Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397THM0

Protein Details
Accession A0A397THM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-104DIPVVKRARNKTKHVYNSNKELERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-39GKKRHR
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF04855  SNF5  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MITKTTSRKKFYSTYSSRLKQGNTALVLPMIRGGKKRHRGGGHGSLAEDSDDVADLFEDEARNTPPLEKRVAIGLATANGDIPVVKRARNKTKHVYNSNKELERNAEQKEILIPIKLDFDIGTHKLRDTFTWNLNEKLITPEHFAEIMCVDLDLPSSEFVSVIADTIRKQIQENEMMTDCNPPKDDSRVLINLDINVGKLSLRDRFEWDLSSDLTPEEFSKTLVSDLGIGGEFVTLIAHSIHEQLLKHKKEIKSDDSDNEHEPLKSVFRNIEDADEWCPVLEILTEEELEKIRLDKERDIRRMRRATSRSIARIRPTRTALQNGLALSPTSRMRSDLKATKLSVEELVHWRCQHCGIDGHNTPLVRKGPDGGKTLCNACGLVWLNKGELPPHRKALFKKDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.7
4 0.7
5 0.68
6 0.62
7 0.57
8 0.56
9 0.54
10 0.46
11 0.43
12 0.38
13 0.34
14 0.32
15 0.26
16 0.24
17 0.2
18 0.2
19 0.24
20 0.31
21 0.4
22 0.49
23 0.57
24 0.61
25 0.63
26 0.66
27 0.7
28 0.72
29 0.68
30 0.6
31 0.53
32 0.45
33 0.4
34 0.34
35 0.25
36 0.15
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.1
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.19
52 0.23
53 0.26
54 0.3
55 0.29
56 0.28
57 0.31
58 0.32
59 0.26
60 0.21
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.12
71 0.13
72 0.17
73 0.24
74 0.34
75 0.45
76 0.53
77 0.6
78 0.64
79 0.73
80 0.79
81 0.82
82 0.84
83 0.79
84 0.81
85 0.8
86 0.74
87 0.65
88 0.57
89 0.52
90 0.48
91 0.46
92 0.39
93 0.34
94 0.3
95 0.3
96 0.29
97 0.27
98 0.21
99 0.18
100 0.15
101 0.13
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.09
106 0.09
107 0.13
108 0.15
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.24
117 0.26
118 0.33
119 0.35
120 0.34
121 0.34
122 0.33
123 0.28
124 0.26
125 0.23
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.15
158 0.18
159 0.23
160 0.23
161 0.23
162 0.23
163 0.23
164 0.22
165 0.25
166 0.21
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.17
171 0.2
172 0.21
173 0.17
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.22
178 0.2
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.19
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.12
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.09
231 0.16
232 0.25
233 0.27
234 0.3
235 0.36
236 0.38
237 0.44
238 0.51
239 0.49
240 0.47
241 0.49
242 0.51
243 0.49
244 0.5
245 0.43
246 0.38
247 0.33
248 0.26
249 0.23
250 0.19
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.2
257 0.19
258 0.21
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.18
263 0.17
264 0.13
265 0.12
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.16
281 0.2
282 0.26
283 0.35
284 0.44
285 0.53
286 0.61
287 0.65
288 0.7
289 0.75
290 0.72
291 0.73
292 0.68
293 0.67
294 0.66
295 0.67
296 0.65
297 0.64
298 0.65
299 0.63
300 0.67
301 0.63
302 0.61
303 0.58
304 0.57
305 0.55
306 0.57
307 0.51
308 0.46
309 0.44
310 0.38
311 0.34
312 0.27
313 0.22
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.18
320 0.21
321 0.26
322 0.35
323 0.39
324 0.42
325 0.46
326 0.46
327 0.47
328 0.45
329 0.41
330 0.36
331 0.3
332 0.29
333 0.3
334 0.33
335 0.33
336 0.34
337 0.33
338 0.3
339 0.33
340 0.3
341 0.26
342 0.28
343 0.27
344 0.35
345 0.37
346 0.39
347 0.38
348 0.37
349 0.34
350 0.35
351 0.35
352 0.28
353 0.26
354 0.28
355 0.31
356 0.37
357 0.42
358 0.39
359 0.4
360 0.41
361 0.43
362 0.39
363 0.33
364 0.28
365 0.22
366 0.26
367 0.25
368 0.26
369 0.27
370 0.26
371 0.26
372 0.28
373 0.29
374 0.27
375 0.32
376 0.36
377 0.38
378 0.45
379 0.47
380 0.52
381 0.58
382 0.64