Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SXK6

Protein Details
Accession A0A397SXK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-139NEIRNKLIPKFRKRKRKKWNIVSFPPSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-129IRNKLIPKFRKRKRKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MSSRTCVFIESSGDPKIKGQLINTKSFIKPKFPPKIDLLGLITKQAYSDSSKSNSGRAPNAFIIYRKAFVEAARNDGYQLPMTVVSSMASQSWETEPEIVKEEYKRLAKEANEIRNKLIPKFRKRKRKKWNIVSFPPSNDSSSSSSAINKSKSEEKLENKEQPELPNELFKIPCDITSEIVDTLSTDSTADLSTNITSTNSDVQIQNVYYDLNLNNWIPQSSADTEFYNHEFFTFNTEFPYYYDDQFSCPFITFYDEISYPNTEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.3
4 0.29
5 0.28
6 0.3
7 0.35
8 0.39
9 0.45
10 0.47
11 0.46
12 0.45
13 0.51
14 0.48
15 0.46
16 0.49
17 0.53
18 0.61
19 0.59
20 0.62
21 0.59
22 0.63
23 0.57
24 0.53
25 0.46
26 0.4
27 0.37
28 0.34
29 0.29
30 0.21
31 0.2
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.17
36 0.2
37 0.23
38 0.29
39 0.3
40 0.33
41 0.35
42 0.35
43 0.37
44 0.35
45 0.37
46 0.32
47 0.34
48 0.32
49 0.29
50 0.31
51 0.27
52 0.26
53 0.21
54 0.21
55 0.19
56 0.19
57 0.26
58 0.22
59 0.26
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.25
64 0.25
65 0.17
66 0.16
67 0.11
68 0.09
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.21
91 0.23
92 0.23
93 0.21
94 0.24
95 0.23
96 0.3
97 0.36
98 0.39
99 0.42
100 0.42
101 0.42
102 0.43
103 0.43
104 0.38
105 0.39
106 0.38
107 0.43
108 0.53
109 0.6
110 0.67
111 0.75
112 0.83
113 0.86
114 0.89
115 0.89
116 0.9
117 0.92
118 0.9
119 0.88
120 0.84
121 0.74
122 0.64
123 0.56
124 0.46
125 0.36
126 0.28
127 0.23
128 0.2
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.17
133 0.19
134 0.22
135 0.21
136 0.19
137 0.2
138 0.25
139 0.26
140 0.3
141 0.34
142 0.36
143 0.43
144 0.49
145 0.52
146 0.48
147 0.5
148 0.46
149 0.41
150 0.39
151 0.34
152 0.28
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.2
157 0.18
158 0.2
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.09
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.09
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.13
206 0.13
207 0.16
208 0.17
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.24
214 0.26
215 0.22
216 0.19
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.21
221 0.2
222 0.18
223 0.2
224 0.21
225 0.21
226 0.21
227 0.26
228 0.21
229 0.21
230 0.25
231 0.23
232 0.25
233 0.26
234 0.27
235 0.23
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.21
240 0.19
241 0.19
242 0.22
243 0.21
244 0.21
245 0.24