Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TDG1

Protein Details
Accession A0A397TDG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-157HNDDNNNRSRRRRKKLSNSLNSSPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-147SRRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MAKVFSQQNNQNYWPYFIKEYYYNGQHFYIVIYYLSYEEGSKVLSEFFLPTVDMVLETCNIGAKRPPNSFIIFRTFLSKYIKYIPSSNVGKISQIATSIWKAASPNLKGAFKRLELNVSSTLRNSRPTSFIMHNDDNNNRSRRRRKKLSNSLNSSPYKKPSSDRQKYPDVPLNFNIITPNDFNEVVNDNEPPQPSTLTDNLIQHEHDKVVERIVNDESSQVPERHLLEFTNSNCRPPGFTYNSPTDSLVSPSPSGMESLLNEANKIPLFGYLTETDIANLNNLQFINGYNGFMLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.39
4 0.34
5 0.35
6 0.31
7 0.35
8 0.37
9 0.41
10 0.38
11 0.37
12 0.37
13 0.33
14 0.3
15 0.26
16 0.2
17 0.14
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.15
50 0.19
51 0.26
52 0.29
53 0.31
54 0.32
55 0.36
56 0.37
57 0.36
58 0.38
59 0.33
60 0.31
61 0.34
62 0.31
63 0.31
64 0.34
65 0.31
66 0.27
67 0.33
68 0.36
69 0.33
70 0.36
71 0.34
72 0.36
73 0.38
74 0.37
75 0.33
76 0.29
77 0.28
78 0.26
79 0.24
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.14
90 0.2
91 0.19
92 0.23
93 0.26
94 0.29
95 0.29
96 0.32
97 0.32
98 0.27
99 0.29
100 0.25
101 0.25
102 0.22
103 0.25
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.22
108 0.24
109 0.22
110 0.26
111 0.25
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.27
116 0.26
117 0.29
118 0.31
119 0.31
120 0.31
121 0.32
122 0.33
123 0.31
124 0.34
125 0.34
126 0.31
127 0.38
128 0.47
129 0.54
130 0.61
131 0.69
132 0.74
133 0.81
134 0.88
135 0.9
136 0.9
137 0.87
138 0.81
139 0.77
140 0.69
141 0.63
142 0.54
143 0.48
144 0.4
145 0.34
146 0.33
147 0.37
148 0.46
149 0.49
150 0.54
151 0.55
152 0.61
153 0.62
154 0.64
155 0.61
156 0.53
157 0.48
158 0.42
159 0.41
160 0.33
161 0.3
162 0.26
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.19
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.17
191 0.17
192 0.15
193 0.13
194 0.15
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.19
201 0.19
202 0.16
203 0.17
204 0.14
205 0.17
206 0.19
207 0.17
208 0.16
209 0.19
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.23
216 0.24
217 0.31
218 0.3
219 0.3
220 0.31
221 0.31
222 0.3
223 0.29
224 0.36
225 0.33
226 0.38
227 0.42
228 0.47
229 0.49
230 0.48
231 0.44
232 0.37
233 0.3
234 0.29
235 0.25
236 0.21
237 0.19
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.15
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.17
250 0.2
251 0.18
252 0.18
253 0.14
254 0.12
255 0.14
256 0.15
257 0.19
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.13
273 0.18
274 0.18
275 0.18