Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T0R3

Protein Details
Accession A0A397T0R3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-183QVTRDLKEKGRKNKRISWKYIWKTYCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-170GRKN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039690  SNRNP25  
IPR040610  SNRNP25_ubiquitin  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0005689  C:U12-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF18036  Ubiquitin_4  
CDD cd17058  Ubl_SNRNP25  
Amino Acid Sequences MEDYNIPPPSMPPIPPLPPPPLPDPPLISSLPTSSLSTTNLFSNPIVPDEDIKLNETQKMLQQLFQDPLLSDLTKYISNDKNNCDLLNRSNSKNTSSMIGSLTTTTNSIILEQVDTLIALEMGTAFEINILRCGLEPLKMIVRQNATIADIKNLIILQVTRDLKEKGRKNKRISWKYIWKTYCLMFEGQKLLEDKARIQEIGIRSGSVLRFSRYVKKNRTEREK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.41
4 0.41
5 0.41
6 0.45
7 0.47
8 0.47
9 0.47
10 0.46
11 0.46
12 0.42
13 0.41
14 0.37
15 0.32
16 0.26
17 0.24
18 0.23
19 0.2
20 0.19
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.16
36 0.17
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.2
44 0.18
45 0.19
46 0.25
47 0.24
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.27
52 0.27
53 0.24
54 0.16
55 0.17
56 0.16
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.17
64 0.21
65 0.27
66 0.31
67 0.33
68 0.37
69 0.36
70 0.36
71 0.32
72 0.28
73 0.27
74 0.32
75 0.32
76 0.29
77 0.33
78 0.34
79 0.34
80 0.33
81 0.29
82 0.22
83 0.2
84 0.19
85 0.15
86 0.14
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.02
112 0.02
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.14
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.18
149 0.2
150 0.26
151 0.35
152 0.42
153 0.46
154 0.57
155 0.65
156 0.7
157 0.78
158 0.83
159 0.83
160 0.83
161 0.82
162 0.82
163 0.8
164 0.82
165 0.74
166 0.66
167 0.59
168 0.54
169 0.47
170 0.39
171 0.34
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.25
176 0.26
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.24
181 0.23
182 0.25
183 0.28
184 0.24
185 0.23
186 0.27
187 0.26
188 0.3
189 0.28
190 0.22
191 0.2
192 0.24
193 0.24
194 0.25
195 0.24
196 0.21
197 0.25
198 0.29
199 0.39
200 0.44
201 0.53
202 0.57
203 0.65
204 0.72