FuNGI

A0A397TQY7

Protein Details

Accession

A0A397TQY7

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
58-84	EDDDYEDRRRDKKRHKGNKNDPSKFIL	Basic
246-265	LYSSKKFIKRLSPKEKQDLM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
65-76	RRRDKKRHKGNK
645-656	RGGRGRGRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR024945 Spt5_C_dom IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF12815 CTD PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MSKRRQNVSDDDESRLNETDGGWSAGEEVGEESVQDQQNDYDEYDDFEQESEGLEEDEDDDYEDRRRDKKRHKGNKNDPSKFILNEADVDDEEEEEDEDEDAIFGKEDFIDNREVETELSAYHRDTTRRADIDIERSVFVEENFDAERVAQVLNERYRRTAGRLSDEDDDLTKPELASVDKLFAVKCRKGHVFHAIEKLENLKKLRSDPLKIKKVIPIDGIEDFVYIEADKEQDVQNAAMRCNKYLYSSKKFIKRLSPKEKQDLMAPKRPRLNIQNGSFVRINKRDEYYGDLARVISYNTDEVVEVEIIPRILVDQDGASLKRKRKDTDTYIKTYNRGYLKVKYKIKDLIYSNMDLLLHDVEDFLKAKFDNESIMMELSNVASKITVYEIQDEIKVLQGSLKSSVGSVISVNDGVLTATDKDNSNKIFKVNSEECVKNINVHDYVQITNGPYQGQSGFVFNCDRHVMTMYLDHTNKQISVFAKDLKKGVQNSINNEFGGYRYFDLVQLKDSSVGIIIDIRKAQKNYEYDVLNTENSLIKSVTAARITRTLIDTKLPAFKKGDQVSMTKSESFNNKQPSIYEVFRINETNVFVRTYDDDTNLGFSCFKTKDLKLKYESARSSNNKINDQQITFPGQRSRGSNNNNRGGRGRGRGRGRDRSVYQHPLVNKRVQASQGALKGYQGTVKGVYGNMADVEFDAKLTTVKVELGQLFHVNEKGEALDPVIPRNHESNRNSMDMSPGLGSYSEPSWTTGLSKQQKSWGYSLGSAMTPNPHLLDNTNSGLNMDGSKTPALHSSGSLSGSKTPALRNSSANNSSNNASLGSKTPAWDLGSKTPAYGLMSDGSKTPAWDSGSHTPHSSGIVGGTGGTSSNSVNNISNIFGGGSSSNSTTNTTNTTINIATAETPGGYSAVATPAADGPNYPPVFTPANTGNLMPPTPRPFTPGNIPMTPANMIPQTPFATQHSANHAVHPGRDPKKPPDVKDFGEWLTPGIEVRIVPIDGIQSFENGRYDNRVGVVVRLERSNSGSIKLDDSDGMTISVEQKYLKPTEVQRRDDIKVIFGEHKGELGFLAAIDNLEGVVRSQGGDHSFINIYYLAKYRGNEIEDLMQISQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.4
3	0.33
4	0.23
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.19
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.14
14	0.11
15	0.09
16	0.09
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.14
21	0.17
22	0.16
23	0.17
24	0.17
25	0.2
26	0.22
27	0.22
28	0.17
29	0.15
30	0.18
31	0.2
32	0.19
33	0.17
34	0.15
35	0.15
36	0.13
37	0.14
38	0.11
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.1
45	0.09
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.16
50	0.2
51	0.24
52	0.31
53	0.4
54	0.49
55	0.59
56	0.68
57	0.75
58	0.82
59	0.88
60	0.92
61	0.94
62	0.94
63	0.95
64	0.91
65	0.84
66	0.8
67	0.73
68	0.63
69	0.56
70	0.49
71	0.39
72	0.34
73	0.32
74	0.27
75	0.22
76	0.22
77	0.18
78	0.14
79	0.13
80	0.11
81	0.1
82	0.08
83	0.09
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.07
94	0.09
95	0.11
96	0.12
97	0.16
98	0.16
99	0.17
100	0.18
101	0.18
102	0.16
103	0.16
104	0.14
105	0.11
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.17
110	0.2
111	0.22
112	0.25
113	0.32
114	0.38
115	0.38
116	0.38
117	0.4
118	0.41
119	0.45
120	0.47
121	0.42
122	0.34
123	0.32
124	0.33
125	0.27
126	0.22
127	0.19
128	0.13
129	0.14
