Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397TRN5

Protein Details
Accession A0A397TRN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
444-470VITCKDVTPKPKPTKKRDNKKEEFLDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-460PKPTKKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014848  Rgp1  
Pfam View protein in Pfam  
PF08737  Rgp1  
Amino Acid Sequences MSAVIVTAKIPQNAVFFAGEKFRCEITFSCQSTNVDNLSSEDKSQGASTKNGYSNNVKSASETKSHGKKPSIKQVPNGNPLSVIVENPSIHNSLAGDLGDSGMFGFRNFVKRPASLSSIASSTFSLLAGNSSNSQPSPTSQLPVQNSSPQSFPGHIDTEEHDLEHVEKIDDKAILTSEPLNYTDEETDDDGGLINLQQAGVNDNVSISDLDTSESTTPRSSIDFYSIGNSERGSNTWSDSLTDYKKYGSSRRSSTGTRCSSSPSLSQKYETLLWGFVQIVGHFVIDNSLVKSIEFEPLKTKTMYRPASGSGAGGAVGGGTLGIFSANTLSHSSLADLQERADSKSIPVFSTPPSILFCDLHLAPGELRTYTYETRLPNDLPPSHRGKAIRFLYYLIIGTHRGGMNHQSNVVQMPFRVFNYVSDDGSRPIYDLMNPVVIYKDEAVITCKDVTPKPKPTKKRDNKKEEFLDYLEKLVQSSNYEISPITDENDDDSKDSDTYVFVEKDESSVANTATILSKNMRKANYDICKNNQRVAQLCLLKTSYRLGDIVTGTINFNDAVIPSYQVSITLESSEIVESSIANRPQQQIARATRKVHGEHHEFCLNAGRISFAISIPTSSTPDFQTTGVKLQWCLRLEFITGPKGQSPLMPLNADERHQYYQAIDEINVETFDCAIPIKVYPTSYTSARIFPSHHVFRVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.21
3 0.18
4 0.19
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.27
12 0.27
13 0.26
14 0.35
15 0.36
16 0.36
17 0.39
18 0.4
19 0.4
20 0.42
21 0.36
22 0.27
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.22
28 0.2
29 0.18
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.2
34 0.22
35 0.25
36 0.32
37 0.36
38 0.38
39 0.41
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.47
44 0.39
45 0.38
46 0.41
47 0.41
48 0.37
49 0.37
50 0.39
51 0.45
52 0.52
53 0.56
54 0.59
55 0.64
56 0.7
57 0.77
58 0.78
59 0.74
60 0.75
61 0.78
62 0.79
63 0.78
64 0.71
65 0.6
66 0.5
67 0.46
68 0.43
69 0.32
70 0.23
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.11
94 0.18
95 0.2
96 0.25
97 0.28
98 0.29
99 0.33
100 0.35
101 0.37
102 0.33
103 0.33
104 0.3
105 0.27
106 0.26
107 0.23
108 0.19
109 0.15
110 0.13
111 0.11
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.21
125 0.2
126 0.23
127 0.23
128 0.3
129 0.32
130 0.36
131 0.37
132 0.36
133 0.38
134 0.36
135 0.35
136 0.3
137 0.29
138 0.25
139 0.25
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.25
146 0.23
147 0.21
148 0.17
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.18
228 0.18
229 0.2
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.23
234 0.28
235 0.31
236 0.34
237 0.37
238 0.41
239 0.44
240 0.45
241 0.48
242 0.51
243 0.49
244 0.44
245 0.4
246 0.4
247 0.38
248 0.37
249 0.37
250 0.35
251 0.35
252 0.35
253 0.36
254 0.31
255 0.32
256 0.31
257 0.25
258 0.19
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.17
284 0.2
285 0.22
286 0.21
287 0.22
288 0.2
289 0.3
290 0.31
291 0.28
292 0.28
293 0.27
294 0.29
295 0.27
296 0.23
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.06
302 0.03
303 0.03
304 0.02
305 0.02
306 0.02
307 0.01
308 0.01
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.13
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.16
360 0.16
361 0.19
362 0.21
363 0.21
364 0.2
365 0.24
366 0.25
367 0.24
368 0.28
369 0.32
370 0.3
371 0.32
372 0.32
373 0.29
374 0.35
375 0.35
376 0.33
377 0.27
378 0.28
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.14
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.16
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.16
395 0.16
396 0.18
397 0.18
398 0.12
399 0.08
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.19
407 0.2
408 0.18
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.18
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.14
436 0.17
437 0.24
438 0.3
439 0.39
440 0.48
441 0.56
442 0.65
443 0.72
444 0.81
445 0.84
446 0.88
447 0.89
448 0.89
449 0.88
450 0.88
451 0.85
452 0.77
453 0.69
454 0.6
455 0.55
456 0.44
457 0.38
458 0.3
459 0.22
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.11
464 0.12
465 0.13
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.14
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.13
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.14
487 0.13
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.14
493 0.12
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.13
504 0.18
505 0.23
506 0.28
507 0.29
508 0.31
509 0.34
510 0.42
511 0.48
512 0.51
513 0.51
514 0.54
515 0.61
516 0.6
517 0.61
518 0.54
519 0.49
520 0.43
521 0.42
522 0.42
523 0.37
524 0.35
525 0.34
526 0.33
527 0.29
528 0.27
529 0.27
530 0.2
531 0.17
532 0.17
533 0.15
534 0.17
535 0.17
536 0.16
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.09
566 0.15
567 0.16
568 0.18
569 0.22
570 0.25
571 0.31
572 0.34
573 0.36
574 0.38
575 0.46
576 0.53
577 0.54
578 0.55
579 0.53
580 0.57
581 0.56
582 0.55
583 0.54
584 0.52
585 0.51
586 0.54
587 0.52
588 0.45
589 0.42
590 0.44
591 0.36
592 0.29
593 0.26
594 0.21
595 0.17
596 0.2
597 0.21
598 0.12
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.17
606 0.19
607 0.18
608 0.21
609 0.21
610 0.2
611 0.24
612 0.23
613 0.27
614 0.28
615 0.28
616 0.27
617 0.31
618 0.38
619 0.34
620 0.34
621 0.31
622 0.3
623 0.3
624 0.33
625 0.32
626 0.31
627 0.3
628 0.3
629 0.3
630 0.3
631 0.28
632 0.24
633 0.26
634 0.27
635 0.29
636 0.28
637 0.27
638 0.32
639 0.34
640 0.34
641 0.32
642 0.3
643 0.3
644 0.3
645 0.3
646 0.24
647 0.26
648 0.28
649 0.26
650 0.22
651 0.2
652 0.21
653 0.21
654 0.2
655 0.16
656 0.12
657 0.11
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.1
664 0.14
665 0.15
666 0.17
667 0.19
668 0.22
669 0.25
670 0.26
671 0.31
672 0.3
673 0.31
674 0.33
675 0.33
676 0.32
677 0.35
678 0.43
679 0.44