Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHF5

Protein Details
Accession A0A397SHF5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-91IISSTKESNKKSTKKTKKKKIKKIKDEKIPPSISSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-84NKKSTKKTKKKKIKKIKDEK
Subcellular Location(s) golg 8, E.R. 7, mito 4, pero 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008397  Alginate_lyase_dom  
IPR008929  Chondroitin_lyas  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0042597  C:periplasmic space  
GO:0016829  F:lyase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05426  Alginate_lyase  
Amino Acid Sequences MLYQKILTLTVFGTICFIILWTFGPIENSTKEGPLPLDVNFPEPQPNDIQQSEVIEIISSTKESNKKSTKKTKKKKIKKIKDEKIPPSISSKLSTVYDVDGNPKDYINSRNYANYLSILRQQHHQMLSNLLNKADKALKNDSVYSVTLKPQLAPSNDPHDYMSLARYFWPNLTKSDGLPYIGRDGYTNPEIETVKDYSFLRKLFKDVENLGFAYYFTRNDSYVEKAVYRIKEWFINPKTRMNPNLEYASFIKGHESGRKTGVLDMHPIYRMLQSIPLMRSSRKWDHSAEEQLKKWISTYYNWLETTPLGTGEKEAKNNHGTYYDVQAIYLLSYLGREEEVRKYSRNALIHRVDTGILPTGQQPHETKRPTSWFYSVFNLQALFLLAERSQYYGFDGWNYVGPXGQSIKKAVDYLLPFALSNGRGWPFKNIKEFEMNSFVRILELAFVIWPDDKYLEALIILRPKAKLEQALEYRNAEWEDNYLCVWSLMTNKQLWTCVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.11
4 0.11
5 0.07
6 0.07
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.13
12 0.14
13 0.18
14 0.19
15 0.21
16 0.21
17 0.21
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.2
23 0.18
24 0.23
25 0.22
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.27
30 0.26
31 0.28
32 0.27
33 0.3
34 0.32
35 0.31
36 0.32
37 0.27
38 0.28
39 0.26
40 0.22
41 0.18
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.09
48 0.15
49 0.22
50 0.25
51 0.35
52 0.44
53 0.52
54 0.62
55 0.73
56 0.78
57 0.83
58 0.91
59 0.92
60 0.93
61 0.96
62 0.96
63 0.97
64 0.96
65 0.96
66 0.97
67 0.96
68 0.95
69 0.94
70 0.91
71 0.89
72 0.81
73 0.71
74 0.65
75 0.59
76 0.5
77 0.42
78 0.36
79 0.29
80 0.27
81 0.26
82 0.21
83 0.19
84 0.2
85 0.18
86 0.23
87 0.22
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.26
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.27
98 0.28
99 0.28
100 0.26
101 0.23
102 0.21
103 0.2
104 0.25
105 0.25
106 0.25
107 0.27
108 0.3
109 0.33
110 0.34
111 0.36
112 0.3
113 0.33
114 0.37
115 0.39
116 0.36
117 0.31
118 0.29
119 0.25
120 0.27
121 0.29
122 0.25
123 0.26
124 0.3
125 0.34
126 0.35
127 0.36
128 0.35
129 0.3
130 0.28
131 0.26
132 0.22
133 0.2
134 0.22
135 0.22
136 0.21
137 0.22
138 0.27
139 0.26
140 0.28
141 0.29
142 0.33
143 0.33
144 0.33
145 0.3
146 0.25
147 0.23
148 0.21
149 0.2
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.26
163 0.24
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.17
169 0.17
170 0.13
171 0.13
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.12
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.15
181 0.14
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.21
189 0.23
190 0.26
191 0.28
192 0.28
193 0.27
194 0.28
195 0.26
196 0.25
197 0.23
198 0.18
199 0.16
200 0.13
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.2
214 0.2
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.21
219 0.22
220 0.29
221 0.29
222 0.36
223 0.37
224 0.41
225 0.44
226 0.44
227 0.47
228 0.43
229 0.42
230 0.37
231 0.38
232 0.32
233 0.3
234 0.27
235 0.25
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.13
240 0.15
241 0.18
242 0.19
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.12
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.14
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.19
266 0.21
267 0.27
268 0.32
269 0.32
270 0.35
271 0.33
272 0.36
273 0.4
274 0.47
275 0.47
276 0.45
277 0.42
278 0.42
279 0.41
280 0.36
281 0.32
282 0.25
283 0.2
284 0.17
285 0.23
286 0.24
287 0.28
288 0.28
289 0.27
290 0.25
291 0.23
292 0.23
293 0.15
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.1
298 0.16
299 0.18
300 0.21
301 0.22
302 0.25
303 0.28
304 0.29
305 0.28
306 0.23
307 0.22
308 0.2
309 0.23
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.14
316 0.12
317 0.08
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.08
325 0.14
326 0.18
327 0.2
328 0.22
329 0.25
330 0.31
331 0.36
332 0.39
333 0.37
334 0.41
335 0.44
336 0.43
337 0.41
338 0.36
339 0.3
340 0.25
341 0.23
342 0.16
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.16
347 0.16
348 0.2
349 0.21
350 0.26
351 0.34
352 0.37
353 0.37
354 0.39
355 0.46
356 0.45
357 0.47
358 0.45
359 0.4
360 0.4
361 0.43
362 0.38
363 0.32
364 0.29
365 0.25
366 0.2
367 0.17
368 0.15
369 0.1
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.13
384 0.15
385 0.16
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.15
390 0.16
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.2
396 0.2
397 0.23
398 0.23
399 0.22
400 0.21
401 0.21
402 0.19
403 0.19
404 0.22
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.21
411 0.3
412 0.33
413 0.38
414 0.46
415 0.44
416 0.46
417 0.53
418 0.54
419 0.49
420 0.51
421 0.45
422 0.37
423 0.36
424 0.31
425 0.23
426 0.21
427 0.16
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.1
443 0.11
444 0.13
445 0.19
446 0.2
447 0.21
448 0.22
449 0.24
450 0.27
451 0.3
452 0.34
453 0.31
454 0.4
455 0.45
456 0.5
457 0.51
458 0.5
459 0.46
460 0.43
461 0.41
462 0.32
463 0.25
464 0.23
465 0.21
466 0.2
467 0.19
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.16
474 0.19
475 0.23
476 0.25
477 0.28
478 0.3