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.12
134	0.13
135	0.1
136	0.1
137	0.08
138	0.11
139	0.18
140	0.25
141	0.31
142	0.32
143	0.33
144	0.37
145	0.39
146	0.41
147	0.41
148	0.39
149	0.42
150	0.44
151	0.45
152	0.44
153	0.43
154	0.38
155	0.33
156	0.28
157	0.21
158	0.2
159	0.17
160	0.13
161	0.13
162	0.14
163	0.14
164	0.16
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.17
169	0.17
170	0.21
171	0.27
172	0.28
173	0.3
174	0.35
175	0.4
176	0.42
177	0.47
178	0.51
179	0.5
180	0.51
181	0.57
182	0.51
183	0.46
184	0.44
185	0.45
186	0.39
187	0.38
188	0.34
189	0.29
190	0.31
191	0.34
192	0.43
193	0.43
194	0.46
195	0.52
196	0.6
197	0.66
198	0.65
199	0.65
200	0.61
201	0.59
202	0.55
203	0.48
204	0.39
205	0.34
206	0.31
207	0.3
208	0.24
209	0.19
210	0.15
211	0.12
212	0.11
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.09
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.16
224	0.18
225	0.2
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.24
230	0.24
231	0.24
232	0.31
233	0.38
234	0.4
235	0.48
236	0.54
237	0.6
238	0.65
239	0.65
240	0.68
241	0.7
242	0.73
243	0.75
244	0.78
245	0.77
246	0.81
247	0.8
248	0.7
249	0.67
250	0.67
251	0.63
252	0.63
253	0.6
254	0.56
255	0.58
256	0.59
257	0.58
258	0.55
259	0.58
260	0.58
261	0.57
262	0.61
263	0.54
264	0.57
265	0.53
266	0.48
267	0.45
268	0.42
269	0.42
270	0.36
271	0.38
272	0.35
273	0.34
274	0.39
275	0.36
276	0.33
277	0.3
278	0.26
279	0.23
280	0.22
281	0.21
282	0.14
283	0.1
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.06
304	0.09
305	0.1
306	0.16
307	0.22
308	0.27
309	0.33
310	0.38
311	0.41
312	0.46
313	0.55
314	0.58
315	0.64
316	0.65
317	0.64
318	0.66
319	0.64
320	0.58
321	0.51
322	0.47
323	0.39
324	0.36
325	0.35
326	0.36
327	0.43
328	0.5
329	0.56
330	0.51
331	0.53
332	0.56
333	0.54
334	0.53
335	0.47
336	0.45
337	0.41
338	0.4
339	0.35
340	0.3
341	0.27
342	0.2
343	0.18
344	0.11
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.07
373	0.1
374	0.1
375	0.12
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.08
407	0.09
408	0.11
409	0.15
410	0.17
411	0.19
412	0.19
413	0.2
414	0.2
415	0.2
416	0.27
417	0.25
418	0.27
419	0.29
420	0.29
421	0.28
422	0.29
423	0.29
424	0.23
425	0.22
426	0.22
427	0.18
428	0.18
429	0.18
430	0.16
431	0.17
432	0.14
433	0.14
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.11
438	0.09
439	0.1
440	0.09
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.09
445	0.1
446	0.12
447	0.11
448	0.13
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.14
456	0.14
457	0.17
458	0.18
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.14
464	0.15
465	0.12
466	0.14
467	0.16
468	0.2
469	0.22
470	0.23
471	0.24
472	0.22
473	0.26
474	0.25
475	0.27
476	0.3
477	0.3
478	0.34
479	0.37
480	0.36
481	0.31
482	0.3
483	0.25
484	0.18
485	0.17
486	0.12
487	0.08
