Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397THM9

Protein Details
Accession A0A397THM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
627-650EKSFAKAEKPKAKKLQLKPQHITQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
635-639KPKAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040458  Vid27  
IPR013863  VID27_C  
IPR040979  Vid27_N  
IPR040768  Vid27_PH  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08553  VID27  
PF17748  VID27_N  
PF17747  VID27_PH  
Amino Acid Sequences MNVLKSLGKFIWGNPNIPELIKISSGDFHLVRPNSLKGTRECIFHEAQATIRRTGTEWQYQIVITRVFDEGEEDLQDEEEEVEEEKVFLIDESLKFRKGQFEGRTTFSWRDLSGDPDDLFEFVCDINTTTHIVDAFEHTVYKCMFERKYQKPQYEATEQDIRNFVFNTELKIDQNDKTPPSTPKNKRSSLNKSFTTPTSASTTPMRTQNIESLSTPTKTVKLEFPGGVSSKATSIVDADVELHVFDSNTATFLMQSPLATTSILKGNNYEYWLIVEDDNKRHIIQKIEPRMNPVFNSTQHCLIWVYYDGFDMVNSFLIKFCDPDNETKFKKKFTSAMYETLNETKAKEEEQEYLMNAYLDEDIEMIDAKDSDEEESEEETDSSDEDDDGDVNNEAKEDGANTQLAVGHKLDRSFVLKGNKIGVFKHTDDDRIEFNTDINNISKPQGKKFNPSKMMLHEGDSNMILMDESDKHNLYKMDLEYAKVVEEWNIHDVIPVENIFPMKKFAQMTGEKMILGLSHNSIYGIDPRLPKFKLVDNKRRQYVTKNDFISGATDEKGHIAVGTVKGDIKLFDSLGKIAKTNLPAMGSAIKGIDVTSDGKWLIATTDQYLLLVNTEIKSDSDGRTGFEKSFAKAEKPKAKKLQLKPQHITQMGGHTVNFTPARFNTGEGVMEKTIVTSTGPFVITWNFRQVKQGKLAYQIKRYSDDIVADNFRFGQDKSIIVTLPHDVTLTKKSHLSTPTKSVLSPSKKSGSRSRNNIVKSFENY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.33
4 0.32
5 0.3
6 0.21
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.27
17 0.27
18 0.28
19 0.3
20 0.32
21 0.35
22 0.38
23 0.41
24 0.36
25 0.43
26 0.43
27 0.42
28 0.42
29 0.41
30 0.39
31 0.36
32 0.36
33 0.29
34 0.31
35 0.36
36 0.36
37 0.32
38 0.31
39 0.3
40 0.29
41 0.34
42 0.36
43 0.37
44 0.35
45 0.34
46 0.35
47 0.34
48 0.34
49 0.32
50 0.27
51 0.18
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.11
78 0.13
79 0.2
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.27
84 0.33
85 0.33
86 0.4
87 0.4
88 0.46
89 0.49
90 0.52
91 0.54
92 0.51
93 0.5
94 0.43
95 0.38
96 0.3
97 0.3
98 0.27
99 0.29
100 0.27
101 0.28
102 0.25
103 0.24
104 0.24
105 0.2
106 0.19
107 0.14
108 0.12
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.15
123 0.13
124 0.15
125 0.14
126 0.17
127 0.17
128 0.19
129 0.18
130 0.23
131 0.24
132 0.32
133 0.42
134 0.47
135 0.58
136 0.64
137 0.66
138 0.64
139 0.67
140 0.65
141 0.63
142 0.56
143 0.51
144 0.52
145 0.47
146 0.45
147 0.44
148 0.37
149 0.32
150 0.29
151 0.24
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.22
156 0.23
157 0.22
158 0.25
159 0.28
160 0.24
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.29
165 0.34
166 0.37
167 0.42
168 0.51
169 0.55
170 0.61
171 0.68
172 0.71
173 0.74
174 0.77
175 0.79
176 0.79
177 0.78
178 0.7
179 0.65
180 0.62
181 0.56
182 0.53
183 0.42
184 0.34
185 0.32
186 0.29
187 0.28
188 0.28
189 0.31
190 0.28
191 0.33
192 0.32
193 0.29
194 0.3
195 0.33
196 0.32
197 0.31
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.26
202 0.25
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.23
209 0.26
210 0.25
211 0.25
212 0.25
213 0.25
214 0.24
215 0.2
216 0.16
217 0.13
218 0.14
219 0.13
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.17
255 0.19
256 0.17
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.13
263 0.16
264 0.18
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.22
269 0.24
270 0.26
271 0.28
272 0.35
273 0.43
274 0.49
275 0.49
276 0.51
277 0.51
278 0.48
279 0.42
280 0.37
281 0.31
282 0.27
283 0.32
284 0.28
285 0.28
286 0.26
287 0.26
288 0.22
289 0.19
290 0.17
