Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397THM1

Protein Details
Accession A0A397THM1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-59SEIRSRRKSIAERRKSLSRRBasic
175-195EDTSSKRCTRKKNTLTLVKDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-58RRKSIAERRKSLSR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 5.5, cyto_mito 5.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022816  Condensin_barren_su2  
Gene Ontology GO:0000796  C:condensin complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007076  P:mitotic chromosome condensation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05786  Cnd2  
Amino Acid Sequences MALGADHSGACICARNMSSTPRRSLKLYKDNNIPLNDDSSEIRSRRKSIAERRKSLSRREVGSPARTVRTSGGLNLTPSQRDAFTPLEKINVNNSWKLALIDYFHEMTILKEGDSINFVRASCTLDGCIKIYSLRVDCISVELVKLLSGLSNKQIKTNVLTYKLANAAVIDEDDEDTSSKRCTRKKNTLTLVKDYSLLTIKTFDLEFSVDPLFKKTSANFDESGAHGLLLNNLSVDTDGKIIFDASDAIPIGNDDENGNDTIATEEDNEPKIDFSKLRSKYLSGLQQIFNKEICPSLRNFEFSGDNILDFAYISSDSEGEDGFVINNNDVIQNYNNDYNNDYNNDYNNDYNNGNENFNLNDNLNDSFDNLNINDNISGVFDEDDINQRARLTEKDYVMAMASNEDGLFSYFDSAFLRNWAGPEHWKLKRINRRSTETEGETRERRKKEPITINFTESDDLDEQVIFSSGESIINAPKLAEEVSHGHLLPDDMHFSSKNLLQLFLKSQFMLKSKRRYEAQLDNNDDVDIDANFWANQNNDPAATSFPDIPMITGGNGDDYGNDVDYGDYGYDEELDEIGDLINQTKGNKPEFINYSKTMKRVDIRKLKENIWKTMDNLQDNERRSSNNRLSTSSRRSRELKFSELICDLEKIYPQKKMKDISVQFCFICLLHISNEKEVVLSNNGRLIELCIALN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.24
4 0.33
5 0.42
6 0.45
7 0.53
8 0.54
9 0.56
10 0.57
11 0.64
12 0.65
13 0.67
14 0.7
15 0.7
16 0.73
17 0.78
18 0.79
19 0.72
20 0.65
21 0.56
22 0.51
23 0.43
24 0.35
25 0.29
26 0.27
27 0.31
28 0.3
29 0.36
30 0.37
31 0.4
32 0.45
33 0.52
34 0.57
35 0.61
36 0.7
37 0.74
38 0.76
39 0.78
40 0.83
41 0.8
42 0.79
43 0.78
44 0.74
45 0.68
46 0.66
47 0.69
48 0.65
49 0.65
50 0.62
51 0.56
52 0.54
53 0.49
54 0.46
55 0.39
56 0.37
57 0.32
58 0.29
59 0.3
60 0.27
61 0.29
62 0.31
63 0.32
64 0.28
65 0.28
66 0.27
67 0.22
68 0.21
69 0.23
70 0.23
71 0.24
72 0.27
73 0.26
74 0.29
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.34
79 0.34
80 0.33
81 0.33
82 0.29
83 0.29
84 0.28
85 0.23
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.18
96 0.16
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.17
102 0.17
103 0.14
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.19
120 0.18
121 0.19
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.14
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.16
138 0.22
139 0.22
140 0.26
141 0.29
142 0.29
143 0.32
144 0.37
145 0.35
146 0.34
147 0.36
148 0.33
149 0.34
150 0.34
151 0.29
152 0.23
153 0.17
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.15
167 0.22
168 0.29
169 0.39
170 0.48
171 0.59
172 0.67
173 0.75
174 0.79
175 0.82
176 0.81
177 0.78
178 0.71
179 0.61
180 0.53
181 0.43
182 0.36
183 0.29
184 0.24
185 0.17
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.16
202 0.15
203 0.23
204 0.25
205 0.28
206 0.26
207 0.26
208 0.27
209 0.26
210 0.27
211 0.18
212 0.15
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.15
262 0.23
263 0.26
264 0.29
265 0.3
266 0.3
267 0.31
268 0.36
269 0.38
270 0.33
271 0.34
272 0.33
273 0.36
274 0.36
275 0.34
276 0.29
277 0.22
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.13
282 0.13
283 0.16
284 0.17
285 0.19
286 0.19
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.2
291 0.15
292 0.14
293 0.12
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.08
318 0.07
319 0.08
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.17
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.13
337 0.13
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.09
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.09
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.18
380 0.19
381 0.19
382 0.19
383 0.19
384 0.18
385 0.16
386 0.11
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.13
409 0.19
410 0.25
411 0.27
412 0.32
413 0.36
414 0.44
415 0.53
416 0.59
417 0.63
418 0.62
419 0.67
420 0.67
421 0.69
422 0.65
423 0.59
424 0.55
425 0.49
426 0.47
427 0.45
428 0.47
429 0.48
430 0.47
431 0.45
432 0.5
433 0.52
434 0.57
435 0.63
436 0.63
437 0.64
438 0.63
439 0.62
440 0.55
441 0.49
442 0.4
443 0.29
444 0.24
445 0.16
446 0.14
447 0.12
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.06
453 0.05
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.08
468 0.11
469 0.13
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.13
476 0.11
477 0.11
478 0.09
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.14
483 0.15
484 0.18
485 0.16
486 0.17
487 0.17
488 0.19
489 0.23
490 0.23
491 0.22
492 0.18
493 0.2
494 0.22
495 0.26
496 0.33
497 0.36
498 0.43
499 0.47
500 0.53
501 0.54
502 0.56
503 0.59
504 0.6
505 0.62
506 0.61
507 0.62
508 0.57
509 0.54
510 0.49
511 0.41
512 0.31
513 0.22
514 0.12
515 0.08
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.13
524 0.14
525 0.13
526 0.14
527 0.15
528 0.14
529 0.15
530 0.15
531 0.13
532 0.13
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.05
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.08
569 0.1
570 0.11
571 0.17
572 0.22
573 0.24
574 0.29
575 0.3
576 0.35
577 0.4
578 0.43
579 0.44
580 0.43
581 0.47
582 0.46
583 0.48
584 0.43
585 0.43
586 0.46
587 0.48
588 0.55
589 0.57
590 0.61
591 0.67
592 0.69
593 0.69
594 0.71
595 0.69
596 0.67
597 0.63
598 0.58
599 0.52
600 0.55
601 0.55
602 0.49
603 0.46
604 0.45
605 0.45
606 0.46
607 0.48
608 0.42
609 0.4
610 0.4
611 0.48
612 0.5
613 0.52
614 0.52
615 0.53
616 0.58
617 0.63
618 0.69
619 0.68
620 0.64
621 0.62
622 0.64
623 0.65
624 0.69
625 0.65
626 0.61
627 0.56
628 0.53
629 0.52
630 0.48
631 0.44
632 0.34
633 0.3
634 0.25
635 0.22
636 0.25
637 0.27
638 0.3
639 0.37
640 0.42
641 0.47
642 0.53
643 0.56
644 0.58
645 0.62
646 0.66
647 0.65
648 0.65
649 0.62
650 0.55
651 0.5
652 0.44
653 0.33
654 0.28
655 0.2
656 0.16
657 0.17
658 0.25
659 0.27
660 0.28
661 0.3
662 0.28
663 0.26
664 0.25
665 0.24
666 0.24
667 0.24
668 0.23
669 0.25
670 0.26
671 0.26
672 0.25
673 0.25
674 0.21