Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TDA3

Protein Details
Accession A0A397TDA3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-83LAPSNRSRAKKVPRPQNKFFLYHydrophilic
136-166VYPDYKFSPNRQNRQKRQKKIYKRSKSSGNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-165RQKRQKKIYKRSKSSGN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MSSRSFNNLETLDKETLIKTQIPLKDQYINLNNKNPKICTLINQLVNEYHDIQTSLNLMELLAPSNRSRAKKVPRPQNKFFLYRRDISKGLCKINHPMPVGESSKAASLLWKSLPKRAREFWNQASIIAKEIHSIVYPDYKFSPNRQNRQKRQKKIYKRSKSSGNSRKYRIIINSSFEKNQTSDLSDISPSISELSMTRTTSEQQVIDTQQYQILNSSSSFSIDENQTSVFHISDTSNEICEESTAQPSQLIDLSEQQQLLNLYFSEGLYQQAAPTQFDIICNAPIPAQHPRFMIMTAEPSFQPPTVYNPSYEDLVLLNQSLGSENVIDPFLLNLPYTLSFNYNYYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.23
3 0.25
4 0.25
5 0.24
6 0.21
7 0.26
8 0.3
9 0.32
10 0.36
11 0.36
12 0.4
13 0.39
14 0.46
15 0.47
16 0.52
17 0.54
18 0.59
19 0.62
20 0.6
21 0.64
22 0.57
23 0.51
24 0.49
25 0.45
26 0.42
27 0.45
28 0.47
29 0.47
30 0.46
31 0.45
32 0.4
33 0.4
34 0.36
35 0.3
36 0.23
37 0.18
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.16
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.18
53 0.24
54 0.26
55 0.31
56 0.39
57 0.48
58 0.56
59 0.66
60 0.7
61 0.76
62 0.82
63 0.83
64 0.84
65 0.79
66 0.77
67 0.72
68 0.71
69 0.65
70 0.62
71 0.6
72 0.56
73 0.52
74 0.46
75 0.51
76 0.47
77 0.47
78 0.44
79 0.41
80 0.42
81 0.46
82 0.5
83 0.42
84 0.37
85 0.32
86 0.35
87 0.35
88 0.29
89 0.24
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.12
95 0.1
96 0.13
97 0.16
98 0.21
99 0.21
100 0.28
101 0.34
102 0.37
103 0.42
104 0.45
105 0.49
106 0.52
107 0.58
108 0.56
109 0.59
110 0.54
111 0.49
112 0.45
113 0.37
114 0.31
115 0.24
116 0.19
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.16
127 0.2
128 0.21
129 0.25
130 0.35
131 0.37
132 0.47
133 0.56
134 0.65
135 0.72
136 0.82
137 0.87
138 0.86
139 0.89
140 0.89
141 0.9
142 0.9
143 0.91
144 0.91
145 0.88
146 0.84
147 0.83
148 0.79
149 0.79
150 0.77
151 0.75
152 0.71
153 0.67
154 0.67
155 0.58
156 0.55
157 0.47
158 0.44
159 0.37
160 0.34
161 0.35
162 0.32
163 0.31
164 0.28
165 0.26
166 0.2
167 0.2
168 0.17
169 0.14
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.1
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.13
191 0.12
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.1
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.13
241 0.16
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.13
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.12
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.16
274 0.23
275 0.24
276 0.26
277 0.26
278 0.28
279 0.29
280 0.29
281 0.27
282 0.19
283 0.22
284 0.21
285 0.22
286 0.2
287 0.22
288 0.23
289 0.21
290 0.21
291 0.16
292 0.22
293 0.28
294 0.29
295 0.28
296 0.3
297 0.32
298 0.32
299 0.3
300 0.24
301 0.16
302 0.17
303 0.16
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.15
325 0.15
326 0.16
327 0.17