Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T053

Protein Details
Accession A0A397T053    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-98TQEERRKRALEEQKKRRRDLNBasic
155-176VVKKVKIKGKFREPRRKIKGSNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-95RRKRALEEQKKRRR
157-174KKVKIKGKFREPRRKIKG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
IPR024721  Snurportin-1_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF11538  Snurportin1  
CDD cd09232  Snurportin-1_C  
Amino Acid Sequences MANEKCEDKEVNNGSSISNSQKSVAEVTLITEKVKEPAATVDEVTELLSATSVSSSTGVFRQKTFKTSPLQIKGKVETQEERRKRALEEQKKRRRDLNTHARNLALFKPEDFSSEEELESDNESINNDFPIELTKPLKRSLDVDQDDNLLQEPTVVKKVKIKGKFREPRRKIKGSNPYRNQVMHAEWMQEIPSDLEKNWYVVLCPKGKRCLVISAKGKTVSRLRNGNVMNVFESVLPAGANSYKGNKTTDYCILDCIYDQTTFTYYVLDLMCWKGHPIYDCDTEFRFYWLNTKFTEIERPAANTSTYKFNPLKAHYCNQDKISFLIKNPHSFGYRPDGLLFFNKHTQYVLGDTPLCGWVGIEKVEEMFEDFIKQKKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.32
4 0.29
5 0.27
6 0.26
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.25
12 0.2
13 0.17
14 0.19
15 0.22
16 0.21
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.22
22 0.19
23 0.15
24 0.19
25 0.22
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.17
30 0.17
31 0.16
32 0.11
33 0.08
34 0.06
35 0.06
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.08
44 0.13
45 0.19
46 0.2
47 0.22
48 0.29
49 0.31
50 0.37
51 0.4
52 0.41
53 0.42
54 0.5
55 0.57
56 0.59
57 0.62
58 0.61
59 0.61
60 0.59
61 0.58
62 0.53
63 0.48
64 0.45
65 0.48
66 0.54
67 0.55
68 0.58
69 0.56
70 0.54
71 0.53
72 0.56
73 0.58
74 0.58
75 0.64
76 0.69
77 0.75
78 0.81
79 0.82
80 0.79
81 0.76
82 0.74
83 0.74
84 0.74
85 0.74
86 0.72
87 0.69
88 0.63
89 0.55
90 0.49
91 0.41
92 0.34
93 0.24
94 0.19
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.13
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.09
118 0.1
119 0.12
120 0.15
121 0.18
122 0.2
123 0.24
124 0.25
125 0.23
126 0.25
127 0.28
128 0.35
129 0.34
130 0.34
131 0.31
132 0.31
133 0.3
134 0.27
135 0.21
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.21
145 0.28
146 0.35
147 0.43
148 0.49
149 0.51
150 0.62
151 0.7
152 0.74
153 0.79
154 0.78
155 0.81
156 0.81
157 0.81
158 0.74
159 0.75
160 0.75
161 0.75
162 0.79
163 0.73
164 0.68
165 0.63
166 0.59
167 0.52
168 0.43
169 0.34
170 0.26
171 0.22
172 0.19
173 0.16
174 0.15
175 0.13
176 0.11
177 0.09
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.12
189 0.17
190 0.2
191 0.23
192 0.25
193 0.3
194 0.31
195 0.32
196 0.3
197 0.35
198 0.33
199 0.38
200 0.42
201 0.39
202 0.41
203 0.42
204 0.4
205 0.35
206 0.38
207 0.35
208 0.35
209 0.38
210 0.36
211 0.41
212 0.42
213 0.42
214 0.37
215 0.32
216 0.27
217 0.22
218 0.22
219 0.14
220 0.14
221 0.09
222 0.07
223 0.06
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.11
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.18
234 0.2
235 0.23
236 0.28
237 0.28
238 0.27
239 0.27
240 0.26
241 0.24
242 0.22
243 0.2
244 0.15
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.1
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.2
266 0.24
267 0.25
268 0.27
269 0.28
270 0.28
271 0.26
272 0.25
273 0.22
274 0.17
275 0.24
276 0.25
277 0.26
278 0.24
279 0.28
280 0.27
281 0.28
282 0.36
283 0.3
284 0.31
285 0.3
286 0.32
287 0.3
288 0.29
289 0.29
290 0.22
291 0.23
292 0.27
293 0.26
294 0.31
295 0.3
296 0.34
297 0.4
298 0.44
299 0.5
300 0.47
301 0.54
302 0.55
303 0.61
304 0.6
305 0.57
306 0.54
307 0.47
308 0.44
309 0.44
310 0.39
311 0.33
312 0.38
313 0.38
314 0.4
315 0.42
316 0.43
317 0.39
318 0.37
319 0.39
320 0.38
321 0.37
322 0.33
323 0.32
324 0.29
325 0.28
326 0.34
327 0.33
328 0.29
329 0.33
330 0.33
331 0.31
332 0.31
333 0.3
334 0.26
335 0.27
336 0.24
337 0.21
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.21
342 0.19
343 0.14
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.15
357 0.17