Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SXP7

Protein Details
Accession A0A397SXP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSPNKSNQVHRQQPHRSVKESHydrophilic
72-94PSDEQQRSTKRPRQQDQPDNSFSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSPNKSNQVHRQQPHRSVKESNVNTVLGSSSYQRAKSPVPKSLTTSQVKEITSLDKDKEIITQTYGTSSNPPSDEQQRSTKRPRQQDQPDNSFSSGNNTASSSSPPHDQEQKIASTSVTNPIVITTARRTNYCAIAPYDDVKGNAPRSKIQNLTKIFAQFSTYTGAAVRIIKKLNKGKYMCIFFLDENDLLDAIKLPITKSSKASPPVTENPNNNTAPKDYPDQPNPDSATPPQFYFRKFSDAVPVDDPSIKDDTNQRTVQVIDIPLGMKVQTIRVSLSXFGDIESIKLVTRGLFQHAFIVYASALSAQTFVTYWGTYILRXAVRVFPKFLTSEQRQLXKQFGCKLTGLPTNIQARDLHDILHATNAKSIFIPRNPISYKLLNFAYINYDSEDAKLKAMKTNYKVNGRDLFWCTENAHTCNRCGSPSHLFNDCPAKKQDSXK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.77
4 0.72
5 0.74
6 0.74
7 0.68
8 0.64
9 0.56
10 0.5
11 0.45
12 0.4
13 0.32
14 0.22
15 0.2
16 0.15
17 0.18
18 0.22
19 0.24
20 0.24
21 0.28
22 0.35
23 0.43
24 0.47
25 0.49
26 0.51
27 0.52
28 0.57
29 0.6
30 0.62
31 0.58
32 0.55
33 0.52
34 0.52
35 0.49
36 0.44
37 0.4
38 0.36
39 0.35
40 0.36
41 0.31
42 0.28
43 0.28
44 0.27
45 0.3
46 0.28
47 0.24
48 0.23
49 0.23
50 0.21
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.23
57 0.22
58 0.24
59 0.26
60 0.34
61 0.38
62 0.38
63 0.47
64 0.51
65 0.58
66 0.66
67 0.69
68 0.7
69 0.75
70 0.77
71 0.78
72 0.81
73 0.83
74 0.82
75 0.82
76 0.79
77 0.71
78 0.65
79 0.56
80 0.44
81 0.4
82 0.34
83 0.26
84 0.22
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.22
89 0.19
90 0.17
91 0.21
92 0.23
93 0.26
94 0.33
95 0.33
96 0.35
97 0.36
98 0.36
99 0.33
100 0.31
101 0.26
102 0.2
103 0.21
104 0.23
105 0.2
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.14
113 0.19
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.27
118 0.3
119 0.29
120 0.27
121 0.23
122 0.24
123 0.25
124 0.23
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.21
130 0.23
131 0.25
132 0.25
133 0.27
134 0.31
135 0.35
136 0.4
137 0.41
138 0.45
139 0.45
140 0.46
141 0.44
142 0.41
143 0.36
144 0.29
145 0.27
146 0.19
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.18
158 0.2
159 0.27
160 0.35
161 0.39
162 0.44
163 0.44
164 0.46
165 0.5
166 0.52
167 0.45
168 0.39
169 0.35
170 0.27
171 0.27
172 0.24
173 0.17
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.04
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.11
185 0.14
186 0.16
187 0.18
188 0.21
189 0.25
190 0.3
191 0.32
192 0.29
193 0.32
194 0.36
195 0.4
196 0.42
197 0.39
198 0.38
199 0.41
200 0.4
201 0.34
202 0.3
203 0.25
204 0.22
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.25
209 0.29
210 0.33
211 0.32
212 0.34
213 0.34
214 0.31
215 0.28
216 0.25
217 0.26
218 0.21
219 0.21
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.24
226 0.25
227 0.24
228 0.29
229 0.29
230 0.3
231 0.28
232 0.27
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.16
237 0.16
238 0.13
239 0.13
240 0.19
241 0.23
242 0.28
243 0.28
244 0.26
245 0.25
246 0.26
247 0.25
248 0.21
249 0.17
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.13
265 0.14
266 0.12
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.09
278 0.1
279 0.14
280 0.15
281 0.15
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.15
286 0.15
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.13
305 0.13
306 0.15
307 0.16
308 0.18
309 0.23
310 0.24
311 0.26
312 0.23
313 0.26
314 0.24
315 0.27
316 0.32
317 0.3
318 0.38
319 0.43
320 0.49
321 0.47
322 0.49
323 0.5
324 0.5
325 0.5
326 0.45
327 0.41
328 0.36
329 0.35
330 0.37
331 0.38
332 0.32
333 0.3
334 0.32
335 0.35
336 0.35
337 0.35
338 0.31
339 0.28
340 0.32
341 0.3
342 0.24
343 0.19
344 0.2
345 0.18
346 0.25
347 0.24
348 0.18
349 0.22
350 0.21
351 0.2
352 0.2
353 0.24
354 0.24
355 0.24
356 0.32
357 0.3
358 0.38
359 0.4
360 0.43
361 0.44
362 0.43
363 0.42
364 0.39
365 0.39
366 0.33
367 0.31
368 0.29
369 0.29
370 0.24
371 0.23
372 0.2
373 0.2
374 0.18
375 0.19
376 0.24
377 0.19
378 0.2
379 0.22
380 0.22
381 0.27
382 0.33
383 0.4
384 0.39
385 0.49
386 0.54
387 0.6
388 0.62
389 0.63
390 0.63
391 0.57
392 0.59
393 0.53
394 0.49
395 0.41
396 0.41
397 0.36
398 0.36
399 0.4
400 0.36
401 0.41
402 0.39
403 0.39
404 0.43
405 0.43
406 0.38
407 0.36
408 0.39
409 0.39
410 0.44
411 0.47
412 0.45
413 0.44
414 0.47
415 0.54
416 0.5
417 0.46
418 0.44