 0.11
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.08
633 0.04
634 0.05
635 0.06
636 0.07
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.09
641 0.1
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.15
646 0.16
647 0.17
648 0.17
649 0.17
650 0.15
651 0.16
652 0.17
653 0.14
654 0.15
655 0.15
656 0.22
657 0.24
658 0.26
659 0.28
660 0.3
661 0.33
662 0.38
663 0.44
664 0.46
665 0.51
666 0.51
667 0.56
668 0.64
669 0.68
670 0.7
671 0.73
672 0.74
673 0.75
674 0.77
675 0.75
676 0.67
677 0.63
678 0.57
679 0.54
680 0.46
681 0.39
682 0.35
683 0.29
684 0.29
685 0.23
686 0.23
687 0.17
688 0.16
689 0.16
690 0.17
691 0.16
692 0.15
693 0.18
694 0.21
695 0.23
696 0.25
697 0.26
698 0.32
699 0.36
700 0.41
701 0.46
702 0.41
703 0.39
704 0.38
705 0.35
706 0.29
707 0.25
708 0.22
709 0.16
710 0.16
711 0.15
712 0.19
713 0.22
714 0.23
715 0.25
716 0.27
717 0.25
718 0.26
719 0.27
720 0.31
721 0.38
722 0.45
723 0.52
724 0.51
725 0.53
726 0.56
727 0.62
728 0.62
729 0.64
730 0.64
731 0.64
732 0.65
733 0.64
734 0.61
735 0.54
736 0.51
737 0.42
738 0.32
739 0.29
740 0.23
741 0.26
742 0.27
743 0.32
744 0.26
745 0.26
746 0.32
747 0.34
748 0.38
749 0.33
750 0.34
751 0.33
752 0.36
753 0.42
754 0.38
755 0.36
756 0.34
757 0.37
758 0.35
759 0.36
760 0.32
761 0.27
762 0.24
763 0.27
764 0.33
765 0.37
766 0.39
767 0.42
768 0.47
769 0.54
770 0.55
771 0.53
772 0.54
773 0.53
774 0.57
775 0.54
776 0.5
777 0.42
778 0.39
779 0.36
780 0.28
781 0.29
782 0.22
783 0.2
784 0.23
785 0.25
786 0.26
787 0.3
788 0.34
789 0.29
790 0.38
791 0.43
792 0.43
793 0.48
794 0.5
795 0.47
796 0.46
797 0.43
798 0.36
799 0.35
800 0.33
801 0.28
802 0.27
803 0.25
804 0.24
805 0.23
806 0.23
807 0.17
808 0.15
809 0.14
810 0.15
811 0.14
812 0.12
813 0.11
814 0.1
815 0.12
816 0.11
817 0.12
818 0.13
819 0.14
820 0.18
821 0.22
822 0.23
823 0.24
824 0.28
825 0.26
826 0.25
827 0.27
828 0.26
829 0.23
830 0.22
831 0.19
832 0.16
833 0.17
834 0.16
835 0.15
836 0.16
837 0.19
838 0.28
839 0.33
840 0.39
841 0.46
842 0.55
843 0.63
844 0.7
845 0.77
846 0.79
847 0.85
848 0.86
849 0.81
850 0.76
851 0.72
852 0.62
853 0.59
854 0.56
855 0.52
856 0.45
857 0.49