Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TCW5

Protein Details
Accession A0A397TCW5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MSRRKTSKTVKKRTPYKKHPKIENPWLLFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-20RKTSKTVKKRTPYKKHP
Subcellular Location(s) mito 15, mito_nucl 12.333, nucl 7.5, cyto_nucl 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSRRKTSKTVKKRTPYKKHPKIENPWLLFSKNYIKLLCGNNNINSKDAMKLASEEWEKMPDWHKNQWYHLSHQKKLLRKMKEIIPLLSSMSIKFIESPYNNIFIMDETSFKSMINQAKANQAADLGSNNSFPISMESHEENEENGDIEKVVNQLFEEFINFDMLVLVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.93
3 0.94
4 0.93
5 0.93
6 0.93
7 0.93
8 0.91
9 0.91
10 0.9
11 0.82
12 0.77
13 0.7
14 0.61
15 0.5
16 0.44
17 0.42
18 0.37
19 0.36
20 0.31
21 0.3
22 0.34
23 0.4
24 0.42
25 0.4
26 0.38
27 0.4
28 0.47
29 0.46
30 0.41
31 0.36
32 0.31
33 0.27
34 0.24
35 0.19
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.23
47 0.24
48 0.27
49 0.33
50 0.38
51 0.39
52 0.42
53 0.49
54 0.47
55 0.46
56 0.51
57 0.51
58 0.47
59 0.52
60 0.54
61 0.51
62 0.58
63 0.6
64 0.56
65 0.53
66 0.55
67 0.52
68 0.55
69 0.5
70 0.41
71 0.34
72 0.3
73 0.26
74 0.23
75 0.18
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.12
83 0.12
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.13
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.19
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.29
105 0.31
106 0.3
107 0.25
108 0.2
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.15
123 0.17
124 0.19
125 0.2
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.13
147 0.12
148 0.11