FuNGI

A0A397TH58

Protein Details

Accession

A0A397TH58

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-43	MSSSLEQKSLRKPKRKTNNDSGVQRRKPNKLTTKQKLVKQSLE	Hydrophilic
365-387	DTSLRSPPEKQARKKKRVVLEMS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-30	RKPKRKTNNDSGVQRRKPNK
375-380	QARKKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039693 Rtr1/RPAP2 IPR007308 Rtr1/RPAP2_dom IPR038534 Rtr1/RPAP2_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0017018 F:myosin phosphatase activity GO:0043175 F:RNA polymerase core enzyme binding GO:0008420 F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity
Pfam	View protein in Pfam PF04181 RPAP2_Rtr1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51479 ZF_RTR1

Amino Acid Sequences

MSSSLEQKSLRKPKRKTNNDSGVQRRKPNKLTTKQKLVKQSLETRKKFEQLSLVWQEKLFEPINIDILRESAKYLLPQHYFEIVEERNADNLCGYPICNKERQKIQGQFRISNRSRKIYDVTELKCYCSTVCFTSSKFFATQLSEEPIYMRKLENWKAVNVIPLGVDLREIIKKENSVRKSQNKEDIKSHYVKEMLANLPPAPPGLIIKEKDDKEIEVPSAPTSTNDANAHDAIEGFRINFQKLSISDIDNKPSTLVLSKEKQIIEDNAPKTPKTDEEAYEMAMSLANSMFRNGKFHYKDSEENENVPVNIISESTSVKTTDLMKKIRKNEELSSKQLFQSTFIENKGPSDDYSSKSFQPTNDADTSLRSPPEKQARKKKRVVLEMSLFGKIWTAIDRMSTSNTRQYFKSINRQFKNANGPTIWRKPITDENMLMRIQIFSEKIIECFHILRKPLAITTSIERELIDLMSTFTFDTTTVVLNDRENNVLCMVFLYALSMDIPELYRDIFPEKSPDAECQFKTVLESMNLTMEELNVFIKVLRVGPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.9
3	0.89
4	0.89
5	0.89
6	0.89
7	0.9
8	0.9
9	0.9
10	0.86
11	0.86
12	0.83
13	0.82
14	0.8
15	0.81
16	0.81
17	0.81
18	0.85
19	0.85
20	0.88
21	0.86
22	0.85
23	0.85
24	0.81
25	0.78
26	0.75
27	0.76
28	0.75
29	0.79
30	0.76
31	0.72
32	0.71
33	0.69
34	0.62
35	0.56
36	0.53
37	0.45
38	0.51
39	0.53
40	0.5
41	0.45
42	0.44
43	0.41
44	0.34
45	0.36
46	0.27
47	0.19
48	0.19
49	0.19
50	0.25
51	0.23
52	0.23
53	0.18
54	0.18
55	0.19
56	0.16
57	0.16
58	0.12
59	0.13
60	0.16
61	0.21
62	0.28
63	0.29
64	0.3
65	0.32
66	0.34
67	0.33
68	0.3
69	0.31
70	0.24
71	0.24
72	0.24
73	0.22
74	0.22
75	0.22
76	0.21
77	0.15
78	0.15
79	0.14
80	0.12
81	0.13
82	0.15
83	0.21
84	0.25
85	0.33
86	0.37
87	0.43
88	0.51
89	0.56
90	0.61
91	0.64
92	0.69
93	0.69
94	0.7
95	0.7
96	0.66
97	0.7
98	0.65
99	0.65
100	0.61
101	0.6
102	0.56
103	0.53
104	0.53
105	0.46
106	0.49
107	0.48
108	0.45
109	0.47
110	0.46
111	0.44
112	0.4
113	0.37
114	0.3
115	0.24
116	0.24
117	0.17
118	0.21
119	0.21
120	0.21
121	0.24
122	0.25
123	0.25
124	0.23
125	0.21
126	0.19
127	0.2
128	0.21
129	0.2
130	0.23
131	0.21
132	0.2
133	0.2
134	0.21
135	0.19
136	0.18
137	0.16
138	0.17
139	0.25
140	0.3
141	0.36
142	0.35
143	0.35
144	0.37
145	0.37
146	0.35
147	0.27
148	0.22
149	0.15
150	0.13
151	0.13
152	0.1
153	0.09
154	0.06
155	0.08
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.14
160	0.17
161	0.25
162	0.33
163	0.34
164	0.41
165	0.49
166	0.56
167	0.62
168	0.65
169	0.68
170	0.66
171	0.67
172	0.64
173	0.62
174	0.58
175	0.54
176	0.49
177	0.42
178	0.36
179	0.33
180	0.29
181	0.27
182	0.22
183	0.2
184	0.2
185	0.17
186	0.17
187	0.16
188	0.14
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.14
194	0.14
195	0.18
196	0.25