488	0.08
489	0.09
490	0.1
491	0.12
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.12
498	0.1
499	0.08
500	0.08
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.09
506	0.11
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.18
511	0.2
512	0.22
513	0.25
514	0.24
515	0.22
516	0.24
517	0.24
518	0.19
519	0.17
520	0.15
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.15
536	0.14
537	0.13
538	0.14
539	0.13
540	0.13
541	0.19
542	0.19
543	0.19
544	0.2
545	0.22
546	0.29
547	0.3
548	0.32
549	0.26
550	0.28
551	0.28
552	0.3
553	0.29
554	0.23
555	0.21
556	0.2
557	0.24
558	0.27
559	0.3
560	0.32
561	0.31
562	0.3
563	0.3
564	0.31
565	0.29
566	0.26
567	0.22
568	0.19
569	0.19
570	0.2
571	0.2
572	0.17
573	0.14
574	0.15
575	0.14
576	0.12
577	0.12
578	0.11
579	0.11
580	0.12
581	0.14
582	0.14
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.14
587	0.13
588	0.12
589	0.09
590	0.08
591	0.12
592	0.12
593	0.14
594	0.17
595	0.19
596	0.27
597	0.32
598	0.38
599	0.36
600	0.43
601	0.45
602	0.48
603	0.48
604	0.43
605	0.47
606	0.45
607	0.46
608	0.44
609	0.44
610	0.4
611	0.4
612	0.41
613	0.36
614	0.33
615	0.29
616	0.26
617	0.27
618	0.25
619	0.25
620	0.23
621	0.22
622	0.23
623	0.24
624	0.27
625	0.3
626	0.37
627	0.43
628	0.48
629	0.55
630	0.54
631	0.52
632	0.5
633	0.46
634	0.43
635	0.43
636	0.4
637	0.39
638	0.44
639	0.51
640	0.56
641	0.61
642	0.61
643	0.6
644	0.57
645	0.57
646	0.57
647	0.54
648	0.48
649	0.42
650	0.42
651	0.42
652	0.44
653	0.4
654	0.36
655	0.31
656	0.32
657	0.3
658	0.28
659	0.24
660	0.24
661	0.23
662	0.22
663	0.2
664	0.18
665	0.18
666	0.16
667	0.16
668	0.12
669	0.1
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.09
674	0.1
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.06
691	0.06
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.11
696	0.12
697	0.12
698	0.13
699	0.14
700	0.11
701	0.11
702	0.1
703	0.1
704	0.09
705	0.08
706	0.08
707	0.11
708	0.11
709	0.14
710	0.15
711	0.15
712	0.16
713	0.21
714	0.24
715	0.29
716	0.31
717	0.36
718	0.38
719	0.39
720	0.38
721	0.34
722	0.32
723	0.24
724	0.23
725	0.15
726	0.12
727	0.1
728	0.09
729	0.09
730	0.08
731	0.08
732	0.08
733	0.08
734	0.09
735	0.1
736	0.1
737	0.12
738	0.14
739	0.22
740	0.3
741	0.32
742	0.32
743	0.39
744	0.43
745	0.44
746	0.43
747	0.39
748	0.32
749	0.31
750	0.3
751	0.24
752	0.2
753	0.17
754	0.16
755	0.13
756	0.12
757	0.11
758	0.11
759	0.1
760	0.1
761	0.12
762	0.15
763	0.16
764	0.17
765	0.17
766	0.16
767	0.15
768	0.15
769	0.14
770	0.11
771	0.09
772	0.08
773	0.1
774	0.11
775	0.11
776	0.11
777	0.13
778	0.15
779	0.14
780	0.14
781	0.15
782	0.16
783	0.18
784	0.18
785	0.16
786	0.16
787	0.16
788	0.18
789	0.17
790	0.17
791	0.22
792	0.26
793	0.27
794	0.28
795	0.32
796	0.38
797	0.42
798	0.41
799	0.37
800	0.34
801	0.33
802	0.31
803	0.27
804	0.21
805	0.16
806	0.15
