FuNGI

A0A397SHC7

Protein Details

Accession

A0A397SHC7

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MSPNKYNQVRRQQPHRSVKESNVNT	Hydrophilic
421-443	NECPERKHDSKKQQLNKLYNRYR	Hydrophilic
461-487	KDNKSRDSKSKGDKPQNQQKQQPRTSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
447-471	HRKPKSYAEAAKANKDNKSRDSKSK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MSPNKYNQVRRQQPHRSVKESNVNTVLGSSSHQRAKSPVPKSLTTSQVHESTSLVKEQDIIAQTYGTSSNSASEEEQRFNKRVRQLDPKINISSSDNTTSSSSNSRDQSTEDTSTSVNIPVVITTAKRTNYSAIAPFDDVKGNSPRAKIQTLTKIFARFDSYTGATSQIIKKLNKEKYMRIFFLNEDDLLNAIKLPITKSVKATSPNTDDPNNVTVPEDQPNQPNPDLVTPPQFYFTKFSDAVPAVDLSAVNDTNQRTVQAHTVRASLSRFGEIDSIKLVTRGLFQHAFITYQSVSAAQSFVTHWGTYILRDAVRVFPKFLTDEQRQLRKKFGCKLTGLPNNIQARDLNDILFATQAKSIFIPRNPVSYKPLNFAYLNYDTEDAKQKAMKTNYKVNGRDLFWCTENARTCNRCGSPSHLFNECPERKHDSKKQQLNKLYNRYRPAQHRKPKSYAEAAKANKDNKSRDSKSKGDKPQNQQKQQPRTSSSVPPLTGGTQQGGSIHGVQSEKFTAMYNEVLKTMKQINTRLSTIDNKIFHLEKRATKQPASLSPHARELAAKNSPQHNEQVNLQEINALKKESSETRSLTNSCVNILKQMQSFMGMDTPADDDEVIDEHDRDDVEDEHMDDEEYDEEGFLKEPTEDNINNLYENWGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.88
3	0.85
4	0.8
5	0.8
6	0.8
7	0.73
8	0.69
9	0.61
10	0.53
11	0.45
12	0.4
13	0.32
14	0.22
15	0.21
16	0.18
17	0.22
18	0.27
19	0.28
20	0.29
21	0.33
22	0.43
23	0.49
24	0.5
25	0.51
26	0.52
27	0.54
28	0.59
29	0.61
30	0.59
31	0.52
32	0.51
33	0.48
34	0.46
35	0.44
36	0.38
37	0.32
38	0.29
39	0.28
40	0.26
41	0.22
42	0.18
43	0.19
44	0.19
45	0.23
46	0.21
47	0.2
48	0.18
49	0.17
50	0.17
51	0.17
52	0.18
53	0.13
54	0.11
55	0.1
56	0.12
57	0.13
58	0.15
59	0.15
60	0.22
61	0.25
62	0.29
63	0.36
64	0.39
65	0.42
66	0.44
67	0.49
68	0.49
69	0.53
70	0.56
71	0.6
72	0.63
73	0.69
74	0.72
75	0.71
76	0.67
77	0.6
78	0.54
79	0.47
80	0.43
81	0.37
82	0.35
83	0.29
84	0.27
85	0.28
86	0.27
87	0.26
88	0.27
89	0.26
90	0.28
91	0.3
92	0.31
93	0.3
94	0.32
95	0.35
96	0.35
97	0.35
98	0.29
99	0.28
100	0.25
101	0.26
102	0.24
103	0.19
104	0.14
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.1
109	0.1
110	0.09
111	0.12
112	0.17
113	0.18
114	0.2
115	0.21
116	0.23
117	0.25
118	0.28
119	0.29
120	0.27
121	0.27
122	0.27
123	0.27
124	0.25
125	0.25
126	0.22
127	0.21
128	0.24
129	0.26
130	0.27
131	0.28
132	0.32
133	0.34
134	0.36
135	0.35
136	0.37
137	0.43
138	0.44
139	0.45
140	0.43
141	0.43
142	0.4
143	0.39
144	0.38
145	0.28
146	0.25
147	0.26
148	0.24
149	0.21
150	0.21
151	0.21
152	0.16
153	0.19
154	0.2
155	0.21
156	0.27
157	0.27
158	0.33
159	0.41
160	0.48
161	0.52
162	0.54
163	0.57
164	0.61
165	0.67
166	0.62
167	0.56
168	0.51
169	0.43
170	0.43
171	0.36
172	0.26
173	0.19
174	0.17
175	0.15
176	0.13
177	0.12
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.15
184	0.2
185	0.22
186	0.24
187	0.27
188	0.3
189	0.35
190	0.37
191	0.35
192	0.37
193	0.4
194	0.4
195	0.39
196	0.36
197	0.34
198	0.33
199	0.27
200	0.21
201	0.18
202	0.16
203	0.17
204	0.2
205	0.2
206	0.19
207	0.24
208	0.27
209	0.3
210	0.28
211	0.27
212	0.24
213	0.24
214	0.25
215	0.22
216	0.24
217	0.21
218	0.21
219	0.24
220	0.23
221	0.22
222	0.23
223	0.23
224	0.23
225	0.22
226	0.22
227	0.23
228	0.24
229	0.23
230	0.19
231	0.18
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.12
243	0.13
244	0.12
245	0.13
246	0.2
247	0.2
248	0.22
249	0.22
250	0.22
251	0.22
252	0.22
253	0.22
254	0.18
255	0.16
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.15
260	0.14
261	0.13
