Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SDW0

Protein Details
Accession A0A397SDW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-93ISTSSKSKMKRKTRSTSARNTQKKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021027  Transposase_put_HTH  
Pfam View protein in Pfam  
PF12323  HTH_OrfB_IS605  
Amino Acid Sequences MSPDPGTYWNSQALGFSQCLWVLTNENCQENYPISSKETAKSNRSLQNTWFSSIQYPLDCGLESKVFLPISTSSKSKMKRKTRSTSARNTQKKESTTINHTIQIRVYPNKSQAQILKRWLGLSHYAYNAIIGINRKKKVYSKECKCDPSMVKFLKPMSFESKMKLFSNVKADKDSTPEEDLKLQKNSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.15
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.24
12 0.25
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.28
17 0.26
18 0.28
19 0.22
20 0.21
21 0.21
22 0.25
23 0.26
24 0.27
25 0.33
26 0.36
27 0.37
28 0.41
29 0.46
30 0.49
31 0.52
32 0.52
33 0.46
34 0.5
35 0.48
36 0.45
37 0.38
38 0.32
39 0.28
40 0.28
41 0.26
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.16
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.24
62 0.31
63 0.37
64 0.45
65 0.52
66 0.59
67 0.68
68 0.74
69 0.79
70 0.82
71 0.82
72 0.82
73 0.81
74 0.82
75 0.8
76 0.75
77 0.7
78 0.65
79 0.59
80 0.52
81 0.46
82 0.39
83 0.37
84 0.39
85 0.35
86 0.34
87 0.33
88 0.31
89 0.27
90 0.26
91 0.24
92 0.21
93 0.22
94 0.21
95 0.25
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.32
100 0.33
101 0.35
102 0.37
103 0.35
104 0.32
105 0.31
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.22
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.16
116 0.12
117 0.1
118 0.12
119 0.19
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.31
124 0.38
125 0.46
126 0.53
127 0.56
128 0.6
129 0.68
130 0.74
131 0.76
132 0.72
133 0.7
134 0.64
135 0.6
136 0.59
137 0.53
138 0.48
139 0.47
140 0.47
141 0.43
142 0.4
143 0.37
144 0.35
145 0.38
146 0.37
147 0.38
148 0.4
149 0.4
150 0.39
151 0.42
152 0.38
153 0.37
154 0.46
155 0.47
156 0.45
157 0.45
158 0.46
159 0.4
160 0.43
161 0.42
162 0.36
163 0.36
164 0.35
165 0.33
166 0.38
167 0.41
168 0.42