FuNGI

A0A397S6F0

Protein Details

Accession

A0A397S6F0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-62	ILNKHLKNNKHIKNVEKNVKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033375 Cggbp1 IPR012337 RNaseH-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MVSASERILESPEYENNFYVNGLKLFCKYCQNIILDHTDVEILNKHLKNNKHIKNVEKNVKVTCQYRNVNEREEINIALVRAFTQANIPLEKADSLKDFFHKFCINGDAIVDSLILQEKYLPTAFDIESSKMREIMYSRRLSIIIDETIDFYGRAVVNVFFSFSGQIILAKTEYLNIVNNTSIAQLIMRTLQFYNIPFNNIIFFISENAEYMIRAFQVLSPLMPQLKHNRCLAHILNLVGESWIYYKNFKFLTNIITNIETSFIQCPARKRRWCDLMNSLNFHTTIPFDQNNNHSNELIILPYLPAKSDWISWYRFICWINQHRSQLCTFYIGEEMIDNESEAIRELTVVFKSPLHSSIFEIFIMFIALNAKRIVDELEFFKTGNKPIAPYVIRRLEKLKTELLFYTIQPPFSNEMNTKFLENNIDPKIYIKMFQEAYQLALNKLKNYINHLALPLLNAIQCFDPRYVRTHCIDINSYSEIEEFKNPTNTIIQEWGFYCNLIEEFGNEELDLNIYWINKNEILPNLSKLALDYIWLPVSGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.27
4	0.27
5	0.25
6	0.23
7	0.21
8	0.18
9	0.18
10	0.19
11	0.22
12	0.25
13	0.27
14	0.33
15	0.33
16	0.36
17	0.41
18	0.41
19	0.4
20	0.41
21	0.43
22	0.36
23	0.33
24	0.28
25	0.22
26	0.2
27	0.19
28	0.18
29	0.15
30	0.23
31	0.24
32	0.29
33	0.35
34	0.4
35	0.49
36	0.57
37	0.63
38	0.65
39	0.7
40	0.74
41	0.78
42	0.83
43	0.83
44	0.79
45	0.74
46	0.68
47	0.68
48	0.64
49	0.58
50	0.54
51	0.54
52	0.53
53	0.57
54	0.62
55	0.59
56	0.59
57	0.58
58	0.52
59	0.47
60	0.43
61	0.35
62	0.28
63	0.25
64	0.2
65	0.17
66	0.15
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.09
71	0.11
72	0.15
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.18
77	0.19
78	0.2
79	0.18
80	0.16
81	0.16
82	0.17
83	0.19
84	0.23
85	0.25
86	0.25
87	0.3
88	0.3
89	0.27
90	0.28
91	0.3
92	0.26
93	0.22
94	0.22
95	0.17
96	0.14
97	0.14
98	0.11
99	0.07
100	0.07
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.09
105	0.09
106	0.12
107	0.13
108	0.12
109	0.11
110	0.14
111	0.14
112	0.16
113	0.18
114	0.18
115	0.21
116	0.24
117	0.23
118	0.21
119	0.21
120	0.2
121	0.21
122	0.27
123	0.32
124	0.32
125	0.32
126	0.32
127	0.32
128	0.3
129	0.3
130	0.25
131	0.18
132	0.16
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.12
138	0.08
139	0.11
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.08
154	0.07
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.11
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.09
170	0.07
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.07
175	0.07
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.12
180	0.12
181	0.18
182	0.16
183	0.19
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.15
188	0.15
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.08
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.13
212	0.21
213	0.26
214	0.3
215	0.32
216	0.32
217	0.32
218	0.37
219	0.36
220	0.32
221	0.28
222	0.24
223	0.22
224	0.21
225	0.2
226	0.14
227	0.12
228	0.06
229	0.05
230	0.07
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.13
235	0.15
236	0.15
237	0.16
238	0.15
239	0.21
240	0.21
241	0.22
242	0.19
243	0.19
244	0.18
245	0.16
246	0.16
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.13
253	0.19
254	0.27
255	0.37
256	0.41
257	0.46
258	0.52
259	0.6
260	0.59
261	0.58
262	0.58
263	0.57
264	0.55
265	0.51
266	0.44
267	0.36
268	0.34
269	0.29
270	0.2
271	0.12
272	0.11
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.15
277	0.2
278	0.24
279	0.26
280	0.26
281	0.22
282	0.2
283	0.21
284	0.18
285	0.13
286	0.09
287	0.06
288	0.05
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.1
296	0.12
297	0.13
298	0.15
299	0.17
300	0.18
301	0.18
302	0.2
303	0.2
304	0.2
305	0.25
306	0.32
307	0.36
308	0.41
309	0.44
310	0.42
311	0.44
312	0.42
313	0.37
314	0.29
315	0.25
316	0.2
317	0.16
318	0.15
319	0.13
320	0.12
321	0.09
322	0.09
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.07
336	0.09
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.12
341	0.15
342	0.15
343	0.16
344	0.17
345	0.19
346	0.19
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.11
351	0.11
352	0.08
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.11
362	0.09
363	0.11
364	0.12
365	0.15
366	0.16
367	0.16
368	0.18
369	0.19
370	0.2
371	0.23
372	0.21
373	0.19
374	0.2
375	0.27
376	0.26
377	0.27
378	0.34
379	0.38
380	0.38
381	0.38
382	0.41
383	0.38
384	0.42
385	0.42
386	0.4
387	0.32
388	0.34
389	0.32
390	0.32
391	0.29
392	0.24
393	0.29
394	0.24
395	0.25
396	0.22
397	0.24
398	0.24
399	0.24
400	0.28
401	0.21
402	0.24
403	0.27
404	0.28
405	0.27
406	0.24
407	0.24
408	0.26
409	0.25
410	0.27
411	0.26
412	0.26
413	0.25
414	0.26
415	0.29
416	0.23
417	0.24
418	0.2
419	0.23
420	0.23
421	0.25
422	0.28
423	0.23
424	0.25
425	0.25
426	0.25
427	0.21
428	0.25
429	0.25
430	0.22
431	0.26
432	0.26
433	0.25
434	0.31
435	0.36
436	0.34
437	0.34
438	0.34
439	0.31
440	0.29
441	0.28
442	0.21
443	0.16
444	0.13
445	0.11
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.14
450	0.15
451	0.18
452	0.19
453	0.25
454	0.3
455	0.33
456	0.36
457	0.39
458	0.39
459	0.39
460	0.41
461	0.37
462	0.36
463	0.33
464	0.3
465	0.25
466	0.23
467	0.19
468	0.18
469	0.21
470	0.2
471	0.22
472	0.28
473	0.28
474	0.29
475	0.32
476	0.31
477	0.29
478	0.32
479	0.28
480	0.25
481	0.26
482	0.27
483	0.23
484	0.22
485	0.19
486	0.15
487	0.15
488	0.14
489	0.13
490	0.1
491	0.14
492	0.15
493	0.15
494	0.13
495	0.13
496	0.12
497	0.13
498	0.12
499	0.09
500	0.1
501	0.1
502	0.12
503	0.13
504	0.18
505	0.19
506	0.21
507	0.24
508	0.27
509	0.3
510	0.32
511	0.33
512	0.31
513	0.29
514	0.27
515	0.24
516	0.22
517	0.18
518	0.17
519	0.15
520	0.15
521	0.16

A0A397S6F0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer