Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SSM6

Protein Details
Accession A0A397SSM6    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88QQERKTAKDHRVRRNVIEQRHydrophilic
94-123IIPSSQTKTPNQRKKKSGRASNKKQKEETIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-118RKKKSGRASNKKQ
255-276PRAPKRDIDRRPPPEFIKRKNR
Subcellular Location(s) nucl 23, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MNNQDYFAKDFDPNKVTIKRLKEILNAHNIPHKDISRKAEFVQKFQDHVIPDLQRRREEGEPRGATELQQERKTAKDHRVRRNVIEQRHAEQEIIPSSQTKTPNQRKKKSGRASNKKQKEETITQPYILQDDGQSSKATVIDDNHAAQLTSISQSSGHEQSKQNYSGRLSPPRPLKAPMSETPFYPMVPPYPRTPVYPFLEPEELETVRRKDQELQQSSERQETPLYPIQEGSENGEDKIKYFERREAFAYCFKPRAPKRDIDRRPPPEFIKRKNRIRLSSGIVILSFIFIFIFLYLSLKTKIGFCDSVVKPIPDHKEVGNVQSLIQLLINIMCTHCPPKATCSNGVIAECEKGFKQETSFFRLTKPYYTHCAIDKEQTTKAKKYTKEFKELVAREMGRVTCGYGDNDNLLYENLKLQLKEKMPPQDYKYINDIDENITKIREEDQENDIYVEEENEDSISRLYIFSKKPTYSFYCQLTFAFVNLIENIFDNLFYSLTVVLTSSLLLFGTLYIRQWIWEKRQISTAFGLALTRLNENKRIIGLEFREEAFSHVKNPMVRQKLFQKLDEKVRTNPYVRAGNTRYDGFEAGFWEWKAPSTSHVNSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.46
4 0.48
5 0.52
6 0.5
7 0.53
8 0.55
9 0.55
10 0.58
11 0.6
12 0.63
13 0.58
14 0.54
15 0.55
16 0.51
17 0.48
18 0.46
19 0.43
20 0.39
21 0.44
22 0.5
23 0.5
24 0.52
25 0.5
26 0.54
27 0.52
28 0.51
29 0.55
30 0.5
31 0.45
32 0.44
33 0.46
34 0.38
35 0.38
36 0.39
37 0.35
38 0.4
39 0.46
40 0.49
41 0.47
42 0.48
43 0.51
44 0.52
45 0.54
46 0.53
47 0.55
48 0.52
49 0.52
50 0.53
51 0.48
52 0.41
53 0.42
54 0.43
55 0.4
56 0.4
57 0.4
58 0.38
59 0.41
60 0.46
61 0.45
62 0.46
63 0.49
64 0.56
65 0.65
66 0.74
67 0.76
68 0.76
69 0.8
70 0.78
71 0.75
72 0.75
73 0.68
74 0.61
75 0.62
76 0.56
77 0.46
78 0.39
79 0.36
80 0.29
81 0.26
82 0.23
83 0.18
84 0.2
85 0.25
86 0.28
87 0.3
88 0.38
89 0.48
90 0.59
91 0.68
92 0.74
93 0.8
94 0.85
95 0.89
96 0.89
97 0.89
98 0.9
99 0.9
100 0.92
101 0.93
102 0.93
103 0.9
104 0.83
105 0.79
106 0.76
107 0.72
108 0.7
109 0.69
110 0.6
111 0.53
112 0.5
113 0.44
114 0.37
115 0.3
116 0.21
117 0.12
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.13
127 0.13
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.14
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.13
143 0.19
144 0.19
145 0.24
146 0.27
147 0.31
148 0.38
149 0.41
150 0.39
151 0.36
152 0.38
153 0.4
154 0.43
155 0.48
156 0.43
157 0.46
158 0.52
159 0.53
160 0.53
161 0.49
162 0.47
163 0.44
164 0.48
165 0.46
166 0.46
167 0.41
168 0.39
169 0.4
170 0.36
171 0.3
172 0.25
173 0.2
174 0.18
175 0.21
176 0.23
177 0.22
178 0.27
179 0.28
180 0.31
181 0.33
182 0.36
183 0.36
184 0.38
185 0.36
186 0.33
187 0.34
188 0.31
189 0.29
190 0.26
191 0.22
192 0.19
193 0.23
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.33
200 0.42
201 0.42
202 0.45
203 0.46
204 0.5
205 0.49
206 0.48
207 0.41
208 0.32
209 0.28
210 0.24
211 0.25
212 0.26
213 0.26
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.19