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.07
268	0.09
269	0.1
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.13
277	0.14
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.11
296	0.1
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.14
301	0.18
302	0.18
303	0.17
304	0.16
305	0.17
306	0.19
307	0.2
308	0.22
309	0.19
310	0.26
311	0.3
312	0.39
313	0.42
314	0.42
315	0.47
316	0.45
317	0.49
318	0.5
319	0.51
320	0.47
321	0.44
322	0.47
323	0.5
324	0.51
325	0.48
326	0.41
327	0.42
328	0.4
329	0.38
330	0.34
331	0.25
332	0.2
333	0.21
334	0.2
335	0.13
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.08
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.13
348	0.14
349	0.2
350	0.2
351	0.26
352	0.27
353	0.29
354	0.32
355	0.34
356	0.35
357	0.31
358	0.32
359	0.28
360	0.27
361	0.26
362	0.26
363	0.22
364	0.22
365	0.19
366	0.19
367	0.16
368	0.18
369	0.24
370	0.19
371	0.18
372	0.2
373	0.21
374	0.27
375	0.33
376	0.38
377	0.35
378	0.44
379	0.49
380	0.55
381	0.55
382	0.53
383	0.51
384	0.46
385	0.46
386	0.4
387	0.36
388	0.29
389	0.29
390	0.25
391	0.25
392	0.27
393	0.26
394	0.3
395	0.29
396	0.3
397	0.34
398	0.35
399	0.32
400	0.3
401	0.34
402	0.35
403	0.38
404	0.39
405	0.36
406	0.35
407	0.34
408	0.43
409	0.39
410	0.33
411	0.32
412	0.36
413	0.38
414	0.47
415	0.54
416	0.54
417	0.62
418	0.7
419	0.75
420	0.76
421	0.81
422	0.82
423	0.81
424	0.81
425	0.79
426	0.76
427	0.71
428	0.67
429	0.66
430	0.67
431	0.68
432	0.68
433	0.7
434	0.74
435	0.77
436	0.79
437	0.78
438	0.73
439	0.72
440	0.67
441	0.63
442	0.61
443	0.56
444	0.57
445	0.57
446	0.54
447	0.5
448	0.5
449	0.49
450	0.47
451	0.55
452	0.53
453	0.57
454	0.61
455	0.63
456	0.67
457	0.72
458	0.75
459	0.76
460	0.8
461	0.8
462	0.84
463	0.87
464	0.84
465	0.84
466	0.83
467	0.83
468	0.81
469	0.78
470	0.72
471	0.67
472	0.64
473	0.61
474	0.58
475	0.53
476	0.47
477	0.4
478	0.37
479	0.33
480	0.3
481	0.25
482	0.19
483	0.14
484	0.14
485	0.13
486	0.13
487	0.13
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.12
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.12
497	0.13
498	0.12
499	0.13
500	0.17
501	0.17
502	0.16
503	0.17
504	0.18
505	0.17
506	0.19
507	0.23
508	0.25
509	0.27
510	0.31
511	0.37
512	0.41
513	0.42
514	0.4
515	0.38
516	0.38
517	0.39
518	0.41
519	0.35
520	0.32
521	0.35
522	0.36
523	0.33
524	0.36
525	0.37
526	0.37
527	0.43
528	0.5
529	0.51
530	0.5
531	0.54
532	0.52
533	0.55
534	0.57
535	0.57
536	0.55
537	0.52
538	0.56
539	0.52
540	0.46
541	0.4
542	0.35
543	0.36
544	0.35
545	0.35
546	0.35
547	0.41
548	0.44
549	0.43
550	0.46
551	0.42
552	0.39
553	0.4
554	0.41
555	0.39
556	0.36
557	0.33
558	0.31
559	0.28
560	0.3
561	0.28
562	0.22
563	0.18
564	0.18
565	0.23
566	0.26
567	0.29
568	0.3
569	0.3
570	0.33
571	0.4
572	0.4
573	0.39
574	0.38
575	0.34
576	0.31
577	0.33
578	0.29
579	0.3
580	0.31
581	0.33
582	0.29
583	0.3
584	0.28
585	0.26
586	0.26
587	0.21
588	0.2
589	0.15
590	0.14
591	0.13
592	0.14
593	0.12
594	0.12
595	0.1
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.13
605	0.12
606	0.14
607	0.13
608	0.15
609	0.16
610	0.17
611	0.16
612	0.16
613	0.15
614	0.13
615	0.13
616	0.1
617	0.1
618	0.09
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.1
627	0.13
628	0.2
629	0.19
630	0.23
631	0.28
632	0.28
633	0.28
634	0.27

A0A397SHC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer