Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SD03

Protein Details
Accession A0A397SD03    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-64EFIQVSDHSKKKRRQKSIKAVAVIPHydrophilic
141-166TNNVKKGKSNIKSRKDNKKKGRIITWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-57KKKRRQKSI
145-162KKGKSNIKSRKDNKKKGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.833, cyto 6, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MVLYFHDELISSESHPLVLNPPYVLTLSIKDLTTPKDPKEFIQVSDHSKKKRRQKSIKAVAVIPRPHNAFIIFRNDYAAKVKRMSNQQKISIRLISKMASRQWKQESDVVKLFFKLLADMYQQRHKVIYPNYKFSPKINSTNNVKKGKSNIKSRKDNKKKGRIITWYIHDNIEKMLRNGDNEETDTFRYTDLNINNQEDLDKYIQVPEQKTNYPVPSVPATFINYTASPSTPLILHSTTTTASSTTAFNSPPPTPPTNFNYYNENNNNSSTLYDASLYDDNASPQLGFIPLETSSSHSSPPSDSSDDCLFWADTSNNNGRDVSLSPYGFSLFNFGDEQNLFEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.18
6 0.19
7 0.17
8 0.17
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.16
13 0.15
14 0.18
15 0.2
16 0.19
17 0.2
18 0.23
19 0.26
20 0.33
21 0.36
22 0.35
23 0.41
24 0.42
25 0.41
26 0.49
27 0.47
28 0.4
29 0.43
30 0.44
31 0.44
32 0.53
33 0.57
34 0.56
35 0.62
36 0.68
37 0.71
38 0.77
39 0.8
40 0.81
41 0.87
42 0.9
43 0.92
44 0.91
45 0.84
46 0.78
47 0.74
48 0.71
49 0.65
50 0.56
51 0.5
52 0.44
53 0.41
54 0.38
55 0.32
56 0.27
57 0.25
58 0.31
59 0.28
60 0.25
61 0.28
62 0.27
63 0.27
64 0.3
65 0.32
66 0.27
67 0.28
68 0.32
69 0.35
70 0.46
71 0.54
72 0.57
73 0.59
74 0.64
75 0.67
76 0.67
77 0.64
78 0.59
79 0.51
80 0.43
81 0.38
82 0.31
83 0.29
84 0.29
85 0.31
86 0.35
87 0.36
88 0.41
89 0.45
90 0.47
91 0.46
92 0.47
93 0.45
94 0.41
95 0.44
96 0.39
97 0.33
98 0.3
99 0.28
100 0.23
101 0.19
102 0.14
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.17
107 0.19
108 0.25
109 0.26
110 0.26
111 0.26
112 0.25
113 0.28
114 0.32
115 0.4
116 0.38
117 0.43
118 0.46
119 0.49
120 0.49
121 0.44
122 0.45
123 0.39
124 0.43
125 0.41
126 0.44
127 0.48
128 0.56
129 0.63
130 0.6
131 0.56
132 0.5
133 0.54
134 0.57
135 0.57
136 0.59
137 0.6
138 0.64
139 0.74
140 0.8
141 0.84
142 0.85
143 0.88
144 0.87
145 0.87
146 0.85
147 0.81
148 0.79
149 0.74
150 0.69
151 0.63
152 0.56
153 0.48
154 0.42
155 0.38
156 0.3
157 0.24
158 0.19
159 0.19
160 0.16
161 0.13
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.15
178 0.15
179 0.2
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.2
185 0.15
186 0.17
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.16
193 0.18
194 0.19
195 0.22
196 0.23
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.14
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.12
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.17
237 0.17
238 0.21
239 0.26
240 0.28
241 0.28
242 0.33
243 0.37
244 0.4
245 0.42
246 0.4
247 0.42
248 0.41
249 0.48
250 0.48
251 0.46
252 0.4
253 0.38
254 0.38
255 0.3
256 0.28
257 0.19
258 0.16
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.14
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.13
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.2
286 0.2
287 0.24
288 0.25
289 0.24
290 0.24
291 0.28
292 0.31
293 0.3
294 0.28
295 0.27
296 0.22
297 0.18
298 0.21
299 0.17
300 0.17
301 0.23
302 0.3
303 0.29
304 0.3
305 0.3
306 0.27
307 0.29
308 0.27
309 0.26
310 0.25
311 0.24
312 0.23
313 0.23
314 0.25
315 0.22
316 0.21
317 0.2
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.16
322 0.2
323 0.2