Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SVH5

Protein Details
Accession A0A397SVH5    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-62QLTLPRVDKKNPPPRPQNSFILHydrophilic
111-156YVPPGKKTSSKSLPKRKTSSKKKISSKLLRKKKISSKSHKRKTSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-162GKKTSSKSLPKRKTSSKKKISSKLLRKKKISSKSHKRKTSSTSLPKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MNMINSYIPDPSKINDDDELISLIYELSERIPYRLNLTLDQLTLPRVDKKNPPPRPQNSFILYMRNWWNGPSKCKNPKDAKIIWKDPNIKQLFEVIYQLCLIRHKQLFPNYVPPGKKTSSKSLPKRKTSSKKKISSKLLRKKKISSKSHKRKTSSTSLPKRKTSPISSPQPQVESRPMNYEFYELHVTNSNPSQEDMELMAIQKFPEYTPPQPQVESSLMNHEFHKFHITNLNPSQEDMELMAIQRFEEMLISEYTPPQVELSPMNYEFNNFQDIDLNPSQEDMKLMAIQIFEAFMPEYTPPQPQVESSPMNHEFYEFNVTNFNSSQEDMEFMERQRFEETFMPEYTSGYTPPQAQVESSPMNHEFHEFHVTNLDSSQEDMGLMAIQRFEETFMPEYTRLEEFDFLKTMNFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.28
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.19
8 0.17
9 0.14
10 0.12
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.12
16 0.13
17 0.15
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.31
22 0.33
23 0.29
24 0.34
25 0.34
26 0.31
27 0.31
28 0.27
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.25
33 0.26
34 0.32
35 0.4
36 0.5
37 0.6
38 0.67
39 0.75
40 0.77
41 0.82
42 0.85
43 0.81
44 0.78
45 0.71
46 0.68
47 0.6
48 0.57
49 0.48
50 0.46
51 0.45
52 0.41
53 0.37
54 0.33
55 0.41
56 0.38
57 0.47
58 0.5
59 0.55
60 0.61
61 0.67
62 0.74
63 0.74
64 0.78
65 0.78
66 0.77
67 0.77
68 0.76
69 0.79
70 0.75
71 0.74
72 0.74
73 0.68
74 0.7
75 0.62
76 0.53
77 0.45
78 0.44
79 0.37
80 0.3
81 0.31
82 0.21
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.2
90 0.22
91 0.25
92 0.32
93 0.39
94 0.43
95 0.43
96 0.51
97 0.48
98 0.52
99 0.49
100 0.45
101 0.44
102 0.41
103 0.45
104 0.4
105 0.45
106 0.49
107 0.58
108 0.66
109 0.71
110 0.78
111 0.8
112 0.83
113 0.85
114 0.85
115 0.87
116 0.87
117 0.87
118 0.87
119 0.87
120 0.89
121 0.89
122 0.89
123 0.88
124 0.88
125 0.88
126 0.87
127 0.83
128 0.83
129 0.81
130 0.81
131 0.8
132 0.81
133 0.82
134 0.84
135 0.89
136 0.88
137 0.83
138 0.79
139 0.76
140 0.74
141 0.73
142 0.73
143 0.74
144 0.76
145 0.78
146 0.75
147 0.73
148 0.69
149 0.66
150 0.61
151 0.59
152 0.58
153 0.6
154 0.6
155 0.6
156 0.55
157 0.52
158 0.47
159 0.4
160 0.38
161 0.33
162 0.29
163 0.3
164 0.3
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.19
169 0.19
170 0.22
171 0.17
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.19
177 0.16
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.11
194 0.15
195 0.17
196 0.23
197 0.27
198 0.28
199 0.28
200 0.28
201 0.26
202 0.24
203 0.23
204 0.17
205 0.2
206 0.2
207 0.21
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.24
213 0.18
214 0.18
215 0.24
216 0.24
217 0.28
218 0.31
219 0.34
220 0.27
221 0.27
222 0.27
223 0.2
224 0.19
225 0.13
226 0.1
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.11
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.12
259 0.12
260 0.15
261 0.15
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.14
269 0.15
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.13
288 0.14
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.2
293 0.23
294 0.25
295 0.24
296 0.3
297 0.31
298 0.32
299 0.31
300 0.28
301 0.23
302 0.21
303 0.28
304 0.21
305 0.18
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.13
315 0.15
316 0.14
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.23
321 0.22
322 0.23
323 0.25
324 0.23
325 0.24
326 0.27
327 0.31
328 0.28
329 0.28
330 0.3
331 0.27
332 0.27
333 0.27
334 0.22
335 0.19
336 0.17
337 0.19
338 0.18
339 0.21
340 0.22
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.24
345 0.25
346 0.24
347 0.26
348 0.26
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.22
353 0.22
354 0.3
355 0.25
356 0.24
357 0.28
358 0.29
359 0.26
360 0.26
361 0.24
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.11
378 0.15
379 0.17
380 0.18
381 0.22
382 0.23
383 0.24
384 0.25
385 0.25
386 0.23
387 0.22
388 0.25
389 0.22
390 0.25
391 0.25
392 0.22