Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SLK6

Protein Details
Accession A0A397SLK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MPPVRRDKEKVKEIRKRLSYAKKKGYVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-33RRDKEKVKEIRKRLSYAKKKGYVGGKNKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003656  Znf_BED  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02892  zf-BED  
Amino Acid Sequences MPPVRRDKEKVKEIRKRLSYAKKKGYVGGKNKKFDISKSYTNFKGQDFEIQAQAESKINYIYLFILAAQTKTFGICPAEIPGQMGFSDANFQEDASAQNSENRDSECSSEISSPSNQSNKETQLINLGGRPKGDVWQYFDEINNGKGKHKGVICNFCDLTWSRGRANEMKSHLAIKCKGRVPKEIRLNYLREIDNEHESLETSTSISSKKTKNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.79
4 0.79
5 0.8
6 0.8
7 0.8
8 0.81
9 0.78
10 0.74
11 0.75
12 0.74
13 0.72
14 0.73
15 0.73
16 0.72
17 0.69
18 0.69
19 0.69
20 0.61
21 0.55
22 0.53
23 0.49
24 0.49
25 0.5
26 0.53
27 0.5
28 0.53
29 0.52
30 0.44
31 0.4
32 0.32
33 0.34
34 0.32
35 0.31
36 0.29
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.23
41 0.18
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.07
73 0.06
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.22
109 0.19
110 0.21
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.13
119 0.15
120 0.18
121 0.17
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.24
127 0.24
128 0.21
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.24
136 0.27
137 0.32
138 0.35
139 0.44
140 0.44
141 0.46
142 0.46
143 0.4
144 0.39
145 0.33
146 0.3
147 0.27
148 0.28
149 0.23
150 0.26
151 0.31
152 0.34
153 0.37
154 0.39
155 0.38
156 0.39
157 0.39
158 0.41
159 0.38
160 0.39
161 0.4
162 0.39
163 0.42
164 0.44
165 0.49
166 0.49
167 0.57
168 0.57
169 0.62
170 0.67
171 0.66
172 0.66
173 0.65
174 0.65
175 0.59
176 0.58
177 0.5
178 0.4
179 0.4
180 0.37
181 0.36
182 0.33
183 0.29
184 0.23
185 0.23
186 0.22
187 0.18
188 0.14
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.22