Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TPB0

Protein Details
Accession A0A397TPB0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33RKTSNPERGTAKKQKKSPKKEEQLDLNNLDHydrophilic
190-213IVWVYKRDKNDKPYRRNRGWEDLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-23RKTSNPERGTAKKQKKSPKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012296  Nuclease_put_TT1808  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR008538  Uma2  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05685  Uma2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd06260  DUF820-like  
Amino Acid Sequences MPKRKTSNPERGTAKKQKKSPKKEEQLDLNNLDFNHTYSLKEYELIMKHLKVHSNYELVNGKIIPVQYTPIANEAVVHEIARQLGNWNIKYQQNGLVTTSQGGFNFSNSDKQKIRAPDIAFTPMETCLSLDDNQLWSFKGQPFTPNFVVEVANLENKAIENSVDAKIKKDYFAMDTSVKLGWLIDPKNCIVWVYKRDKNDKPYRRNRGWEDLDGGDILPKFTLKLSRIENIVSQELEEEEESDDEGDKCSYCNKVLTNVHEMIKHLEKVHSQSDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.76
3 0.8
4 0.82
5 0.85
6 0.88
7 0.89
8 0.89
9 0.89
10 0.9
11 0.9
12 0.89
13 0.87
14 0.83
15 0.75
16 0.65
17 0.56
18 0.47
19 0.42
20 0.32
21 0.24
22 0.22
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.21
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.21
31 0.22
32 0.26
33 0.27
34 0.25
35 0.29
36 0.31
37 0.36
38 0.31
39 0.35
40 0.35
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.35
45 0.3
46 0.29
47 0.23
48 0.2
49 0.19
50 0.19
51 0.15
52 0.11
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.08
71 0.13
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.25
77 0.26
78 0.26
79 0.28
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.22
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.13
88 0.11
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.13
93 0.13
94 0.2
95 0.2
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.3
100 0.31
101 0.35
102 0.33
103 0.33
104 0.31
105 0.32
106 0.33
107 0.28
108 0.24
109 0.21
110 0.15
111 0.14
112 0.11
113 0.09
114 0.06
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.11
125 0.12
126 0.14
127 0.13
128 0.17
129 0.19
130 0.25
131 0.26
132 0.23
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.15
137 0.14
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.08
149 0.1
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.2
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.2
179 0.27
180 0.33
181 0.37
182 0.43
183 0.5
184 0.56
185 0.63
186 0.68
187 0.7
188 0.73
189 0.79
190 0.83
191 0.83
192 0.85
193 0.82
194 0.81
195 0.76
196 0.68
197 0.61
198 0.52
199 0.45
200 0.36
201 0.29
202 0.21
203 0.16
204 0.13
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.16
210 0.15
211 0.21
212 0.25
213 0.28
214 0.3
215 0.31
216 0.32
217 0.3
218 0.31
219 0.24
220 0.21
221 0.18
222 0.17
223 0.17
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.16
238 0.17
239 0.21
240 0.22
241 0.3
242 0.36
243 0.41
244 0.44
245 0.46
246 0.46
247 0.43
248 0.43
249 0.4
250 0.4
251 0.38
252 0.33
253 0.33
254 0.35
255 0.38