FuNGI

A0A397TA91

Protein Details

Accession

A0A397TA91

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
46-73	LKWLQLRRCDRVERKSKKKYLAHLDEQG	Hydrophilic
106-126	RGIVYQVKKKQFPKNQKEIEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto_nucl 8.5, cyto 7, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7

Amino Acid Sequences

MLRQAATLLKSQTPLIASGIEKSLFDNSPLVVRVQEKGEVDGLYVLKWLQLRRCDRVERKSKKKYLAHLDEQGIVKTEEELILMKILGKRPQKFVNASLYLPTEERGIVYQVKKKQFPKNQKEIELVEIYVVHERKIEVGDKLTTRFGNKGVVAKIVPESQMPFDEEGKTIDIIFNPLGVPTRMNSGQLLEVILASAARKLDTKLLVRPFNTLSLEAIKSISQEAGIKNFGSQKLFDGQTGLPFQQEIYNGYIYVLKLNHMVTDKFHARNTGSYSLLYQQPLKGRSRGGGQRVGEMEVGDMQAHGASYNLMEMMGPKSDDIYKRRLMRNSLYFDNRQIDLRSNNRGLFDPRIFGPYLNYECHCGKYKGKQNEGQICERCETLIALFKVLATDLSNILKISVKDLEDIIYLRSYIVVDNGLTKIIADKQLSDEIITQAQQLIEGLVQEDNPDNSETKSVFLEDYQDFLENESLLQKLSGKEGILRRYSLGKRVDYSARSVIVPNPTLQLEQVGLPDKIVFFWLDKIIQNHPVLVNRAPSLHRLSIQAFYPQLTLGNSIELHPLVTTALNADFDGDQVAIYLPLTKQCQKEAKELMLSPQHIIDPKNGYLIDNPTQDMILGIYYLTKEKKGKNLVYYDEINNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.2
3	0.2
4	0.18
5	0.19
6	0.22
7	0.19
8	0.18
9	0.18
10	0.22
11	0.19
12	0.2
13	0.19
14	0.17
15	0.2
16	0.21
17	0.2
18	0.18
19	0.2
20	0.21
21	0.22
22	0.26
23	0.23
24	0.24
25	0.26
26	0.23
27	0.22
28	0.22
29	0.2
30	0.15
31	0.15
32	0.13
33	0.13
34	0.16
35	0.2
36	0.23
37	0.32
38	0.38
39	0.45
40	0.52
41	0.6
42	0.66
43	0.73
44	0.77
45	0.79
46	0.83
47	0.87
48	0.88
49	0.88
50	0.86
51	0.85
52	0.86
53	0.84
54	0.81
55	0.78
56	0.71
57	0.66
58	0.6
59	0.51
60	0.42
61	0.32
62	0.25
63	0.18
64	0.16
65	0.11
66	0.1
67	0.11
68	0.09
69	0.1
70	0.09
71	0.12
72	0.15
73	0.19
74	0.26
75	0.33
76	0.37
77	0.42
78	0.49
79	0.53
80	0.54
81	0.55
82	0.57
83	0.51
84	0.48
85	0.45
86	0.39
87	0.34
88	0.3
89	0.25
90	0.17
91	0.14
92	0.14
93	0.12
94	0.14
95	0.18
96	0.23
97	0.3
98	0.36
99	0.44
100	0.51
101	0.57
102	0.65
103	0.69
104	0.75
105	0.79
106	0.82
107	0.82
108	0.79
109	0.77
110	0.68
111	0.63
112	0.53
113	0.42
114	0.32
115	0.25
116	0.21
117	0.21
118	0.19
119	0.14
120	0.14
121	0.14
122	0.15
123	0.17
124	0.19
125	0.15
126	0.18
127	0.22
128	0.23
129	0.25
130	0.27
131	0.25
132	0.25
133	0.25
134	0.23
135	0.24
136	0.24
137	0.27
138	0.25
139	0.26
140	0.24
141	0.23
142	0.24
143	0.21
144	0.2
145	0.15
146	0.16
147	0.15
148	0.16
149	0.17
150	0.16
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.16
155	0.16
156	0.15
157	0.13
158	0.12
159	0.11
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.08
169	0.14
170	0.14
171	0.15
172	0.15
173	0.14
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.04
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.07
187	0.08
188	0.12
189	0.17
190	0.19
191	0.25
192	0.32
193	0.35
194	0.35
195	0.37
196	0.34
197	0.33
198	0.32
199	0.26
200	0.2
201	0.19
202	0.19
203	0.16
204	0.16
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.1
209	0.07
210	0.1
211	0.1
212	0.12
213	0.13
214	0.12
215	0.14
216	0.17
217	0.18
218	0.17
219	0.16
220	0.16
221	0.2
222	0.2
223	0.19
224	0.18
225	0.16
226	0.18
227	0.2
228	0.18
229	0.13
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.14
240	0.12
241	0.13
242	0.11
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.18