807	0.15
808	0.17
809	0.16
810	0.16
811	0.16
812	0.17
813	0.19
814	0.21
815	0.22
816	0.24
817	0.27
818	0.27
819	0.26
820	0.23
821	0.23
822	0.21
823	0.18
824	0.13
825	0.12
826	0.12
827	0.13
828	0.13
829	0.15
830	0.14
831	0.14
832	0.13
833	0.15
834	0.16
835	0.18
836	0.24
837	0.3
838	0.33
839	0.34
840	0.34
841	0.31
842	0.29
843	0.29
844	0.23
845	0.14
846	0.11
847	0.1
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.05
852	0.05
853	0.05
854	0.06
855	0.06
856	0.07
857	0.09
858	0.1
859	0.11
860	0.12
861	0.13
862	0.13
863	0.13
864	0.11
865	0.1
866	0.08
867	0.08
868	0.07
869	0.08
870	0.09
871	0.1
872	0.1
873	0.11
874	0.14
875	0.14
876	0.15
877	0.18
878	0.19
879	0.19
880	0.18
881	0.21
882	0.18
883	0.18
884	0.16
885	0.13
886	0.12
887	0.11
888	0.11
889	0.08
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.06
894	0.05
895	0.06
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.08
900	0.1
901	0.11
902	0.11
903	0.1
904	0.11
905	0.2
906	0.2
907	0.2
908	0.18
909	0.21
910	0.24
911	0.24
912	0.26
913	0.2
914	0.24
915	0.25
916	0.25
917	0.23
918	0.23
919	0.24
920	0.21
921	0.23
922	0.24
923	0.27
924	0.27
925	0.29
926	0.29
927	0.33
928	0.4
929	0.42
930	0.42
931	0.39
932	0.42
933	0.38
934	0.37
935	0.34
936	0.26
937	0.22
938	0.17
939	0.16
940	0.15
941	0.18
942	0.19
943	0.19
944	0.21
945	0.21
946	0.26
947	0.27
948	0.3
949	0.33
950	0.37
951	0.36
952	0.37
953	0.4
954	0.35
955	0.36
956	0.38
957	0.4
958	0.39
959	0.45
960	0.49
961	0.5
962	0.6
963	0.65
964	0.64
965	0.65
966	0.66
967	0.63
968	0.63
969	0.6
970	0.5
971	0.46
972	0.41
973	0.31
974	0.25
975	0.22
976	0.16
977	0.12
978	0.12
979	0.09
980	0.11
981	0.13
982	0.12
983	0.11
984	0.12
985	0.14
986	0.12
987	0.15
988	0.13
989	0.12
990	0.13
991	0.15
992	0.16
993	0.15
994	0.16
995	0.2
996	0.22
997	0.22
998	0.22
999	0.23
1000	0.22
1001	0.23
1002	0.27
1003	0.25
1004	0.26
1005	0.26
1006	0.27
1007	0.25
1008	0.28
1009	0.31
1010	0.27
1011	0.26
1012	0.28
1013	0.27
1014	0.29
1015	0.28
1016	0.26
1017	0.21
1018	0.22
1019	0.2
1020	0.16
1021	0.15
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.13
1027	0.13
1028	0.15
1029	0.21
1030	0.23
1031	0.24
1032	0.27
1033	0.36
1034	0.46
1035	0.54
1036	0.58
1037	0.61
1038	0.65
1039	0.66
1040	0.66
1041	0.58
1042	0.5
1043	0.44
1044	0.42
1045	0.38
1046	0.33
1047	0.33
1048	0.26
1049	0.27
1050	0.23
1051	0.2
1052	0.16
1053	0.13
1054	0.11
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.05
1062	0.05
1063	0.05
1064	0.05
1065	0.06
1066	0.07
1067	0.07
1068	0.08
1069	0.11
1070	0.14
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.19
1074	0.2
1075	0.19
1076	0.2
1077	0.18
1078	0.17
1079	0.17
1080	0.2
1081	0.2
1082	0.23
1083	0.24
1084	0.27
1085	0.32
1086	0.34
1087	0.32
1088	0.31
1089	0.32
1090	0.3

A0A397TQY7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer