Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S1J4

Protein Details
Accession A0A397S1J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-151RPYPKGKKPGSNKRQPREEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-145KGKKPGSNKR
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences VIPVTETIQKDDLPNSEDPREIPIPINPDTEPINLEYDDDDPCNLSQKRWYIATPVADSGLNDLTNKEIVNTVNEFFIQHFGKFFIKAIVTRPGEEVDETPRIVVYLTKKELAEELCKEKLDEFNNAQFVLRPYPKGKKPGSNKRQPREEDYRKTHDPELQILVKNIPLNTTSYEIKMAFHEAEKELVDDVFMLKPDKKGFLRARVQFKEKASVELWQDTWFTTLKGNALMVYPATFTKEQVDNRYKFAATLTGINRSVKAIDFLDMMADFQAKAIYIPRRADKTYNQLPYATLYFATQELKDAAEERTVSFNNKELKWHLWTKGIKLCNKCGATTHLEKNCSTHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.32
4 0.33
5 0.31
6 0.34
7 0.33
8 0.3
9 0.27
10 0.26
11 0.29
12 0.3
13 0.32
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.26
18 0.23
19 0.2
20 0.21
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.13
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.25
34 0.3
35 0.33
36 0.34
37 0.35
38 0.32
39 0.36
40 0.4
41 0.35
42 0.31
43 0.29
44 0.26
45 0.25
46 0.23
47 0.19
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.15
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.19
76 0.26
77 0.26
78 0.26
79 0.27
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.2
94 0.22
95 0.25
96 0.25
97 0.25
98 0.28
99 0.27
100 0.27
101 0.23
102 0.26
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.27
108 0.24
109 0.25
110 0.24
111 0.26
112 0.27
113 0.27
114 0.25
115 0.22
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.23
121 0.31
122 0.36
123 0.42
124 0.45
125 0.48
126 0.57
127 0.65
128 0.71
129 0.74
130 0.79
131 0.78
132 0.83
133 0.77
134 0.75
135 0.74
136 0.73
137 0.72
138 0.69
139 0.69
140 0.62
141 0.62
142 0.56
143 0.49
144 0.41
145 0.35
146 0.32
147 0.28
148 0.26
149 0.23
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.11
183 0.12
184 0.17
185 0.16
186 0.25
187 0.29
188 0.36
189 0.44
190 0.48
191 0.57
192 0.57
193 0.61
194 0.57
195 0.54
196 0.53
197 0.45
198 0.42
199 0.33
200 0.33
201 0.3
202 0.27
203 0.26
204 0.19
205 0.19
206 0.15
207 0.16
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.14
226 0.2
227 0.22
228 0.31
229 0.39
230 0.38
231 0.4
232 0.42
233 0.38
234 0.33
235 0.31
236 0.25
237 0.17
238 0.22
239 0.21
240 0.23
241 0.25
242 0.26
243 0.25
244 0.22
245 0.22
246 0.16
247 0.18
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.12
263 0.16
264 0.22
265 0.26
266 0.32
267 0.37
268 0.4
269 0.45
270 0.45
271 0.5
272 0.54
273 0.56
274 0.51
275 0.47
276 0.45
277 0.43
278 0.38
279 0.29
280 0.2
281 0.15
282 0.14
283 0.15
284 0.17
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.21
296 0.22
297 0.24
298 0.24
299 0.29
300 0.33
301 0.33
302 0.36
303 0.35
304 0.39
305 0.42
306 0.47
307 0.45
308 0.46
309 0.49
310 0.51
311 0.55
312 0.57
313 0.58
314 0.58
315 0.61
316 0.62
317 0.6
318 0.54
319 0.5
320 0.48
321 0.49
322 0.5
323 0.53
324 0.5
325 0.52
326 0.51