Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SFT0

Protein Details
Accession A0A397SFT0    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-74EQALNHFKRRKIKTKDKVLNKRGVKPIHydrophilic
175-198YSIKGTRAKSKRPSHKGKHCTLLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-69KRRKIKTKDKVLNKR
181-191RAKSKRPSHKG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR025959  Winged_HTH_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13592  HTH_33  
Amino Acid Sequences MDGKIDYVPNLTGKLNLYEDKSFKSFEQDLDNTIEGLEVERETTKNIEQALNHFKRRKIKTKDKVLNKRGVKPIITDRVINLVRSYALENNTKTQQEITDHVGKELGIKISRPSITVLLKKLGITRKKLTYHYNQLNEEKARNFNEEIKPLLTELPFIALDECSFYPNLDPRFGYSIKGTRAKSKRPSHKGKHCTLLFAISNLKELKPIGKKKNILLMDNARIHLASNKRKEAGLSSVEEQMLKKDIEIKFITSYAPMLNPTELAFCLLRQQTEKDRPRGYEAMELAIKKVIELLNTKDLSKYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.25
4 0.28
5 0.31
6 0.33
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.3
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.36
15 0.33
16 0.33
17 0.35
18 0.35
19 0.27
20 0.25
21 0.22
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.07
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.12
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.28
37 0.37
38 0.41
39 0.48
40 0.5
41 0.53
42 0.6
43 0.67
44 0.71
45 0.71
46 0.75
47 0.77
48 0.84
49 0.88
50 0.89
51 0.92
52 0.89
53 0.88
54 0.83
55 0.81
56 0.77
57 0.72
58 0.62
59 0.56
60 0.57
61 0.55
62 0.51
63 0.43
64 0.36
65 0.39
66 0.39
67 0.34
68 0.26
69 0.18
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.14
74 0.17
75 0.21
76 0.22
77 0.25
78 0.28
79 0.27
80 0.26
81 0.23
82 0.22
83 0.2
84 0.22
85 0.24
86 0.27
87 0.27
88 0.26
89 0.26
90 0.23
91 0.22
92 0.22
93 0.19
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.18
102 0.22
103 0.25
104 0.26
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.26
109 0.3
110 0.3
111 0.32
112 0.35
113 0.4
114 0.43
115 0.47
116 0.48
117 0.48
118 0.53
119 0.55
120 0.56
121 0.52
122 0.5
123 0.51
124 0.47
125 0.41
126 0.33
127 0.29
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.26
132 0.28
133 0.27
134 0.26
135 0.23
136 0.21
137 0.19
138 0.19
139 0.12
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.17
163 0.21
164 0.24
165 0.3
166 0.29
167 0.35
168 0.4
169 0.47
170 0.55
171 0.6
172 0.66
173 0.7
174 0.8
175 0.81
176 0.86
177 0.86
178 0.81
179 0.81
180 0.7
181 0.63
182 0.53
183 0.47
184 0.37
185 0.3
186 0.28
187 0.18
188 0.21
189 0.19
190 0.18
191 0.15
192 0.15
193 0.2
194 0.26
195 0.35
196 0.41
197 0.48
198 0.51
199 0.53
200 0.61
201 0.58
202 0.5
203 0.48
204 0.46
205 0.45
206 0.44
207 0.41
208 0.33
209 0.29
210 0.28
211 0.27
212 0.29
213 0.31
214 0.36
215 0.4
216 0.41
217 0.41
218 0.42
219 0.39
220 0.36
221 0.31
222 0.28
223 0.26
224 0.28
225 0.28
226 0.27
227 0.24
228 0.2
229 0.19
230 0.16
231 0.14
232 0.19
233 0.19
234 0.24
235 0.26
236 0.26
237 0.25
238 0.25
239 0.26
240 0.19
241 0.19
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.11
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.28
259 0.35
260 0.45
261 0.54
262 0.55
263 0.59
264 0.6
265 0.65
266 0.63
267 0.56
268 0.53
269 0.46
270 0.43
271 0.41
272 0.38
273 0.32
274 0.31
275 0.27
276 0.19
277 0.22
278 0.18
279 0.18
280 0.21
281 0.26
282 0.32
283 0.33
284 0.34