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.13
309 0.14
310 0.21
311 0.25
312 0.3
313 0.33
314 0.41
315 0.43
316 0.41
317 0.43
318 0.39
319 0.4
320 0.38
321 0.45
322 0.39
323 0.42
324 0.4
325 0.38
326 0.36
327 0.32
328 0.29
329 0.2
330 0.17
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.1
344 0.08
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.14
400 0.14
401 0.18
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.27
406 0.28
407 0.26
408 0.25
409 0.23
410 0.23
411 0.22
412 0.24
413 0.21
414 0.21
415 0.22
416 0.23
417 0.21
418 0.18
419 0.19
420 0.15
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.18
430 0.18
431 0.23
432 0.32
433 0.33
434 0.42
435 0.5
436 0.57
437 0.57
438 0.59
439 0.56
440 0.5
441 0.54
442 0.45
443 0.39
444 0.32
445 0.26
446 0.24
447 0.21
448 0.17
449 0.1
450 0.09
451 0.07
452 0.04
453 0.05
454 0.06
455 0.08
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.17
463 0.15
464 0.2
465 0.2
466 0.2
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.14
471 0.13
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.09
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.12
489 0.11
490 0.14
491 0.15
492 0.15
493 0.22
494 0.24
495 0.28
496 0.28
497 0.28
498 0.24
499 0.23
500 0.22
501 0.14
502 0.13
503 0.1
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.11
511 0.12
512 0.15
513 0.19
514 0.21
515 0.27
516 0.27
517 0.28
518 0.27
519 0.32
520 0.38
521 0.45
522 0.53
523 0.58
524 0.66
525 0.7
526 0.71
527 0.66
528 0.64
529 0.65
530 0.6
531 0.58
532 0.52
533 0.47
534 0.44
535 0.42
536 0.36
537 0.27
538 0.22
539 0.14
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.1
545 0.07
546 0.06
547 0.09
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.12
559 0.12
560 0.13
561 0.17
562 0.17
563 0.15
564 0.16
565 0.19
566 0.19
567 0.2
568 0.2
569 0.17
570 0.17
571 0.18
572 0.19
573 0.15
574 0.13
575 0.12
576 0.1
577 0.09
578 0.09
579 0.07
580 0.07
581 0.09
582 0.09
583 0.11
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.1
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.13
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.11
598 0.1
599 0.1
600 0.08
601 0.09
602 0.1
603 0.09
604 0.12
605 0.15
606 0.15
607 0.18
608 0.19
609 0.2
610 0.22
611 0.24
612 0.22
613 0.25
614 0.26
615 0.22
616 0.29
617 0.29
618 0.33
619 0.38
620 0.48
621 0.52
622 0.57
623 0.65
624 0.68
625 0.75
626 0.79
627 0.81
628 0.82
629 0.82
630 0.86
631 0.81
632 0.79
633 0.79
634 0.7
635 0.63
636 0.54
637 0.5
638 0.43
639 0.39
640 0.31
641 0.25
642 0.24
643 0.27
644 0.26
645 0.19
646 0.2
647 0.19
648 0.25
649 0.23
650 0.24
651 0.21
652 0.22
653 0.24
654 0.21
655 0.24
656 0.19
657 0.19
658 0.17
659 0.15
660 0.13
661 0.11
662 0.11
663 0.08
664 0.09
665 0.12
666 0.13
667 0.12
668 0.14
669 0.18
670 0.22
671 0.23
672 0.32
673 0.31
674 0.31
675 0.41
676 0.43
677 0.45
678 0.49
679 0.53
680 0.47
681 0.54
682 0.63
683 0.6
684 0.65
685 0.64
686 0.59
687 0.57
688 0.55
689 0.5
690 0.44
691 0.4
692 0.34
693 0.33
694 0.35
695 0.31
696 0.3
697 0.26
698 0.24
699 0.23
700 0.2
701 0.21
702 0.18
703 0.2
704 0.22
705 0.23
706 0.23
707 0.22
708 0.23
709 0.2
710 0.19
711 0.18
712 0.16
713 0.14
714 0.17
715 0.24
716 0.25
717 0.24
718 0.26
719 0.27
720 0.34
721 0.42
722 0.46
723 0.46
724 0.51
725 0.55
726 0.53
727 0.52
728 0.52
729 0.53
730 0.54
731 0.53
732 0.52
733 0.54
734 0.57
735 0.63
736 0.67
737 0.68
738 0.69
739 0.73
740 0.76
741 0.75
742 0.76
743 0.76
744 0.72