224 0.18
225 0.16
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.22
230 0.28
231 0.28
232 0.3
233 0.32
234 0.3
235 0.3
236 0.33
237 0.35
238 0.3
239 0.3
240 0.29
241 0.36
242 0.37
243 0.42
244 0.4
245 0.44
246 0.5
247 0.59
248 0.65
249 0.66
250 0.72
251 0.71
252 0.71
253 0.68
254 0.64
255 0.63
256 0.64
257 0.63
258 0.64
259 0.66
260 0.7
261 0.75
262 0.78
263 0.72
264 0.68
265 0.64
266 0.58
267 0.53
268 0.45
269 0.35
270 0.28
271 0.24
272 0.19
273 0.15
274 0.09
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.19
294 0.19
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.21
299 0.26
300 0.3
301 0.22
302 0.24
303 0.18
304 0.24
305 0.25
306 0.26
307 0.23
308 0.19
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.11
313 0.11
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.16
327 0.22
328 0.25
329 0.27
330 0.27
331 0.29
332 0.29
333 0.28
334 0.24
335 0.18
336 0.16
337 0.13
338 0.12
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.1
343 0.12
344 0.18
345 0.21
346 0.28
347 0.31
348 0.29
349 0.3
350 0.34
351 0.33
352 0.31
353 0.31
354 0.27
355 0.3
356 0.32
357 0.32
358 0.3
359 0.33
360 0.3
361 0.33
362 0.33
363 0.3
364 0.33
365 0.39
366 0.4
367 0.39
368 0.45
369 0.46
370 0.47
371 0.53
372 0.59
373 0.57
374 0.61
375 0.59
376 0.57
377 0.6
378 0.56
379 0.49
380 0.45
381 0.4
382 0.31
383 0.33
384 0.28
385 0.19
386 0.18
387 0.16
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.21
406 0.22
407 0.26
408 0.31
409 0.36
410 0.39
411 0.44
412 0.47
413 0.49
414 0.49
415 0.48
416 0.47
417 0.4
418 0.36
419 0.32
420 0.29
421 0.24
422 0.24
423 0.23
424 0.19
425 0.17
426 0.16
427 0.16
428 0.17
429 0.19
430 0.19
431 0.21
432 0.24
433 0.26
434 0.27
435 0.26
436 0.23
437 0.19
438 0.16
439 0.12
440 0.09
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.1
451 0.16
452 0.18
453 0.24
454 0.31
455 0.32
456 0.33
457 0.39
458 0.44
459 0.44
460 0.47
461 0.46
462 0.41
463 0.41
464 0.4
465 0.38
466 0.31
467 0.25
468 0.2
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.14
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.1
500 0.1
501 0.12
502 0.18
503 0.24
504 0.29
505 0.37
506 0.38
507 0.38
508 0.46
509 0.46
510 0.44
511 0.4
512 0.34
513 0.27
514 0.25
515 0.23
516 0.16
517 0.18
518 0.15
519 0.16
520 0.19
521 0.22
522 0.28
523 0.29
524 0.31
525 0.29
526 0.3
527 0.28
528 0.31
529 0.31
530 0.3
531 0.3
532 0.29
533 0.29
534 0.27
535 0.29
536 0.26
537 0.24
538 0.22
539 0.23
540 0.26
541 0.27
542 0.34
543 0.4
544 0.44
545 0.45
546 0.48
547 0.55
548 0.62
549 0.63
550 0.62
551 0.59
552 0.59
553 0.68
554 0.7
555 0.65
556 0.61
557 0.66
558 0.66
559 0.63
560 0.6
561 0.56
562 0.55
563 0.53
564 0.55
565 0.5
566 0.5
567 0.51
568 0.48
569 0.43
570 0.38
571 0.37
572 0.28
573 0.27
574 0.23
575 0.21
576 0.24
577 0.22
578 0.21
579 0.2
580 0.22
581 0.23
582 0.21
583 0.23
584 0.27