251	0.22
252	0.22
253	0.23
254	0.23
255	0.22
256	0.25
257	0.29
258	0.25
259	0.22
260	0.2
261	0.2
262	0.2
263	0.22
264	0.2
265	0.16
266	0.15
267	0.19
268	0.23
269	0.24
270	0.24
271	0.22
272	0.23
273	0.29
274	0.31
275	0.31
276	0.33
277	0.31
278	0.32
279	0.32
280	0.31
281	0.25
282	0.19
283	0.15
284	0.1
285	0.09
286	0.06
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.09
306	0.13
307	0.15
308	0.19
309	0.24
310	0.3
311	0.35
312	0.38
313	0.39
314	0.42
315	0.46
316	0.46
317	0.45
318	0.43
319	0.4
320	0.39
321	0.37
322	0.32
323	0.26
324	0.22
325	0.21
326	0.22
327	0.24
328	0.27
329	0.27
330	0.27
331	0.27
332	0.27
333	0.27
334	0.27
335	0.24
336	0.2
337	0.18
338	0.19
339	0.19
340	0.17
341	0.16
342	0.16
343	0.17
344	0.17
345	0.17
346	0.19
347	0.19
348	0.22
349	0.24
350	0.22
351	0.24
352	0.31
353	0.4
354	0.45
355	0.5
356	0.52
357	0.57
358	0.63
359	0.63
360	0.61
361	0.55
362	0.49
363	0.43
364	0.38
365	0.3
366	0.21
367	0.17
368	0.11
369	0.15
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.08
383	0.09
384	0.11
385	0.1
386	0.12
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.14
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.13
412	0.12
413	0.12
414	0.15
415	0.17
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.13
420	0.14
421	0.14
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.05
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.13
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.16
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.14
454	0.15
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.12
464	0.13
465	0.12
466	0.18
467	0.23
468	0.29
469	0.29
470	0.29
471	0.28
472	0.35
473	0.37
474	0.39
475	0.39
476	0.36
477	0.36
478	0.4
479	0.44
480	0.37
481	0.4
482	0.36
483	0.32
484	0.3
485	0.29
486	0.28
487	0.27
488	0.27
489	0.23
490	0.22
491	0.21
492	0.21
493	0.19
494	0.17
495	0.12
496	0.12
497	0.13
498	0.15
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.13
503	0.12
504	0.13
505	0.11
506	0.08
507	0.11
508	0.13
509	0.15
510	0.18
511	0.21
512	0.23
513	0.29
514	0.28
515	0.28
516	0.28
517	0.3
518	0.3
519	0.3
520	0.29
521	0.24
522	0.26
523	0.25
524	0.27
525	0.29
526	0.29
527	0.28
528	0.28
529	0.3
530	0.3
531	0.3
532	0.3
533	0.25
534	0.23
535	0.22
536	0.19
537	0.18
538	0.15
539	0.17
540	0.13
541	0.15
542	0.14
543	0.14
544	0.16
545	0.15
546	0.14
547	0.11
548	0.11
549	0.09
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.11
557	0.1
558	0.1
559	0.11
560	0.09
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.06
565	0.06
566	0.09
567	0.08
568	0.13
569	0.19
570	0.25
571	0.27
572	0.35
573	0.43
574	0.45
575	0.53
576	0.54
577	0.55
578	0.55
579	0.53
580	0.52
581	0.51
582	0.49
583	0.41
584	0.36
585	0.34
586	0.31
587	0.31
588	0.3
589	0.28
590	0.28
591	0.31
592	0.3
593	0.28
594	0.29
595	0.34
596	0.35
597	0.31
598	0.31
599	0.27
600	0.27
601	0.25
602	0.21
603	0.16
604	0.09
605	0.07
606	0.06
607	0.07
608	0.08
609	0.13
610	0.15
611	0.21
612	0.27
613	0.33
614	0.43
615	0.51
616	0.57
617	0.61
618	0.66
619	0.66
620	0.65
621	0.65

A0A397TA91

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer