Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TCD3

Protein Details
Accession A0A397TCD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-346PALNTDTPKQQPKRRTKPTTPRKNSRQETVLHydrophilic
354-381IYLLYNIFFKKKKKKKNYSFSQYLNLKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-369KKKKKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11.833, mito 6, cyto_mito 5.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MANLNPTAYANGGITIPNGLVGMPNNPRGITPMHLAMAPPSINPIGFPTMLPSNMNSQSRNQVPYLRQPTGKSILRVFLFGEYLTGENQNKKDIGYWRRIVSEFFSEEGRMIYGLCDENGGSRNFDIPNPVISRFFQVNYESGVTSIQLTMNNIKENFSIANYIYNSTVEAKASLIYNYEDGSRVVASGRLKVRLNQFLKIDCFEFNTEKYMEYVPRQQTMISESPIGSLGIPMKTLRCLELAEGVVTLHDVIEKSISSNKGPSPPEPPAKTPKEKAENTNPEQQYNNTDVAVPSPSTSNANIKDSPSFKSAVKSPALNTDTPKQQPKRRTKPTTPRKNSRQETVLSLYHQIYIYLLYNIFFKKKKKKKNYSFSQYLNLKSTLVLIQRNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.08
8 0.09
9 0.15
10 0.18
11 0.22
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.25
16 0.27
17 0.24
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.22
25 0.19
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.16
33 0.16
34 0.16
35 0.17
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.19
40 0.22
41 0.28
42 0.31
43 0.29
44 0.29
45 0.36
46 0.4
47 0.42
48 0.37
49 0.38
50 0.39
51 0.48
52 0.52
53 0.49
54 0.48
55 0.47
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.46
60 0.4
61 0.41
62 0.39
63 0.37
64 0.32
65 0.25
66 0.21
67 0.17
68 0.15
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.14
73 0.15
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.27
80 0.31
81 0.35
82 0.39
83 0.42
84 0.42
85 0.45
86 0.45
87 0.41
88 0.36
89 0.35
90 0.27
91 0.24
92 0.22
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.14
97 0.09
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.09
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.15
115 0.19
116 0.2
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.23
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.09
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.12
146 0.12
147 0.09
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.09
174 0.09
175 0.13
176 0.15
177 0.18
178 0.18
179 0.22
180 0.27
181 0.33
182 0.34
183 0.32
184 0.32
185 0.31
186 0.32
187 0.3
188 0.26
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.22
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.21
206 0.2
207 0.24
208 0.24
209 0.17
210 0.16
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.07
243 0.11
244 0.13
245 0.13
246 0.16
247 0.19
248 0.25
249 0.27
250 0.28
251 0.3
252 0.35
253 0.43
254 0.43
255 0.45
256 0.48
257 0.53
258 0.58
259 0.57
260 0.59
261 0.6
262 0.61
263 0.64
264 0.65
265 0.67
266 0.65
267 0.7
268 0.62
269 0.54
270 0.52
271 0.46
272 0.39
273 0.33
274 0.3
275 0.2
276 0.2
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.2
287 0.22
288 0.26
289 0.27
290 0.28
291 0.33
292 0.32
293 0.34
294 0.3
295 0.29
296 0.25
297 0.28
298 0.31
299 0.31
300 0.32
301 0.31
302 0.3
303 0.37
304 0.39
305 0.37
306 0.36
307 0.37
308 0.41
309 0.45
310 0.54
311 0.53
312 0.57
313 0.66
314 0.73
315 0.78
316 0.81
317 0.85
318 0.87
319 0.9
320 0.93
321 0.94
322 0.93
323 0.93
324 0.92
325 0.93
326 0.88
327 0.85
328 0.79
329 0.71
330 0.67
331 0.61
332 0.54
333 0.45
334 0.43
335 0.35
336 0.32
337 0.29
338 0.23
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.14
343 0.14
344 0.12
345 0.15
346 0.18
347 0.24
348 0.27
349 0.35
350 0.44
351 0.54
352 0.65
353 0.73
354 0.82
355 0.87
356 0.93
357 0.95
358 0.94
359 0.93
360 0.87
361 0.86
362 0.8
363 0.74
364 0.67
365 0.57
366 0.47
367 0.38
368 0.35
369 0.3
370 0.29