Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TRN5

Protein Details
Accession A0A397TRN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
444-470VITCKDVTPKPKPTKKRDNKKEEFLDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
454-460PKPTKKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014848  Rgp1  
Pfam View protein in Pfam  
PF08737  Rgp1  
Amino Acid Sequences MSAVIVTAKIPQNAVFFAGEKFRCEITFSCQSTNVDNLSSEDKSQGASTKNGYSNNVKSASETKSHGKKPSIKQVPNGNPLSVIVENPSIHNSLAGDLGDSGMFGFRNFVKRPASLSSIASSTFSLLAGNSSNSQPSPTSQLPVQNSSPQSFPGHIDTEEHDLEHVEKIDDKAILTSEPLNYTDEETDDDGGLINLQQAGVNDNVSISDLDTSESTTPRSSIDFYSIGNSERGSNTWSDSLTDYKKYGSSRRSSTGTRCSSSPSLSQKYETLLWGFVQIVGHFVIDNSLVKSIEFEPLKTKTMYRPASGSGAGGAVGGGTLGIFSANTLSHSSLADLQERADSKSIPVFSTPPSILFCDLHLAPGELRTYTYETRLPNDLPPSHRGKAIRFLYYLIIGTHRGGMNHQSNVVQMPFRVFNYVSDDGSRPIYDLMNPVVIYKDEAVITCKDVTPKPKPTKKRDNKKEEFLDYLEKLVQSSNYEISPITDENDDDSKDSDTYVFVEKDESSVANTATILSKNMRKANYDICKNNQRVAQLCLLKTSYRLGDIVTGTINFNDAVIPSYQVSITLESSEIVESSIANRPQQQIARATRKVHGEHHEFCLNAGRISFAISIPTSSTPDFQTTGVKLQWCLRLEFITGPKGQSPLMPLNADERHQYYQAIDEINVETFDCAIPIKVYPTSYTSARIFPSHHVFRVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.21
3 0.18
4 0.19
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.27
12 0.27
13 0.26
14 0.35
15 0.36
16 0.36
17 0.39
18 0.4
19 0.4
20 0.42
21 0.36
22 0.27
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.22
28 0.2
29 0.18
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.2
34 0.22
35 0.25
36 0.32
37 0.36
38 0.38
39 0.41
40 0.43
41 0.45
42 0.48
43 0.47
44 0.39
45 0.38
46 0.41
47 0.41
48 0.37
49 0.37
50 0.39
51 0.45
52 0.52
53 0.56
54 0.59
55 0.64
56 0.7
57 0.77
58 0.78
59 0.74
60 0.75
61 0.78
62 0.79
63 0.78
64 0.71
65 0.6
66 0.5
67 0.46
68 0.43
69 0.32
70 0.23
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.11
94 0.18
95 0.2
96 0.25
97 0.28
98 0.29
99 0.33
100 0.35
101 0.37
102 0.33
103 0.33
104 0.3
105 0.27
106 0.26
107 0.23
108 0.19
109 0.15
110 0.13
111 0.11
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.15
122 0.14
123 0.15
124 0.21
125 0.2
126 0.23
127 0.23
128 0.3
129 0.32
130 0.36
131 0.37
132 0.36
133 0.38
134 0.36
135 0.35
136 0.3
137 0.29
138 0.25
139 0.25
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.25
146 0.23
147 0.21
148 0.17
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.14
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.18
228 0.18
229 0.2
230 0.18
231 0.18
232 0.21
233 0.23
234 0.28
235 0.31
236 0.34
237 0.37
238 0.41
239 0.44
240 0.45
241 0.48
242 0.51
243 0.49
244 0.44
245 0.4
246 0.4
247 0.38
248 0.37
249 0.37
250 0.35
251 0.35
252 0.35
253 0.36
254 0.31
255 0.32
256 0.31
257 0.25
258 0.19
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.17
284 0.2
285 0.22
286 0.21
287 0.22
288 0.2
289 0.3
290 0.31
291 0.28
292 0.28
293 0.27
294 0.29
295 0.27
296 0.23
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.06
302 0.03
303 0.03
304 0.02
305 0.02
306 0.02
307 0.01
308 0.01
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.13
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.15
338 0.15
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.16
360 0.16
361 0.19
362 0.21
363 0.21
364 0.2
365 0.24
366 0.25
367 0.24
368 0.28
369 0.32
370 0.3
371 0.32
372 0.32
373 0.29
374 0.35
375 0.35
376 0.33
377 0.27
378 0.28
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.14
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.16
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.16
395 0.16
396 0.18
397 0.18
398 0.12
399 0.08
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.19
407 0.2
408 0.18
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.18
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.14
436 0.17
437 0.24
438 0.3
439 0.39
440 0.48
441 0.56
442 0.65
443 0.72
444 0.81
445 0.84
446 0.88
447 0.89
448 0.89
449 0.88
450 0.88
451 0.85
452 0.77
453 0.69
454 0.6
455 0.55
456 0.44
457 0.38
458 0.3
459 0.22
460 0.19
461 0.16
462 0.15
463 0.11
464 0.12
465 0.13
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.14
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.13
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.14
487 0.13
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.14
493 0.12
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.13
504 0.18
505 0.23
506 0.28
507 0.29
508 0.31
509 0.34
510 0.42
511 0.48
512 0.51
513 0.51
514 0.54
515 0.61
516 0.6
517 0.61
518 0.54
519 0.49
520 0.43
521 0.42
522 0.42
523 0.37
524 0.35
525 0.34
526 0.33
527 0.29
528 0.27
529 0.27
530 0.2
531 0.17
532 0.17
533 0.15
534 0.17
535 0.17
536 0.16
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.06
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.09
566 0.15
567 0.16
568 0.18
569 0.22
570 0.25
571 0.31
572 0.34
573 0.36
574 0.38
575 0.46
576 0.53
577 0.54
578 0.55
579 0.53
580 0.57
581 0.56
582 0.55
583 0.54
584 0.52
585 0.51
586 0.54
587 0.52
588 0.45
589 0.42
590 0.44
591 0.36
592 0.29
593 0.26
594 0.21
595 0.17
596 0.2
597 0.21
598 0.12
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.17
606 0.19
607 0.18
608 0.21
609 0.21
610 0.2
611 0.24
612 0.23
613 0.27
614 0.28
615 0.28
616 0.27
617 0.31
618 0.38
619 0.34
620 0.34
621 0.31
622 0.3
623 0.3
624 0.33
625 0.32
626 0.31
627 0.3
628 0.3
629 0.3
630 0.3
631 0.28
632 0.24
633 0.26
634 0.27
635 0.29
636 0.28
637 0.27
638 0.32
639 0.34
640 0.34
641 0.32
642 0.3
643 0.3
644 0.3
645 0.3
646 0.24
647 0.26
648 0.28
649 0.26
650 0.22
651 0.2
652 0.21
653 0.21
654 0.2
655 0.16
656 0.12
657 0.11
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.1
664 0.14
665 0.15
666 0.17
667 0.19
668 0.22
669 0.25
670 0.26
671 0.31
672 0.3
673 0.31
674 0.33
675 0.33
676 0.32
677 0.35
678 0.43
679 0.44