Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397TDK5

Protein Details
Accession A0A397TDK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-74NTRVSKHTCNFKHKKRKSEKKVAWSKEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-67KHKKRKSEKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSNIEQRNYNKNNKICFNCKRPEHFARNCRVSREVKSKSLAIRNSQNTRVSKHTCNFKHKKRKSEKKVAWSKEDECAKAYVNAEQEVLSIPGTSVIEDIQYAISLLNEQYKAETWPDQFKPKYDLSLAESPTKEALIAGRIMVEFSNLTAKLHQELNYDPYWAINETSRILSKVKGVAYDDDDLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.74
4 0.73
5 0.74
6 0.75
7 0.75
8 0.75
9 0.77
10 0.78
11 0.78
12 0.78
13 0.78
14 0.8
15 0.75
16 0.7
17 0.67
18 0.62
19 0.61
20 0.62
21 0.58
22 0.54
23 0.55
24 0.54
25 0.55
26 0.57
27 0.53
28 0.48
29 0.51
30 0.54
31 0.57
32 0.58
33 0.58
34 0.52
35 0.52
36 0.54
37 0.5
38 0.49
39 0.5
40 0.54
41 0.55
42 0.63
43 0.69
44 0.72
45 0.78
46 0.78
47 0.84
48 0.85
49 0.89
50 0.88
51 0.9
52 0.87
53 0.86
54 0.89
55 0.83
56 0.78
57 0.72
58 0.64
59 0.59
60 0.55
61 0.45
62 0.36
63 0.32
64 0.26
65 0.23
66 0.22
67 0.18
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.1
74 0.1
75 0.07
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.14
101 0.13
102 0.2
103 0.23
104 0.3
105 0.31
106 0.32
107 0.35
108 0.33
109 0.33
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.3
114 0.3
115 0.3
116 0.29
117 0.28
118 0.27
119 0.24
120 0.18
121 0.12
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.15
139 0.18
140 0.2
141 0.18
142 0.2
143 0.24
144 0.24
145 0.24
146 0.21
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.16
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.21
159 0.23
160 0.26
161 0.25
162 0.26
163 0.27
164 0.29
165 0.32