197	0.25
198	0.28
199	0.28
200	0.26
201	0.23
202	0.24
203	0.21
204	0.15
205	0.15
206	0.13
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.12
211	0.12
212	0.14
213	0.14
214	0.15
215	0.16
216	0.16
217	0.16
218	0.12
219	0.12
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.06
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.12
230	0.12
231	0.16
232	0.14
233	0.15
234	0.21
235	0.22
236	0.26
237	0.23
238	0.23
239	0.19
240	0.17
241	0.16
242	0.11
243	0.12
244	0.14
245	0.15
246	0.18
247	0.21
248	0.21
249	0.22
250	0.22
251	0.23
252	0.23
253	0.29
254	0.28
255	0.27
256	0.28
257	0.27
258	0.26
259	0.24
260	0.21
261	0.17
262	0.19
263	0.17
264	0.2
265	0.21
266	0.2
267	0.19
268	0.17
269	0.14
270	0.11
271	0.09
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.09
279	0.12
280	0.13
281	0.22
282	0.23
283	0.25
284	0.29
285	0.3
286	0.35
287	0.37
288	0.44
289	0.36
290	0.35
291	0.35
292	0.31
293	0.27
294	0.23
295	0.18
296	0.1
297	0.09
298	0.08
299	0.06
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.08
305	0.08
306	0.1
307	0.14
308	0.2
309	0.25
310	0.31
311	0.37
312	0.43
313	0.51
314	0.57
315	0.57
316	0.56
317	0.56
318	0.6
319	0.58
320	0.57
321	0.53
322	0.47
323	0.43
324	0.41
325	0.35
326	0.27
327	0.25
328	0.24
329	0.22
330	0.21
331	0.22
332	0.19
333	0.2
334	0.2
335	0.17
336	0.14
337	0.19
338	0.2
339	0.21
340	0.26
341	0.27
342	0.26
343	0.28
344	0.3
345	0.23
346	0.28
347	0.27
348	0.27
349	0.26
350	0.27
351	0.24
352	0.25
353	0.27
354	0.23
355	0.23
356	0.18
357	0.19
358	0.25
359	0.36
360	0.42
361	0.49
362	0.58
363	0.68
364	0.77
365	0.83
366	0.83
367	0.81
368	0.81
369	0.77
370	0.74
371	0.68
372	0.64
373	0.58
374	0.51
375	0.42
376	0.32
377	0.26
378	0.18
379	0.14
380	0.1
381	0.09
382	0.08
383	0.1
384	0.12
385	0.12
386	0.16
387	0.19
388	0.2
389	0.26
390	0.3
391	0.3
392	0.29
393	0.33
394	0.36
395	0.4
396	0.49
397	0.5
398	0.57
399	0.58
400	0.63
401	0.6
402	0.59
403	0.63
404	0.55
405	0.51
406	0.41
407	0.44
408	0.46
409	0.51
410	0.48
411	0.39
412	0.37
413	0.37
414	0.45
415	0.46
416	0.43
417	0.39
418	0.39
419	0.42
420	0.41
421	0.36
422	0.28
423	0.22
424	0.17
425	0.17
426	0.13
427	0.1
428	0.14
429	0.15
430	0.15
431	0.17
432	0.17
433	0.16
434	0.18
435	0.22
436	0.22
437	0.24
438	0.24
439	0.25
440	0.26
441	0.26
442	0.25
443	0.22
444	0.2
445	0.23
446	0.27
447	0.25
448	0.24
449	0.22
450	0.21
451	0.2
452	0.18
453	0.14
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.1
466	0.13
467	0.14
468	0.16
469	0.2
470	0.2
471	0.23
472	0.22
473	0.23
474	0.21
475	0.2
476	0.17
477	0.14
478	0.13
479	0.09
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.08
489	0.07
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.11
494	0.15
495	0.16
496	0.17
497	0.23
498	0.24
499	0.27
500	0.28
501	0.33
502	0.34
503	0.4
504	0.39
505	0.38
506	0.37
507	0.33
508	0.34
509	0.31
510	0.29
511	0.24
512	0.26
513	0.22
514	0.25
515	0.24
516	0.22
517	0.19
518	0.15
519	0.13
520	0.11
521	0.11
522	0.07
523	0.08
524	0.07
525	0.09
526	0.1

A0A397TH58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer