Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SJM1

Protein Details
Accession A0A397SJM1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59NNIKDKPPLAKRSKVDKDGRNLDDHydrophilic
406-445HEAKECPNKRKPKSENPYNKLYNRYKPAGHRKRPKSYADAHydrophilic
535-558ATTNNTISKRKQGKRPIKEVETSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
416-416K
429-440RYKPAGHRKRPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MGRANKRTTRSNSNTTHTENPAIKAGPTAKLSNNNNNIKDKPPLAKRSKVDKDGRNLDDDVLSAYITPSNPLTSPSLNSQAPPFDLNLSSHDVAAQNSESSISYNDNNEIPEEEMLDQDQQPNQEYLPEPIIIPQQIEIALEAKYIPGRSPPKKVEKIKTTFSTYGNLNSVRRKALKQCLYVTAVFSDKVAADNACKHEFPFIDEDGNEVIHYFKYWTEIKPPMAPETKLLIDQRTIQVIDIPLNVQAALVRAVFTRYGNIEKLTMRTTKLFQHAFITFDSPDAIQPFFNDQWSEYILLDSVRIFPITLPESACQLRKDFGLKLGGIPPNFKAKNFLPFLNDLGAKTCFVPRNPNNYRQCRYAFVNFASQELADCASERVFSYEGHELFWCTQDEKTCHVCGRPDHEAKECPNKRKPKSENPYNKLYNRYKPAGHRKRPKSYADAAARNIDTTKNTNNHNKKGSTVRTVKPSISSDGNNKHKDSPGQKSLSTDMTIEALRGELQSLITQFNGIKEEVAAIRSMVTTQQSNPKSPATTNNTISKRKQGKRPIKEVETSDSDSDRGNAMNRLSTVESTVSALSAQITKLINAVTLKQGAERTYSSSFLGGNGEEIPFGTTGSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.68
3 0.67
4 0.6
5 0.6
6 0.53
7 0.49
8 0.47
9 0.41
10 0.36
11 0.34
12 0.34
13 0.31
14 0.32
15 0.33
16 0.33
17 0.42
18 0.48
19 0.53
20 0.59
21 0.63
22 0.64
23 0.67
24 0.65
25 0.6
26 0.59
27 0.55
28 0.54
29 0.55
30 0.6
31 0.62
32 0.67
33 0.71
34 0.76
35 0.8
36 0.8
37 0.8
38 0.77
39 0.8
40 0.8
41 0.76
42 0.69
43 0.61
44 0.52
45 0.43
46 0.36
47 0.27
48 0.18
49 0.15
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.12
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.24
63 0.3
64 0.28
65 0.29
66 0.29
67 0.28
68 0.27
69 0.26
70 0.22
71 0.19
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.24
76 0.23
77 0.21
78 0.22
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.18
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.16
117 0.17
118 0.21
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.16
135 0.25
136 0.3
137 0.39
138 0.46
139 0.55
140 0.64
141 0.73
142 0.75
143 0.75
144 0.77
145 0.76
146 0.72
147 0.69
148 0.63
149 0.56
150 0.49
151 0.4
152 0.38
153 0.34
154 0.32
155 0.29
156 0.3
157 0.31
158 0.33
159 0.35
160 0.36
161 0.4
162 0.47
163 0.52
164 0.52
165 0.52
166 0.52
167 0.52
168 0.48
169 0.4
170 0.32
171 0.25
172 0.2
173 0.17
174 0.13
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.14
181 0.18
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.22
186 0.22
187 0.23
188 0.23
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.2
193 0.16
194 0.16
195 0.12
196 0.09
197 0.08
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.1
203 0.13
204 0.14
205 0.19
206 0.24
207 0.26
208 0.29
209 0.3
210 0.31
211 0.33
212 0.32
213 0.28
214 0.27
215 0.26
216 0.25
217 0.25
218 0.2
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.17
255 0.19
256 0.21
257 0.27
258 0.26
259 0.24
260 0.26
261 0.25
262 0.24
263 0.23
264 0.21
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.08
274 0.11
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.2
312 0.22
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.24
317 0.24
318 0.23
319 0.23
320 0.22
321 0.29
322 0.3
323 0.3
324 0.24
325 0.25
326 0.26
327 0.24
328 0.23
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.25
338 0.28
339 0.38
340 0.42
341 0.51
342 0.57
343 0.62
344 0.65
345 0.6
346 0.57
347 0.5
348 0.5
349 0.45
350 0.39
351 0.33
352 0.35
353 0.3
354 0.29
355 0.25
356 0.21
357 0.16
358 0.13
359 0.12
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.16
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.15
378 0.11
379 0.12
380 0.16
381 0.18
382 0.21
383 0.24
384 0.25
385 0.25
386 0.26
387 0.29
388 0.27
389 0.32
390 0.36
391 0.37
392 0.37
393 0.4
394 0.42
395 0.43
396 0.51
397 0.5
398 0.5
399 0.55
400 0.62
401 0.64
402 0.71
403 0.75
404 0.75
405 0.79
406 0.82
407 0.84
408 0.79
409 0.82
410 0.79
411 0.74
412 0.72
413 0.68
414 0.65
415 0.61
416 0.6
417 0.56
418 0.59
419 0.67
420 0.68
421 0.72
422 0.74
423 0.77
424 0.83
425 0.85
426 0.8
427 0.76
428 0.71
429 0.71
430 0.68
431 0.64
432 0.55
433 0.52
434 0.47
435 0.41
436 0.35
437 0.27
438 0.21
439 0.2
440 0.25
441 0.25
442 0.31
443 0.41
444 0.49
445 0.55
446 0.59
447 0.56
448 0.53
449 0.58
450 0.58
451 0.57
452 0.56
453 0.54
454 0.55
455 0.57
456 0.53
457 0.49
458 0.46
459 0.4
460 0.36
461 0.35
462 0.35
463 0.42
464 0.5
465 0.5
466 0.49
467 0.49
468 0.49
469 0.54
470 0.53
471 0.52
472 0.52
473 0.52
474 0.5
475 0.49
476 0.49
477 0.44
478 0.37
479 0.29
480 0.2
481 0.19
482 0.18
483 0.14
484 0.12
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.06
490 0.07
491 0.09
492 0.1
493 0.11
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.13
498 0.14
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.11
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.12
512 0.13
513 0.16
514 0.26
515 0.28
516 0.32
517 0.34
518 0.36
519 0.36
520 0.36
521 0.42
522 0.42
523 0.46
524 0.47
525 0.54
526 0.57
527 0.61
528 0.62
529 0.63
530 0.65
531 0.66
532 0.71
533 0.73
534 0.77
535 0.8
536 0.88
537 0.87
538 0.82
539 0.81
540 0.75
541 0.7
542 0.66
543 0.59
544 0.51
545 0.43
546 0.37
547 0.31
548 0.28
549 0.22
550 0.18
551 0.16
552 0.18
553 0.18
554 0.21
555 0.21
556 0.24
557 0.24
558 0.23
559 0.23
560 0.2
561 0.19
562 0.17
563 0.17
564 0.13
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.1
570 0.13
571 0.14
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.17
576 0.16
577 0.19
578 0.19
579 0.21
580 0.21
581 0.23
582 0.25
583 0.24
584 0.26
585 0.25
586 0.26
587 0.27
588 0.28
589 0.26
590 0.24
591 0.23
592 0.2
593 0.21
594 0.16
595 0.14
596 0.14
597 0.13
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.1