Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T2U1

Protein Details
Accession A0A397T2U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-445HCKNEIKKTSGRYRKNKRLCAAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
436-436K
448-455KPKRAPEK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR027897  DUF4559  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
CDD cd00048  DSRM_SF  
Amino Acid Sequences MPKDVKGKVKTQAHTIRPVASSTSANNFSIQNSFDPSGLVVLKRWSDNDYNELNPITWLNTIHQKLKTPAPPIYAYTQEVLDKGFYCTVEFLDQRFRSPEIRLKKQEAKEDAARVALLTLEQQMPIIFKRIKDALVKAHTVPKKEGKFCKGVRQIGKSVQPSDMFPRSIEWLKKFKETHNNERPCVMLLEFCQYHKLGQPVYHQKQEWDGRFLMDCEINSRKFSSEHLFWVKKDAKDHISQIAFDILYNEFIDKEQADINRRIKNQKMQQGLYFKEETKKISDVAQQTPLTGFSSNDHVYPSYDAYNNYYINDNIQAANLTFSQPLGYQDPSGNTNNNTINNTLGCNLQQAVDPYGCASSSPPFFNNIDKPTEAYVLPTSTESQTGLPSTSVSYINVANPSTSINQTSISNGFHPYVVPASHCKNEIKKTSGRYRKNKRLCAAAALYKPKRAPEKVISDKNGRLLRKKHVTLLHELCQKRNWERPYFDYHSMYEGYRCTVTINDRIFTGCKLCPKKVDAKEDVAELAYKFYETNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.65
3 0.6
4 0.53
5 0.51
6 0.44
7 0.37
8 0.34
9 0.28
10 0.33
11 0.31
12 0.3
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.27
17 0.26
18 0.21
19 0.23
20 0.23
21 0.21
22 0.21
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.15
28 0.18
29 0.21
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.29
34 0.32
35 0.36
36 0.36
37 0.34
38 0.35
39 0.34
40 0.29
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.24
48 0.28
49 0.33
50 0.35
51 0.39
52 0.41
53 0.48
54 0.51
55 0.48
56 0.48
57 0.47
58 0.46
59 0.44
60 0.45
61 0.4
62 0.35
63 0.31
64 0.29
65 0.24
66 0.22
67 0.2
68 0.17
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.18
77 0.19
78 0.18
79 0.26
80 0.27
81 0.28
82 0.3
83 0.31
84 0.29
85 0.33
86 0.39
87 0.39
88 0.49
89 0.53
90 0.58
91 0.65
92 0.68
93 0.72
94 0.69
95 0.66
96 0.62
97 0.59
98 0.51
99 0.43
100 0.37
101 0.28
102 0.23
103 0.16
104 0.1
105 0.07
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.21
117 0.23
118 0.26
119 0.28
120 0.31
121 0.33
122 0.35
123 0.37
124 0.34
125 0.41
126 0.41
127 0.4
128 0.42
129 0.42
130 0.46
131 0.51
132 0.57
133 0.54
134 0.6
135 0.6
136 0.65
137 0.65
138 0.65
139 0.64
140 0.62
141 0.61
142 0.58
143 0.62
144 0.55
145 0.48
146 0.44
147 0.38
148 0.34
149 0.36
150 0.34
151 0.27
152 0.24
153 0.23
154 0.24
155 0.29
156 0.32
157 0.31
158 0.35
159 0.36
160 0.43
161 0.44
162 0.47
163 0.52
164 0.55
165 0.61
166 0.64
167 0.67
168 0.61
169 0.6
170 0.54
171 0.44
172 0.37
173 0.26
174 0.18
175 0.13
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.15
185 0.18
186 0.27
187 0.35
188 0.39
189 0.43
190 0.41
191 0.39
192 0.45
193 0.49
194 0.43
195 0.36
196 0.32
197 0.28
198 0.29
199 0.28
200 0.22
201 0.16
202 0.14
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.2
211 0.21
212 0.19
213 0.24
214 0.31
215 0.32
216 0.31
217 0.38
218 0.4
219 0.37
220 0.37
221 0.36
222 0.32
223 0.33
224 0.35
225 0.33
226 0.28
227 0.26
228 0.24
229 0.22
230 0.17
231 0.14
232 0.14
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.14
245 0.21
246 0.26
247 0.3
248 0.33
249 0.36
250 0.38
251 0.44
252 0.47
253 0.48
254 0.49
255 0.45
256 0.47
257 0.48
258 0.45
259 0.41
260 0.35
261 0.29
262 0.27
263 0.27
264 0.24
265 0.22
266 0.22
267 0.19
268 0.2
269 0.24
270 0.25
271 0.26
272 0.3
273 0.27
274 0.26
275 0.25
276 0.23
277 0.19
278 0.15
279 0.13
280 0.08
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.15
293 0.17
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.13
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.17
319 0.19
320 0.18
321 0.17
322 0.2
323 0.22
324 0.23
325 0.23
326 0.2
327 0.19
328 0.18
329 0.18
330 0.14
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.1
347 0.12
348 0.14
349 0.15
350 0.18
351 0.19
352 0.24
353 0.28
354 0.27
355 0.28
356 0.26
357 0.27
358 0.25
359 0.26
360 0.21
361 0.18
362 0.17
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.13
368 0.14
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.15
384 0.14
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.16
398 0.17
399 0.17
400 0.16
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.14
406 0.17
407 0.21
408 0.23
409 0.26
410 0.3
411 0.35
412 0.42
413 0.47
414 0.48
415 0.5
416 0.56
417 0.64
418 0.69
419 0.73
420 0.75
421 0.79
422 0.85
423 0.89
424 0.89
425 0.83
426 0.81
427 0.73
428 0.7
429 0.65
430 0.61
431 0.58
432 0.59
433 0.57
434 0.53
435 0.52
436 0.51
437 0.53
438 0.5
439 0.51
440 0.5
441 0.58
442 0.63
443 0.7
444 0.7
445 0.68
446 0.67
447 0.67
448 0.65
449 0.59
450 0.57
451 0.54
452 0.59
453 0.62
454 0.63
455 0.62
456 0.63
457 0.62
458 0.63
459 0.64
460 0.62
461 0.6
462 0.59
463 0.54
464 0.52
465 0.55
466 0.52
467 0.55
468 0.54
469 0.55
470 0.59
471 0.61
472 0.65
473 0.65
474 0.64
475 0.59
476 0.52
477 0.47
478 0.43
479 0.39
480 0.32
481 0.26
482 0.23
483 0.2
484 0.19
485 0.17
486 0.19
487 0.23
488 0.29
489 0.31
490 0.29
491 0.29
492 0.31
493 0.31
494 0.29
495 0.29
496 0.25
497 0.31
498 0.37
499 0.41
500 0.45
501 0.5
502 0.58
503 0.63
504 0.69
505 0.65
506 0.65
507 0.63
508 0.58
509 0.53
510 0.44
511 0.37
512 0.27
513 0.23
514 0.16
515 0.14